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相似文献
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1.
为大量开发SNP用于构建亚麻高质量的连锁遗传图谱,以亚麻品系R43为母本,LH-89为父本,通过杂交构建F2群体,采用SLAF-seq技术,对两个亲本和F2群体100个个体进行高通量测序、SNP标记的开发及亚麻高密度遗传图谱的构建。对参考基因组进行电子酶切预测,最终确定使用HaeⅢ和RsaⅠ酶,酶切片段大小在314~414bp的序列定义为SLAF标签。其次,对基因组DNA进行酶切和SLAF文库构建。最后通过高通量测序获得测序数据,进行多态性SLAF的鉴定和SNP标记的发掘,采用High Map软件构建亚麻高密度遗传图谱。通过高通量测序,共获得196.29M reads,平均质量Q30为81.95%,平均GC含量为38.64%。通过生物信息学分析,共获得260 380个SNP标记,其中有4 547个SNP为高质量SNP标签,用于标记的定位和图谱的构建。共构建15个连锁群,总图距为2 632.94c M,标记间的平均距离为0.92c M。这是在亚麻中首次应用SNP标记构建的高密度遗传图谱,为亚麻的遗传研究和分子标记辅助育种奠定了基础。  相似文献   

2.
基于SNP标记的玉米容重QTL分析   总被引:4,自引:2,他引:2  
以240个DH系为作图群体,利用SNP芯片对DH群体进行基因型分析,构建连锁图谱,对DH群体进行容重性状鉴定。结果表明,采用复合区间作图法进行QTL定位分析,在4个环境下共检测到5个控制玉米容重的QTL,联合贡献率为23.61%;位于第1染色体的q Tw1-1介于SNP标记PZE-101032246与SYN13192之间,位于第9染色体的q Tw9-1介于SNP标记PZE-109011840和SYN6085之间,分别解释11.9%和7.8%的表型变异,表明这些区域可能包含调控玉米容重性状关键基因。  相似文献   

3.
单核苷酸多态性检测方法研究概述及其应用   总被引:3,自引:0,他引:3  
李琳  杨德光  胡正  王永力 《玉米科学》2009,17(3):142-145
单核苷酸多态性(SNP)作为第3代分子标记有着广阔的应用前景。本文从单核苷酸多态性(SNP)的概念、分类、特点、检测技术等方面进行了概述,论述了单核苷酸多态性在高密度遗传图谱构建、性状作图、病害关联性分析、标记辅助育种等方面的应用,为单核苷酸多态性的研究提供理论依据。  相似文献   

4.
基于高密度遗传连锁图谱定位玉米子粒容重及相关性状QTL   总被引:1,自引:1,他引:0  
利用玉米优良自交系农系531和X178杂交构建的200份RIL群体,基于GBS技术获得SNP标记构建高密度的重组bin遗传连锁图谱,定位控制玉米子粒容重相关QTL。结果表明,构建的物理图谱和遗传图谱的总长度分别为2 017.03 Mb和2 568.99 cM,相邻两个bin标记之间的平均物理距离和平均遗传距离分别为0.27 Mb和0.35 cM。运用所构建的遗传连锁图谱对RIL群体获得的所有目标性状进行连锁作图,两年共定位到4个与子粒容重相关的QTL位点,分别位于chr1、chr7和chr8上;穗部性状穗长、穗粗、穗行数、行粒数和出籽率两年分别共定位到了6、5、5、1、2个QTL位点,位点分布于chr1、chr2、chr3、chr4、chr5、chr7和chr8上。  相似文献   

5.
大豆是重要的粮油作物,而我国大豆主要依靠进口,提高大豆产量对保障国家粮油安全意义重大。为定位大豆产量相关性状,本研究以产量差异显著的东农42和东农50作为杂交亲本,构建了包含168个家系的重组自交系(recombination inbred lines,RILs)群体,对其进行全基因组重测序,构建高密度遗传图谱,并利用R/qtl软件的复合区间作图法(composite interval mapping,CIM)结合两年六点的大豆产量相关性状表型数据,进行QTL定位。结果表明:利用测序获得的660 316个SNP标记构建了一张分布在20个连锁群的包含6227个bin标记的大豆高密度遗传图谱,总图距和平均图距分别为2739.15 cM,0.44 cM。在12个染色体上定位到22个大豆产量相关性状QTL,四粒荚数、单株荚数、单株粒重和百粒重性状定位到的QTL分别为5、4、5和8个。在3号和19号染色体上各有一段基因组区域在两年间重复定位,涉及6个主效QTL,分别为qNFSP-19-1(22.976%)、qNFSP-19-2(11.977%)、qNFSP-19-3(17.203%)、qHSW-3-1(11.346%)、qHSW-3-2(11.346%)和qHSW-3-3(11.175%),加性效应值均为负值。在3、7、11、12和20号染色体上新定位到7个产量相关性状QTL,其中表型贡献率最高的为qHSW-3-3(14.276%),包含具有重复定位区间的qHSW-3-2qHSW-3-3。与前人定位的结果相比,更多QTL极大地缩短了定位区间,表明本文报道的高密度遗传图谱更准确,可以为大豆产量相关性状的精细定位、候选基因的挖掘及分子标记辅助育种奠定基础。  相似文献   

