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三角帆蚌CAT基因cDNA全长克隆及表达分析 总被引：1，自引：1，他引：0
采用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)首次克隆了三角帆蚌过氧化氢酶(CAT)基因的cDNA全长序列,为2 804 bp,包含112 bp的5′非翻译区(untranslated region,UTR),1 303 bp的3′UTR和1 388 bp的开放阅读框(open reading frame,ORF)。ORF区共编码462个氨基酸,推算的分子量约为52.7 ku,理论等电点为6.35。多序列比对结果显示,有一段CAT氨基酸高度保守的催化位点序列FDRERIPERVVHAKGAG。三角帆蚌CAT基因有12个与还原型辅酶Ⅱ(NADPH)结合的氨基酸残基,分别是Asp107、His153、Phe157、Ser160、Arg162、Asn172、Try174、Lys196、Val261、Trp262、His264和Try317,其中第261位和第264位的氨基酸在不同物种间有所区别。比对结果得到的三角帆蚌CAT基因的氨基酸序列,与软体动物的CAT基因相似性高达99%,与虾类、鱼类、两栖类、哺乳类的CAT基因相似性也达到98%~99%,可推断属于CAT3。利用CAT基因推断得到的氨基酸序列构建NJ系统树,分析显示三角帆蚌首先与软体动物聚在一起,再与虾类聚在一起,然后依次与鱼类、两栖类和哺乳类聚在一起。荧光定量结果显示,CAT基因在三角帆蚌的7个组织均有表达,其中在肾中的表达量极低,在血液中表达呈上调趋势且明显区别于其他组织,在另外5个组织中总体上呈现不统一的先上调后下调的趋势。 相似文献
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“鱼类遗传育种学”是高等农业院校水产养殖学专业一门重要的专业基础课,是研究鱼类遗传变异基本规律、鱼类育种基本原理和应用技术的一门生物科学学科,其教学内容随着科技的发展日益更新并逐渐向更深层次延伸。为适应鱼类遗传育种学的迅速发展和培养创新型人才的需要,将鱼类遗传育种学发展的科研成果渗透到教学内容中,有利于提高学生创新意识和专业兴趣,有利于增强知识点的系统性,有利于把握知识面的整体性。对于提高教学质量,培养学生的创新能力和提升科研素质有积极的推动作用。 相似文献
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对长江铜陵段捕获的0~+龄铜鱼(Coreius heterodon(Bleeker))的体长(X_1)、头长(X_2)、吻长(X_3)、体宽(X_4)、眼间距(X_5)、尾柄长(X_6)、尾柄高(X_7)、背鳍基底长(X_8)、臀鳍基底长(X_9)、体高(X_(10))等10个外部表型性状进行相关分析、回归分析及通径分析,以研究长江铜鱼各外部表型性状与体质量(Y)的关系,为铜鱼的人工育种提供选择策略。结果显示, 10个表型性状与体质量之间的相关系数均达极显著水平,其中,尾柄高、体长的相关系数最大(0.917,0.917);在通径分析中,眼间距对0~+龄铜鱼体质量的直接作用最大(0.390),体长直接作用最小(0.294);而决定系数随着多个性状的引入不断增大;尾柄高、眼间距、体长这3个性状对体质量的影响最显著,这3项指标对体质量的最优回归方程为Y=-75.808+22.072X_7+33.333X_5+2.559X_1(R~2=0.945),方程的方差分析结果显著,说明所建立的回归方程具有实际应用价值。 相似文献
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清道夫受体(SR)是一类对化学修饰的脂蛋白具有很强结合活性的糖蛋白家族。本研究通过RACE方法克隆得到三角帆蚌hcSRCR1基因cDNA序列,该序列全长1 000 bp,其中开放阅读框819 bp,编码272个氨基酸,预测分子量为28.16 ku,理论等电点为5.55;预测含有2个SRCR结构域和6个保守的半胱氨酸残基。qRT-PCR和Western blot结果显示,hcSRCR1 mRNA和蛋白表达模式基本相同,均在三角帆蚌外套膜中表达量最高,在其他组织中的表达量普遍较低,且在紫色选育系外套膜组织中的表达量显著高于白色选育系。外套膜原位杂交结果显示,hcSRCR1基因主要在外套膜外褶的内、外上皮细胞层以及腹膜处的上皮细胞层中表达。研究表明,三角帆蚌hcSRCR1基因与贝壳珍珠质颜色形成具有一定相关性,可为进一步研究该基因在珍珠颜色形成过程中的调控机理提供基础资料。 相似文献
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