近交系大鼠DNA指纹图与微卫星DNA比较分析     

李瑞生  王承利  赵林山  陈振文 《中国兽医学报》2003,23(3):297-299

为了建立一种对近交系大鼠遗传物质进行精确可靠、快速简便的监测方法,利用DNA指纹技术对国内6个品系8个近交系大鼠群体进行了DNA多态性的分析,并与PCR扩增微卫星DNA技术进行了比较.其结果显示(1)不同品系之间DNA指纹图差异较大,同一群体不同个体间DNA指纹图带的相似系数和共有带率除SHR(哈)和WKY(哈)小于0.7外,其他均大于0.9.不同地区同一SHR间和WKY间DNA指纹图也存在差异,相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致.(2)不同品系个体间微卫星DNA具有显著多态性;同一群体不同个体之间除SHR(哈)的SMST位点和WKY(哈)的AGT位点出现一定的差异外,其他均没有差异.DNA指纹图能更精确可靠地反映出动物个体间的遗传背景,而微卫星DNA遗传监测方法比较简便快捷.  相似文献   

近交系大鼠DNA指纹图与微卫星DNA比较分析     

李瑞生王承利  赵林山陈振文 《兽医大学学报》2003,23(3):297-299

为了建立一种对近交系大鼠遗传物质进行精确可靠、快速简便的监测方法，利用DNA指纹技术对国内6个品系8个近交系大鼠群体进行了DNA多态性的分析，并与PCR扩增微卫星DNA技术进行了比较。其结束显示：(1)不同品系之间DNA指纹图差异较大，同一群体不同个体间DNA指纹图带的相似系数和共有带率除SHR（哈)和WKY(哈)小于0．7外，其他均大于0．9。不同地区同一SHR间和WKY间DNA指纹图也存在差异，相同DNA不同次制作的DNA指纹图谱基本一致。(2)不同品系个体间微卫星DNA具有显著多态性；同一群体不同个体之间除SHR(哈)的SMST位点和WKY(哈)的AGT位点出现一定的差异外，其他均没有差异。DNA指纹图能更精确可靠地反映出动物个体间的遗传背景，而微卫星DNA遗传监测方法比较简便快捷。  相似文献   

皖西白鹅微卫星DNA遗传多样性分析   总被引：7，自引：2，他引：5  

陈兴勇  耿照玉 《中国畜牧兽医》2005,32(8):28-29

从9对微卫星引物中筛选出6对引物对49只皖西白鹅的DNA多态性进行检测，分析等位基因组成，计算各座位的基因杂合度和多态性信息含量。结果表明，6对微卫星引物共扩增出16个等位基因，基因频率分布在0．0392-0．9608之间。6个微卫星位点的平均杂合度为0．3809，平均多态性信息含量为0．3285。  相似文献   

4种体色柞蚕品种遗传关系的RAPD分析   总被引：7，自引：2，他引：5  

刘彦群  鲁成  向仲怀 《蚕业科学》2006,32(1):20-24

利用随机扩增多态DNA(RAPD)标记技术,对分别属于4种体色系统的13个柞蚕品种进行了基因组DNA多态性分析。利用筛选出的33个随机引物扩增出265条DNA带,其中多态性带227条,占85.66%。根据扩增结果计算品种间的单匹配相似系数,用Ne ighbor-Join ing法构建了聚类树状图。4种体色13个品种并没有按所属体色系统聚在一起,即品种的遗传聚类划分与体色之间的相关性不大,表明柞蚕体色并不能真实反映品种间的遗传关系。  相似文献   

