小麦4B染色体上LOX基因的等位变异及其区域分布     

王黎明  孔维玮  高华利  董普辉  闫雪芳  王春平  王洪刚  李兴锋 《作物杂志》2021,37(1):32-138

为了解中国不同麦区小麦种质资源籽粒脂肪氧化酶（lipoxygenase,LOX）活性相关基因TaLox-B1的差异和分布,利用小麦4B染色体上的功能标记LOX16和LOX18对7个麦区的436份种质资源进行分子检测。结果表明：在供试材料中共检测到3种TaLox-B1基因等位变异类型,分别为TaLox-B1a（与高LOX活性相关)、TaLox-B1b（与低LOX活性相关）和杂合型,其频率分别为19.0％、70.4％和10.6％。小麦LOX活性基因不同变异类型在各生态区的分布存在明显差异：基因型TaLox-B1a在黄淮冬麦区、北部冬麦区和长江中下游冬麦区分布较多,其比例分别为21.1%、19.8%和17.6%;基因型TaLox-B1b在西南冬麦区和长江中下游冬麦区分布较多,比例分别为87.9%、72.5%;杂合型仅存在于北部冬麦区、黄淮冬麦区与长江中下游冬麦区,比例分别为14.2%、12.4%和9.8%。利用标记LOX16和LOX18对53个自选高代品系进行分子检测,发现自选品系仅有TaLox-B1b与杂合型两种基因型,其中基因型TaLox-B1ab有32个,比例为60.4%。采用分子标记辅助选择,有利于快速鉴定小麦籽粒LOX活性,加速LOX的遗传改良和新品种选育。  相似文献   

正交设计优化青蒿SRAP-PCR反应体系及引物筛选     

石紫薇  梁妍  姜婷婷  梁剑平  贾宁  辛志君  陆锡宏  周翔  李雪虎 《分子植物育种》2020,(10):3303-3310

为了建立青蒿的SRAP最佳扩增体系,并筛选出SRAP多态性引物,本研究以青蒿叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg^2+、dNTP Mix、Taq DNA聚合酶、引物和DNA模板5种因素5个水平,对青蒿SRAP反应体系进行研究。结果表明,青蒿SRAP-PCR最佳反应体系为:引物0.6μmol/L、Mg^2+2.0 mmol/L、模板DNA 5.1 ng、Taq DNA聚合酶2.0 U、dNTPs 0.25 mmol/L,总体积为25μL。各因素对扩增反应均有不同影响,其中引物浓度的影响最大,dNTPs的影响最小。运用该体系对不同种质资源的青蒿进行验证,证明该体系稳定可靠,并在30个引物组合中筛选出了25对扩增条带清晰,多态性丰富的引物组合。这一结论为今后利用SRAP标记技术进行青蒿分子遗传学研究提供了科学依据。  相似文献   

紫花槭秋季叶色表达转录组初步分析     

张佳奇  赵东辉  高玉福  荣立苹  李佳霖  翁卓 《分子植物育种》2021,19(21):7075-7083

为了丰富紫花槭转录组数据,进一步开展紫花槭秋季叶片呈色机制研究.本研究以紫花槭秋季转色期三个阶段(前期,中期,后期)叶片为材料,采用高通量测序技术进行转录组初步分析.转录组数据共获得50501条Unigene,有35316条Unigene在数据库中得到注释,其中NR数据库中注释到的Unigene数量最多,共35024条,占69.4％.在注释到的物种中,紫花槭比对的Unigene与甜橙(Citrus sinensis)相似度最高,共有4290条,占12.25％.紫花槭转录组中的Unigene根据GO功能可分为生物学过程、细胞组分和分子功能3大类,共有25375条,其中生物学过程的基因最多,主要聚集于代谢过程和细胞过程等.基于Unigene库的基因结构分析,其中SSR分析共获得12711个SSR标记,占Unigene总数的36％.SSR位点共包含150种重复基元,单碱基重复所占比例最高(7184个,61.86％),四碱基重复、五碱基重复和六碱基重复所占比例较低.Unigene库中共有328239个SNP位点,发生频率为1/190 bp,SNP位点分为转换和颠换两种类型的碱基替换方式,其中碱基转换位点213787个(65.13％),碱基颠换位点114452个(34.87％),碱基转换类型发生频率高于颠换类型.6种单碱基变异中,2种转换类型A/G、C/T的发生频率分别为33.03％和32.10％;4种颠换类型中A/T发生频率最高,为11.52％;C/G发生频率最低,为5.79％.紫花槭转录组秋季叶色表达的转录组分析,可为紫花槭叶色基因调控、定向分子育种和培育彩叶新品种提供研究提供基础的数据信息.  相似文献   

矮牡丹与芍药属其他5个种叶绿体基因组特征的比较     

周晓君  张凯  彭正锋  孙姗姗  押辉远  张延召  程彦伟 《林业科学》2020,56(4)

