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猪食道口线虫ITS-1和lTS-2 rDNA的PCR-SSCP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
以采自我国不同地区猪体的食道口线虫虫株为研究对象,PCR扩增出ITS-1和ITS-2序列片段,然后采用单链构象多态性(SSCP)方法分析PCR产物,对不同地区食道口线虫进行分子鉴定。所有样品经SSCP分析显示两种带型,第一种为有齿食道口线虫带型,另一种为未定种食道口线虫带型。代表性样品的测序结果表明,未定种食道口线虫带型的样品为四棘食道口线虫。本研究在国际上首次报道了中国猪四棘食道口线虫的ITS序列,并建立了区分有齿食道口线虫和四棘食道口线虫的PCR-SSCP方法,从而为食道口线虫的分子生物学的进一步研究奠定了基础。 相似文献
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片形吸虫第一内转录间隔区DNA多态性的研究 总被引：9，自引：0，他引：9
以不同地区的片形吸虫虫株为研究对象，经PCR扩增出了ITS-1部分基因片段，采用单链构象多态性(SSCP)方法，并结合序列分析研究了不同地区片形吸虫ITS-1 DNA的多态性。不同地区的样品经SSCP分析，显示3种带型，第1种为大片形吸虫的带型，第2种为肝片形吸虫的带型，第3种为2种带形的混合带型。广西区样品和大部分贵州省样品属于大片形吸虫带型；四川省、黑龙江省和部分贵州省样品为混合带型；南京市和甘肃省样品为肝片形吸虫带型或混合带型。测序结果表明，根据ITS-1基因的序列变异位点可区分2种片形吸虫；表现为混合带型的样品在变异位点具有多态性。本研究结果显示，ITS-1片段可作为遗传标记用以区分大片形吸虫和肝片形吸虫，同时也证实，在我国除了这2种片形吸虫外，还可能存在着“中间型”的片形吸虫。 相似文献
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以采自我国不同地区的片形吸虫虫体为研究对象，PCR扩增出核糖体DNA (rDNA)的第一内转录间隔区(ITS-1)序列，然后采用非同位素的单链构象多态性(Cold-SSCP)方法分析PCR产物，对不同地区片形吸虫进行分子鉴定。所有样品经Cold-SSCP分析显示2种带型。样品测序及序列分析结果表明，第1种为肝片形吸虫带型，另1种为大片形吸虫带型。本研究建立了区分大片形吸虫和肝片形吸虫的Cold SSCP方法，可用于这2种吸虫的分子流行病学调查，从而为片形吸虫分子生物学的进一步研究奠定了基础。 相似文献
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《畜牧兽医科技信息》2020,(8)
正食道口线虫病是由毛线科的食道口线虫引起的。寄生在猪体内的食道口线虫,目前发现的有三种,即有齿食道口线虫、长尾食道口线虫、熊氏食道口线虫。由于食道口线虫寄生在猪的大肠里,它们的幼虫寄生在大肠肠壁里,使肠壁发生结节病变。因此,本病也称为结节虫病。1病原1.1有齿食道口线虫头囊膨大,无侧翼膜,食道漏斗小,颈乳突位于食道膨大部的两侧。口囊浅,囊壁平直。雄虫体长8～9mm,交合刺长1.0～1.14mm。雌虫体长8～11.3mm,阴门在肛门前方0.208～0.388mm,阴唇稍隆起,阴唇向前,长0.10～0.15mm。 相似文献
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蛇四棘食道口线虫线粒体cox1 基因的克隆及序列分析 总被引：1，自引：1，他引：0
本研究旨在分析长沙市四棘食道口线虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第Ⅰ亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况。应用聚合酶链反应(PCR)扩增四棘食道口线虫虫株的pcox1,应用Clustal X 1.83程序对序列进行比对,同时利用DNAStar 5.0中的MegAlign程序进行同源性分析,并与GenBankTM中已知四棘食道口线虫相应基因序列进行比较分析。所得pcox1序列长度一致,均为393 bp,与GenBank公布的线虫相关序列进行比较分析结果表明,各个分离株与已知四棘食道口线虫相应基因的相似性分别在98%以上,与其它科线虫的相似性均小于91%。四棘食道口线虫pcox1序列种内相对保守,种间差异明显。本研究为进一步研究四棘食道口线虫的群体遗传学奠定了基础。 相似文献