四川9个山羊品种(群体)与岩羊RAPD分析     

王杰  徐金瑞  白文林  杨易  王永  欧阳熙  费立松  覃志红  佘陆军  王同军  欧其拉一  马玉才 《中国草食动物》2003,(Z1):53-55

以两组40个随机引物,筛选出16个重复性好的多态引物,对四川9个山羊品种(群体)和岩羊共计113只个体,进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析.结果表明16个引物扩增出67条带,其中54条带呈现多态,多态率为80.60%.山羊各群体共有条带为23条,山羊和岩羊共有条带为13条,岩羊有4条特异带.不同引物所扩增出的片段在各群体中分布频率不同.山羊群体间相似系数为0.821 6～0.936 2,其中安哥拉山羊与建昌黑山羊杂交后代F2和F3之间相似系数最大,为0.936 2.山羊各群体与岩羊相似系数为0.499 6～0.506 4.山羊群体间的遗传距离为0.063 8～0.178 4.山羊各群体与岩羊的遗传距离为0.493 6～0.540 3.高原型藏山羊与山谷型藏山羊间的遗传距离小(0.1005)、相似系数大(0.899 5),序列为TTCCGAACCC引物扩增出的片段为750bp,仅在高原型藏山羊中出现,可作为区分这两个生态类型的遗传标记.  相似文献   

微卫星DNA在近交系小鼠遗传监测中的应用   总被引：1，自引：0，他引：1  

王纯耀  杨卫红  宋国英  朱运良  刘华  曾昭书 《中国兽医学报》2008,28(3):333-335

用7对引物对5种不同品系近交系小鼠的微卫星位点进行多态性分析。结果显示,不同品系及同品系不同个体近交系小鼠的扩增产物在7个微卫星位点上均出现一清晰条带,在不同品系小鼠之间筛选出4个（D3Mit22、D6Mitl92、D6Mit36、D6Mitl49）具有多态性的位点;同品系内不同个体之间没有多态性。结果表明,所检测的小鼠符合近交系要求,筛选出的4个微卫星位点可用于国内有关近交系小鼠的遗传背景监测。  相似文献   

22份果桑种质亲缘关系的SSR分析     

邱长玉  林强  崔秋英  朱方容  陈立  朱光书  张朝华  石华月  陈芳 《广西蚕业》2018,(2)

利用SSR标记对22份果桑种质进行了基因组多态性分析,从20对引物中筛选出6对用于这些果桑种质的SSR扩增。结果是共扩增出60条DNA条带,其中A10引物多态性最好,有40条多态性带。单条引物扩增的条带数量范围为1～40条,平均10条。扩增产物长度分布在500～2 000 bp之前,大多集中在500～1 500 bp。利用VISIONWORKS软件进行Jaccard相似性系数分析,并通过非加权配对算术平均法(UPGMA)进行聚类分析,建立亲缘关系图。22份果桑种质资源的遗传相似系数为0.25～0.68,其中种质8-奶油蜜和23-桂椹92L38遗传相似系数最大,为0.68;1-珍珠白和12-桂花蜜遗传相似系数最小,为0.25。在NG法测定下,在遗传相似系数为0.58处,22份果桑种质亲缘关系分为两个大类群。  相似文献   

3个蒙古犬品系8个微卫星基因座的遗传结构分析     

《黑龙江畜牧兽医》2010,(7)

为了在分子水平上分析蒙古犬群体结构,试验以蒙古犬3种毛色类型群体为试验动物,对其基因组中的微卫星结构进行分析,研究其群体的微卫星多态性。结果表明:8个微卫星位点在3个蒙古犬品系中均呈现高度多态,由相关公式计算的平均杂合度、群体多态信息含量分别为0.5614～0.6770和0.5030～0.6171;3个品系间的基因遗传分化系数为0.2183,群体分化程度较大;迁移率在0.4532～1.4178之间变动,平均值为1.0234。说明3个蒙古犬品系8个微卫星基因座的遗传结构存在一定程度的相似性,分析其品系间相似的遗传结构可能与品种的形成史有关。  相似文献   

用RAPD标记分析高羊茅的遗传多样性   总被引：6，自引：5，他引：6  

田志宏  邱永福  严寒  何勇 《草业学报》2007,16(1):58-63

采用RAPD分子标记技术对从国外引进的15个高羊茅品种的遗传多样性进行了研究。从60个随机引物中筛选出12个有效引物,它们共扩增出85条DNA带,其中59条为多态性带,占69.41%,平均每个引物扩增出多态性带4.92条;利用NTSYS-PC软件计算出的不同品种间Jaccard遗传相似系数(GS)变化范围较大,为0.373~0.932;根据得到的遗传相似性矩阵进行非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立高羊茅品种的分子系统树状图;以相似系数0.68为标准,可将所有品种分为3类,品种翠丽和贝克各自聚为一类,其余13个品种聚成一类。  相似文献   