【目的】中国特有的野生牡丹一直被国内外视为珍贵的种质资源。野生矮牡丹被认为是现代栽培牡丹品种重要的祖先种之一,开展矮牡丹在内的芍药属植物叶绿体基因组(cp DNA)特征分析对阐明牡丹系统进化、培育和改良栽培品种具有重要的理论与实践价值。【方法】在矮牡丹叶绿体高通量测序的基础上,从NCBI数据库下载凤丹牡丹、大花黄牡丹、滇牡丹、川赤芍和草芍药的cp DNA数据,利用Geneious 8. 0、EMBOSS 6. 4. 0等软件,对芍药属6个种的cp DNA进行对比分析。【结果】矮牡丹cp DNA序列共152 628 bp,共有112个基因,使用25 988个密码子,编码蛋白78个;有19个基因(包括4个rRNA、7个tRNA、8个蛋白编码基因)在IR(反向重复)区重复。共搜索到143个SSR位点,单核苷酸重复基序位点最多,为116个(占81. 12%),没有六核苷酸重复基序。尽管芍药属叶绿体基因组比较保守,但不同种间IR和LSC(大单拷贝区)的边界位置仍有一定变化,凤丹牡丹LSC/IR的rpl2基因有718 bp延伸至LSC区域,而其他种的rpl2基因均完整地位于IR区。【结论】从基因组大小和基因内容来看,芍药属cp DNA高度保守;草芍药与滇牡丹cp DNA最大,为152 698 bp;凤丹牡丹cp DNA最小,为152 153bp。矮牡丹cp DNA蛋白编码基因密码子偏好使用A/T碱基,SSRs位点的碱基组成也偏好使用A/T碱基,143个SSRs位点中,A/T组成的位点有134个;矮牡丹cp DNA SSRs分布具有不均匀性,14个SSR位点位于IR区段,103个位于LSC区段,26个位于SSC区段。IR边界分析显示,芍药属LSC/IRb的边界变化是IR区扩张与收缩的主要原因。研究结果为芍药属植物的系统进化与栽培起源等研究提供支持,对芍药属植物分子标记开发及优良品种选育具有参考价值。  相似文献   

基于完全型SSR标记的西番莲(Passiflora edulis)遗传多样性分析     

吴艳艳  田青兰  刘洁云  黄伟华  黄永才  杨行海  夏秀忠  牟海飞 《分子植物育种》2019,17(24):8178-8183

  相似文献   

微卫星标记及其在遗传育种中的应用   总被引：9，自引：0，他引：9  

张纪刚  朱文进  王曦  周忠孝 《养猪》2001,(2):34-35

微卫星是近年来常用的一种检测基因组DNA多态性的新型DNA标记，因其数量分布广，多态性丰富及检测快速方便等优点而备受青睐，本文就微卫星结构，践态性产生原理和微卫星的应用作一简明介绍。  相似文献   

三河马血液遗传标记的研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

王振山  郭永新等 《内蒙古畜牧科学》2001,22(2):1-3

采用聚丙烯酰胺凝胶电泳对25匹三河马血清中白蛋白（ALB）、酯酶（Es)、α1-B糖蛋白（A1B）和维生素D结合蛋白（GC）进行了检测，结果发现：在4个位点中，白蛋白（ALB）和酯酶（Es)位点呈现多态性，其中在白蛋白（ALB）位点发现3个基因型，即AA、AB和BB，由等位基因ALB^A和ALB^B控制，其基因频率分别为0．40和0．60；在酯酶（Es)位点发现4个基因型，即FF、II、FI和IS，由等位基因Es^f,Es^I和Es^S控制，其基因频率分别为0．40，0．56和0．04，而α1-B糖蛋白（A1B）、维生素D结合蛋白（GC）2个位点均呈现单态性。  相似文献   

绵羊QTL定位的研究进展   总被引：12，自引：0，他引：12  

赵俊丽  吴登俊 《四川畜牧兽医》2001,28(10):29-30

本文综述了绵羊的重要经济性状QTL定位的方法和进展，并提出存在问题和展望。  相似文献   

鸡的微卫星DNA标记与胴体性状的相关分析   总被引：4，自引：1，他引：3  

陈晖  郑丽祯  陈岩锋  郑嫩珠  缪中纬  陈宽维  汤青萍 《中国家禽》2004,8(Z1):137-140

测定了青脚麻鸡与隐性白鸡杂交后自交的F2代个体的全净堂重、全净堂率、脂肪宽带、腹脂重和腹脂率6个胴体性状,检测10个微卫星DNA标记,对标记基因型胴体性状值进行方差分析和多重比较,结果表明:MCW328对于10周龄体重和全净膛重两性状各基因型均有显著的差异(P<0.05);ADL292对于腹脂重性状各基因型有极显著的差异(P<0.01),对于腹脂率有显著的差异(P<0.05)。MCW328标记基因与控制10周龄体重和全净膛重QTL连锁,ADL292标记基因与控制腹脂重和腹脂率QTL连锁。  相似文献   

家禽遗传资源评价研究及应用进展   总被引：2，自引：0，他引：2  

王秋丽耿社民  杨长锁杨公社 严华祥 《动物科学与动物医学》2004,21(2):42-43

本文论述了我国家禽遗传资源的现状、评价方法以及各种遗传资源评价方法的研究进展。  相似文献