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为鉴定绵阳地区山羊粪便中疑似血矛属线虫虫卵的虫种,本研究提取绵阳地区三个县山羊粪便中疑似血矛属线虫的虫卵DNA 60份,采用PCR技术扩增其核糖体第二内转录间隔区(rDNA ITS-2)基因序列,并与GenBank上公布的捻转血矛线虫同源序列进行比较分析。结果显示:60份疑似血矛属线虫的虫卵DNA样品均得到191bp的ITS-2片段;60条ITS-2序列共形成15条不同的序列,含有17个单变异位点,与GenBank中多株捻转血矛线虫的同源性达95.8%~100%;ML系统发育树显示,本研究得到的15种类型ITS-2序列与已报道的捻转血矛线虫(Haemonchus contortus)聚类形成一个分支。综上可得,60份来自山羊的血矛属线虫均为捻转血矛线虫。 相似文献
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PCR-SSCP对我国鲁道夫对盲囊线虫的分子鉴定 总被引：1，自引：0，他引：1
对来自青海湖的鲁道夫对盲囊线虫（Contracaecum rudolphii）核糖体DNA第一、第二内转录间隔区（ITS-1、ITS-2）进行PCR扩增、DNA单链构象多态性（SSCP）分析及序列分析。并与来自欧洲的2个姊妹种鲁道夫对盲囊线虫进行了比较。结果显示，我国青海湖的鲁道夫对盲囊线虫与来自意大利的（.rudolphii B具有一样的SSCP带型及ITS序列，但不同于C．rudolphiiA．因此属于C.rudolphii B。本试验证实了ITS片段可作为遗传标记用于鉴别鲁道夫对盲囊线虫的姊妹种，从而为鲁道夫对盲囊线虫的进一步研究奠定了基础。 相似文献
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猪消化道寄生虫病是影响猪生产过程的一类重要疫病，其种类较多，常见的包括布氏姜片吸虫、猪蛔虫、食道口科食道口属的猪食道口线虫、猪毛首线虫、蛭形巨吻棘头虫、结肠小袋虫和猪球虫等引起的寄生虫病。 相似文献
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10株巨型艾美球虫rDNA-ITS-1部分序列测定与分析 总被引：1，自引：0，他引：1
用一对种特异性引物,对国内10株巨型艾美球虫ITS．1区进行PCR扩增,对扩增产物纯化、测序与分析,并用DNAStar软件对所检测的10株巨型艾美球虫与GenBank中的所有巨型艾美球虫的ITS．1相应序列进行系统发生进化关系分析。结果显示,扬州株、龙岩株和福州株的ITS-1部分序列片段长度为152bp,其余各株均为151bp。10株巨型艾美球虫的同源性为90．7％～100％,在构建的系统发生进化树中分成2大系群,凤阳株形成一个单系群,其余9株为另一系群。虫株间的亲缘关系与地理位置不尽一致,与免疫交叉保护力无相关性。 相似文献
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鸡赖利氏绦虫病是由四角赖利氏绦虫(Raillietina tetragona)、棘沟赖利氏绦虫(Raillietina echinobothrida)和有轮赖利氏绦虫(Raillietina cesticillus)寄生于鸡的小肠所引起的一类疾病。该病呈全球性分布,严重阻碍了养禽业的发展。本研究通过PCR扩增来自湖南省的10条四角赖利氏绦虫的核糖体DNA第一内转录间隔区(first internal transcribed spacers,ITS-1) ITS-1 rDNA,阳性产物经纯化、测序,最后获得1 268 bp的ITS-1序列,对所获得的序列进行分析。结果表明:四角赖利氏绦虫ITS-1的种内差异为0%～0.1%,种间差异为25. 22%～26.48%,说明ITS-1相对保守,可作为研究种间遗传变异的标记。 相似文献
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安氏隐孢子虫ITS-1序列的PCR扩增、克隆及分析 总被引：1，自引：0，他引：1
通过对国内三株安氏隐孢子虫(Cryptosporidium andersoni)即GD株、HN株和AH株的rDNA的内转录间隔区Ⅰ(ITS_1)序列进行PCR扩增、克隆、测序和序列分析,旨在确定ITS_1是否可作为C.andersoni分子分类的遗传标记。结果表明:GD株、HN株和AH株的ITS_1序列基本一致,仅AH株有三个碱基的差异;但与GenBank注册的C.muris和C.parvum存在种间差异,而且差异显著。说明ITS_1可作为C.andersoni种的遗传标记,从而为隐孢子虫属的种间鉴定以及进一步的分子流行病学调查和分子诊断学研究奠定了基础。 相似文献
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基于ITS-1基因序列的隐孢子虫种群分类 总被引：2，自引：0，他引：2