基于iPBS的巨峰系葡萄品种遗传多样性分析及MCID法快速鉴定     

张安世  张中海  高登涛  魏志峰 《中国果业信息》2020,49(4)

为探讨巨峰系葡萄种质的遗传关系,利用iPBS标记对24个巨峰系葡萄品种进行遗传多样性分析,并应用人工绘制品种鉴别示意图法(%20MCID法)建立品种鉴定图(CID)%20。筛选出13个引物对24个巨峰系葡萄品种进行PCR扩增,共扩增出136条带,其中多态性条带99条,多态性比率为72.79%。各引物观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、Nei’s基因多样性指数(H)和Shannon’s信息指数(I)的平均值分别为1.7206、1.2971、0.1874和0.2972。24个巨峰系葡萄品种的遗传相似系数(GS)在0.6618~0.9485之间,变幅为0.2867。上述结果表明：24个巨峰系葡萄品种间的遗传差异较小。利用UPGMA构建24个巨峰系葡萄种质资源的聚类树状图,在遗传相似系数为0.74处可将24个巨峰系葡萄品种分为2组,其中第Ⅰ组有22个品种,均为欧美杂交种;第Ⅱ组有2个品种,分别为山欧杂种和欧亚种。利用5条引物扩增的多态性谱带构建了24个巨峰系葡萄品种的CID图,利用此CID图可以找出区分任意2个品种的引物,为巨峰系葡萄品鉴定提供科学依据。  相似文献   

内蒙古地区西门塔尔牛亲子鉴定微卫星标记筛选   总被引：1，自引：0，他引：1  

宋玲  贺建宁  孙东晓  李俊雅  张沅 《中国畜牧杂志》2011,47(13)

研究旨在筛选适合于我国肉牛亲子鉴定的微卫星标记,以内蒙古乌拉盖地区368头西门塔尔牛为实验材料,利用荧光引物PCR和ABI3730测序仪对12个微卫星标记进行基因型检测,应用Cervus3.0软件统计12个微卫星标记的遗传多态性。结果表明:其中4个微卫星标记扩增效率较低,被剔除;其他8个微卫星的多态性丰富,平均等位基因数为11.38,平均期望杂合度为0.6686,平均多态信息含量为0.6354,适合于我国肉牛亲子鉴定。  相似文献   

4个肉牛品种微卫星多态性分析   总被引：1，自引：1，他引：0  

张相伦  游伟  靳青  刘晓牧  谭秀文  万发春  曹顶国  刘桂芬 《中国畜牧兽医》2018,45(1):162-170

本研究探讨了引进牛种（西门塔尔牛、利木赞牛）和山东地方黄牛（鲁西黄牛、利鲁牛）在20个微卫星位点上的多态性。试验从不同地区的种公牛站采集鲁西黄牛、利鲁牛、利木赞牛和西门塔尔牛的血液或精液样本,分别为56、27、31和30个,共计144个样本,血液样本采用Lab-Aid基因组DNA分离试剂盒提取基因组DNA,精液样本采用高盐法提取基因组DNA。利用20个微卫星标记,采用荧光标记毛细管电泳方法,对4个肉牛品种的DNA多态性进行分析,主要研究了每个群体的遗传变异指标（等位基因数、多态信息含量和杂合度）及群体间的遗传关系（F-统计量和基因流）。结果表明,肉牛基因组DNA条带整齐,无拖尾现象,质量较好,可用于本试验。20个微卫星座位中共检测到211个等位基因,平均等位基因数为10.6个。群体的平均观测杂合度在0.6147~0.7176之间,平均期望杂合度在0.6735~0.7862之间。在所有群体中各位点的多态信息含量在0.4853~0.8714之间,平均为0.7284,但在各个群体内的差异较大。近交系数及基因流分析结果表明,4个肉牛品种近交系数较低,群体间平均近交系数为0.085,每个微卫星位点的基因流均>1。总体来看,所选用的20个微卫星座位多态信息含量高,可作为有效遗传标记用于肉牛品种间遗传多样性分析。  相似文献   

新疆塔里木马鹿遗传多样性的微卫星分析   总被引：3，自引：1，他引：3  

张苏云  钟林  贾斌  席继锋  彭林泽  曾献存  余志勇  李艳华  赵喜堂 《畜牧与兽医》2006,38(11):17-20

利用5个微卫星标记对新疆塔里木马鹿遗传多样性进行了检测。统计了塔里木马鹿3个群体的等位基因组成、平均有效等位基因数(E)和平均基因纯合率(Rh),利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(h)、多态信息含量(PIC)。结果表明5个微卫星位点在库尔勒、阿拉尔和沙雅县塔里木马鹿3个群体的平均多态信息含量分别为0.5884、0.5754、0.5344,除微卫星位点BM5004外均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于塔里木马鹿遗传多样性分析;塔里木马鹿三个群体总平均PIC、h、Rh和E分别为:0.5661、0.5995、0.4474和2.7。分析认为塔里木马鹿遗传变异度较高,遗传多样性相对丰富,具有较大的遗传潜力。  相似文献   

鲁西牛群体遗传多样性与生长发育性状的微卫星标记研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

毕伟伟  陈维云  王慧  王中华  张沅 《畜牧兽医学报》2011,42(4)

以120头鲁西牛为研究对象,选用分布于牛60条染色体的30对微卫星引物中多样性丰富的8对微卫星位点,探讨与鲁西牛生长发育性状相关联的分子遗传标记。本研究采用微卫星标记技术和最小二乘线性模型,检测了鲁西牛群体的遗传多样性和分析了与鲁西牛生长发育性状相关的标记效应。结果,共检测到34个等位基因,每个微卫星座位的等位基因数为3～6个,平均等位基因数为4.25,该群体的基因平均杂合度(H)为0.561 3,多态信息含量(PIC)为0.498 3。结果表明,7个微卫星座位的不同基因型之间的差异达到显著(P<0.05)或极显著水平(P<0.01)。影响相应性状的最有利基因型分别是ETH185座位的AE与体高,BM711座位的CC和BM1824座位的BB与体长,TGLA53座位的AD和BM711座位的CC与管围,BM1824座位的BB和DVGA55座位的AB与腹围,TGLA53座位的AC、ETH185座位的BD、BM711座位的AB、DVGA46座位的AC、DVGA44座位的BB和DVGA55座位的BB与体质量。而对生长不利的基因型有:DVGA46的AD型,DVGA44的AD型,DVGA55的AA型和ETH185的BC型。...  相似文献   

Use of RAPD-PCR for genetic analysis of Nicobari fowl of Andamans     

Ahlawat SP  Sunder J  Kundu A  Chatterjee RN  Rai RB  Kumar B  Senani S  Saha SK  Yadav SP 《British poultry science》2004,45(2):194-200

1. The present study was conducted to estimate genetic relatedness among Nicobari fowls (Brown, Black and White) and an exotic bird (White Leghorn) using random amplified polymorphic DNA (RAPD) polymorphism. 2. A total of 25 decamer primers were screened among all the breeds of which 24 primers amplified the genomic DNA, generating 2000 to 200 bp bands. Ten primers generated reproducible and distinct RAPD profiles and were used for further analysis. 3. A total of 94 bands were amplified and 30 polymorphic bands (32%) were produced. The number of polymorphic loci ranged from 1 to 5 with an average of 3.0. 4. Among the native breeds Brown Nicobari showed higher genetic similarity (0.85) than Black Nicobari (0.80) and White Nicobari fowl (0.82). 5. Brown Nicobari showed high genetic similarity with Black Nicobari (0.87 +/- 0.029); least similarity was between White Nicobari and White Leghorn (0.77 +/- 0.028). 6. The RAPD profile of all Nicobari fowls on amplification with the primers PBG5 and PBA12 showed specific bands of molecular size 1050 and 785 bp, respectively. 7. The native breeds showed the least genetic distance with each other while White Leghorn appeared to be most distant from the native breeds.  相似文献   