本试验以内转录间隔区1(ITS-1)基因作为研究对象,用PCR技术分别对广东(GD)禽源、广东(GD)和安徽(AH)牛源3个隐孢子虫分离株ITS-1基因进行扩增、克隆、序列测定和分析.将扩增序列用DNAStar(4.0)和ClustalX1.81软件与GenBank上登录的参考序列比对,用Phylip3.67构建种群发育进化树,以确定分离株与其他隐孢子虫虫种之间的亲缘关系.通过对ITS-1基因全序列分析,结果表明:禽源隐孢子虫GD分离株为Cryptosporidium baileyi,牛源隐孢子虫GD分离株和AH分离株均为C.andersoni.因此,ITS-1基因可作为隐孢子虫分离株种群分类的遗传标记,从而为隐孢子虫属的种间鉴定以及进一步的分子流行病学调查和分子诊断学研究奠定了基础. 相似文献
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从河北省兔场分别单卵囊分离孢子化大型艾美耳球虫卵囊、黄艾美耳球虫卵囊及肠艾美耳球虫卵囊,接种无球虫兔后获得纯种卵囊,CTAB法提取孢子化卵囊基因组DNA。利用艾美耳属球虫18SrDNA和5．8SrDNA保守引物,PCR扩增3种兔球虫ITS-1片段,产物纯化后测序。将3种球虫ITS-1测序结果与GenBank发布的兔球虫ITS-1序列进行比对和遗传距离比较,绘制系统发育树。结果表明,大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾美耳球虫河北株分别扩增出424、455、434bp的ITS-1片段。大型艾美耳球虫、黄艾美耳球虫及肠艾关耳球虫河北株与GenBank中发布的同种兔球虫ITS-1序列相似性分别为97．4％、97．9％和96．9％。系统发育树显示兔球虫ITS-1序列形成1个单系群,该单系群根据寄生部位分为2个姊妹群。 相似文献
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利用核糖体DNA内转录间隔区1(ITS-1)序列对兔艾美耳球虫进行系统进化分析,并探讨生物学和形态学特征在兔球虫进化中的意义。单卵囊分离大型、黄、肠、中型及穿孔艾美耳球虫卵囊,接种无球虫兔获得纯种卵囊,CTAB法提取卵囊基因组DNA,PCR扩增ITS-1区后克隆、测序。将测序结果与GenBank发布的兔球虫ITS-1序列进行比对和遗传距离分析,绘制系统进化树。结果显示:大型、黄、肠、中型及穿孔艾美耳球虫河北株ITS-1序列分别长320、330、351、336和341bp。5种兔球虫河北株与GenBank中同种兔球虫ITS-1序列相似性分别为96.9%、97.3%、96.9%、99.1%和99.4%。兔球虫形成单系群,该单系群分为2个姐妹谱,与卵囊残体有无相对应,其它形态学和生物学特征与系统进化无相关性。研究结果表明外残体的有无可作为兔球虫进化分类的特征。 相似文献
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根据OenBank上已发表的环孢子虫（Cyclospora）rDNA序列设计并合成1对引物，利用PCR技术时首次在牛体内发现的形态学特征与人环孢子虫（Cyclospora cayetanensis）极为相似的牛源环孢子虫的ITS-1＋序列进行了扩增。将PCR扩增出的片段纯化后，克隆至pGEM—TEasy载体后进行序列测定，并利用NCBI在线BLAST程序对测序结果进行了同源性比较和序列分析。分析结果显示，扩增的ITS-1＋大小为865bp的片段，包含18S部分序列（371bp）、ITS-1全序列（385bp）和5．8S部分序列（109bp）。序列同源性分析表明，该牛源环抱子虫为艾美尔科原虫，但不同于目前已知的各种艾美尔科原虫，可能是一种新发现的原虫。 相似文献
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Characterisation of Fasciola species from Mainland China by ITS-2 ribosomal DNA sequence 总被引：5，自引：0，他引：5
Isolates of Fasciola (Platyhelminthes: Trematoda: Digenea) from different host species and geographical locations in Mainland China were characterised genetically. The second internal transcribed spacer (ITS-2) of nuclear ribosomal DNA (rDNA) was amplified from individual trematodes by polymerase chain reaction (PCR), and the representative