Genomic polymorphism in Uruguayan Creole cattle using RAPD and microsatellite markers     

Rincón G  D'Angelo M  Gagliardi R  Kelly L  Llambí S  Postiglioni A 《Research in veterinary science》2000,69(2):171-174

Uruguayan Creole cattle inhabit areas that cannot sustain conventional farming. They have adapted to fragile environments and are influenced only by natural selection. In this study, random amplified polymorphic DNA (RAPD) and microsatellite (MS) markers were used to analyse Creole cattle genome polymorphism. A comparative analysis using the RAPD technique was performed in pooled DNA of three cattle breeds (Holstein Friesian, Creole and Hereford) in order to evaluate their amplification patterns. A primary screening of RAPD primers allowed us to select and use those with higher percentage of GC base composition. A total of 215 loci ranging between 300 and 2500 bp were amplified. Bandsharing frequency (BSF) among breeds showed that less related fingerprints were observed between Creole and Hereford cattle (0.77), while the highest similarity frequency corresponded to Holstein Friesian compared to Hereford (0.81). Specific RAPD bands were identified in the three DNA pools and they were tested in every individual of each breed. It may be possible to isolate and sequence these bands to create breed-specific molecular markers. The identification of multiple alleles of the MSCYP 21 in Creole cattle with an heterozygosity of He = 0.846 supported the variability of this genetic resource. The use of molecular markers such as RAPD s and microsatellites is proposed to establish genetic distance among American Creole cattle and possibly related ancestral Iberian breeds.  相似文献   

新疆13个绵羊品种及1个杂交群体遗传多样性的微卫星分析   总被引：4，自引：3，他引：1  

汤存伟  邢巍婷  石亮  余雄  刘武军  黄锡霞  决肯  杨晓忠 《中国畜牧兽医》2009,36(6):73-78

利用7个微卫星标记对新疆13个绵羊品种和1个杂交群体的遗传多样性进行了检测。统计了各品种的等位基因组成、平均有效等位基因数(E),利用等位基因频率计算出各品种的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和品种间的遗传距离。结果表明,7个微卫星位点均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于绵羊品种之间遗传多样性和系统发生关系的分析。各品种的分子系统发生关系与其来源、育成史及地理分布基本一致。  相似文献   

豌豆属种质资源遗传多样性的ISSR分析     

曾亮  李敏权  杨晓明 《草业学报》2012,21(3):125-131

用ISSR标记技术对来自国内外的73份豌豆材料进行遗传多样性分析,结果表明,100个ISSR引物中共筛选出11个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,73份材料DNA共扩增出91条条带,其中78条为多态性条带,平均每个引物扩增的条带数为8.2条,多态性比率为86.4%。Shannon多样性指数平均为0.420 2,每个位点的有效等位基因数为1.451 8,品种间遗传相似系数变幅为0.406 5～0.934 0,表现出丰富的遗传多样性。利用UPGMA聚类分析,以遗传相似系数0.52为界限,73份材料划分为5类,聚类基本符合地理来源相近的材料聚为一类,呈现出一定的地域性分布规律。  相似文献   

贵州白香猪的遗传检测     

于冰  刘若余  刘培琼 《家畜生态》2009,(3)

选取27个微卫星位点,应用PCR技术对贵州白香猪的2个品系进行遗传质量监测。结果在所选的27个微卫星位点中,共有24个位点获得稳定的扩增结果,其中SW911位点与S0026两个位点在群体内表现为单态纯合。2个品系有效等位基因、平均多态信息含量、平均杂合度、基因纯合率和平均近交系数分别为1.8310、1.7951、0.3436、0.3249、0.4329、0.4188、52.63%、58.55%、0.5377、0.5605。结果表明微卫星标记可用于检测贵州白香猪的遗传质量,也可用于分析封闭群的遗传多态性。是一种有潜力的试验动物遗传学检测标记。  相似文献