amplicons were cloned and sequenced. The length of the ITS-2 sequences was 361-362bp for all Chinese Fasciola specimens sequenced. While there was no variation in length or composition of the ITS-2 sequences among multiple specimens from France, Sichuan and Guangxi, sequence difference of 1.7% (6/362) was detected between specimens from France and Sichuan, and those from Guangxi. Based on ITS-2 sequence data, it was concluded that the Fasciola from Sichuan represented Fasciola hepatica, the one from Guangxi represented Fasciola gigantica and the one from sheep from Heilongjiang may represent an "intermediate genotype", as its ITS-2 sequences were unique in that two different ITS-2 sequences exist in the rDNA array within a single Fasciola worm. One of the sequences is identical to that of F. hepatica, and the other is almost identical to that of F. gigantica in that nucleotides at five of the six polymorphic positions represent F. gigantica. This microheterogeneity is possibly due to sequence polymorphism among copies of the ITS-2 array within the same worm. Based on the sequence differences, a PCR-linked restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) assay was established for the unequivocal delineation of the Fasciola spp. from Mainland China using restriction endonuclease Hsp92II or RcaI. This assay should provide a valuable tool for the molecular identification and for studying the ecology and population genetic structures of Fasciola spp. from Mainland China and elsewhere. 相似文献
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11株螨虫分离株的ITS-2序列分析与系统关系研究 总被引：1，自引：1，他引：0
为探讨动物体上一些常见寄生螨虫的分类地位,对11株螨虫分离株的核糖体第二内部转录间隔区(ITS-2)基因序列进行测定,并从GenBank下载21条螨虫的ITS-2序列,用UPGMA法构建分子系统树.序列分析结果显示:6株疥螨分离株ITS-2基因全长均为361 bp,含有335个保守性位点,15个变异位点和9个简约信息位点;序列间的同源性为96.9%～99.7%.5株足螨分离株ITS-2基因存在长度上的变异(225～232 bp),序列中包括184个保守性位点,44个变异位点,9个简约信息位点;分离自黄牛和奶牛的4株足螨分离株的ITS-2序列同源性为92.4%～97.3%,而熊猫足螨分离株同黄牛、奶牛足螨分离株的同源性较低(78.7%～82.6%).UPGMA显示:32株螨虫分离株分成2个支系,第1个支系包括疥螨科的疥螨属Sarcoptes和背肛螨属Notoedres;第2个支系包括痒螨科的足螨属Chorioptes和痒螨属Psoroptes.从分析结果来看,笔者支持疥螨的单种说法;而足螨属中分离自熊猫的足螨和痒螨属中分离自水牛的痒螨的分类地位还有待进一步探讨. 相似文献