6.
在干旱胁迫条件下,小麦营养器官暂贮性可溶性碳水化合物(Water-soluble carbohydrates,WSC)是小麦籽粒灌浆所需的重要碳源。为发掘控制小麦籽粒WSC含量的真实主效数量性状位点(Quantitative trait loci,QTL),利用生物信息学方法,借助小麦高密度分子标记遗传图谱,对来自不同遗传作图群体的控制小麦籽粒WSC含量的168个QTL位点进行图谱映射和元分析。结果发现,142个QTL定位区间与参考图谱有共有标记,其中92个QTL对籽粒WSC含量的表型变异具有增效效应,50个QTL具有减效效应。建立控制小麦籽粒WSC含量的QTL一致性图谱,获得16个"一致性"QTL(Meta quantitative trait loci,MQTL)位点及其连锁标记,MQTL置信区间最小达到0.77cM。  相似文献   

7.
赵韦 《玉米科学》2015,23(6):35-38,44
以EMS诱变获得的高油玉米突变体ce03005为材料,对子粒油分含量进行遗传分析,并以B73×ce03005的BC群体构建连锁图谱,考察玉米167个BC1S1家系的油分含量的变化。结果表明,利用101个SSR标记,所构建遗传图谱总长度为1 611.7 c M,标记间平均距离为15.9 c M。用复合区间作图法进行QTL分析,共检测到5个控制子粒油分含量的主效QTL和6个微效QTL,分别位于第1、6、7染色体上;所有QTL位点的含油量正向贡献均来自高油突变体;单个油分QTL的贡献率变幅为4.58%~18.62%。  相似文献   

8.
大豆遗传图谱的构建和含油量的QTL分析   总被引:5,自引:1,他引:4  
以大豆重组自交系soy01群体中的255个家系为作图群体,利用225个分子标记和2个形态标记构建了一张包含27个连锁群的大豆遗传连锁图谱,总遗传距离1315.46cM,平均标记间距5.79cM。在构建遗传图谱的基础上,采用复合区间作图法,检测到10个与含油量相关的QTL。这些QTL分别位于大豆遗传图谱的A2、C2、D1b、M和N连锁群,解释的遗传变异范围为4.0%~12.2%。这些QTL中,4个与soybase数据库中的QTL有可能是相同的位点,2个可能是新的位点,其余4个是否是新的位点还有待进一步验证。亲本中豆29和中豆32中均有增效基因分布,通过遗传重组可以提高大豆含油量。  相似文献   

9.
大豆蛋白质含量的QTL定位   总被引:3,自引:1,他引:2  
以高蛋白的大豆品种齐黄26和低蛋白的滑皮豆为亲本,杂交获得含170个单株的F2代分离群体,采用SSR分子标记技术,构建了一张包括18个连锁群的分子连锁图谱,覆盖大豆基因组长度1 035.6 cM,标记间平均距离为16.44 cM。利用复合区间作图法,对在济南和冠县衍生出的F2∶3群体的蛋白质含量的进行QTL分析。结果表明:济南试验点定位到3个与蛋白质含量有关的QTL,分布于D2、E和K连锁群上,分别可解释14%、11%和2%的变异;冠县试验点定位到1个与蛋白质含量有关的QTL,位于E连锁群上,可解释3%的变异。通过遗传作图找到3个与所定位的QTL相连锁的SSR标记,这些标记可为大豆分子标记辅助育种提供参考。  相似文献   

10.
茶氨酸合成酶基因的SNP挖掘和遗传定位   总被引:1,自引:0,他引:1  
茶氨酸合成酶(Theanine synthetase,TS)基因是茶树茶氨酸代谢过程中的关键酶基因。本研究以氨基酸含量差异明显的亲本及其杂交所得F_1子代为研究材料,克隆TS基因的c DNA序列,挖掘其SNPs位点,并成功将杂合SNP位点定位在遗传连锁群上。研究结果显示,通过序列比对在亲本间检测到3个SNPs,验证得到1个杂合的位点SNP735。将此位点成功转化为dCAPS标记,该标记在子代中的基因型分离比为1∶1,利用该群体已构建的茶树遗传图谱进行遗传定位,将dCAPS标记定位在连锁群LG03上,相邻标记为TM299和TM517。联合此标记及其相邻标记与游离氨基酸总含量和茶氨酸含量进行统计分析,表明具有显著的相关性。  相似文献   

11.
随着早熟晚粳、中熟晚粳广泛种植,水稻轻型省力栽培方式旱直播的推广,病虫也发生了变化,成熟期显著推迟,下茬无法在适宜播期种植,影响粮食丰产稳产。提出筛选早熟当家品种、大力推广机插秧、加大粮食烘干设备的投入、合理施肥、精准植保等对策。  相似文献   

12.
Sorghum and millet phenols and antioxidants   总被引:5,自引:2,他引:5  
Sorghum is a good source of phenolic compounds with a variety of genetically dependent types and levels including phenolic acids, flavonoids, and condensed tannins. Most sorghums do not contain condensed tannins, but all contain phenolic acids. Pigmented sorghums contain unique anthocyanins that could be potential food colorants. Some sorghums have a prominent pigmented testa that contains condensed tannins composed of flavan-3-ols with variable length. Flavan-3-ols of up to 8–10 units have been separated and quantitatively analyzed. These tannin sorghums are excellent antioxidants, which slow hydrolysis in foods, produce naturally dark-colored products and increase the dietary fiber levels of food products. Sorghums have high concentration of 3-deoxyanthocyanins (i.e. luteolinidin and apigenidin) that give stable pigments at high pH. Pigmented and tannin sorghum varieties have high antioxidant levels that are comparable to fruits and vegetables. Finger millet has tannins in some varieties that contain a red testa. There are limited data on the phenolic compounds in millets; only phenolic acids and flavones have been identified.  相似文献   

13.
Sorghum is a good source of phenolic compounds with a variety of genetically dependent types and levels including phenolic acids, flavonoids, and condensed tannins. Most sorghums do not contain condensed tannins, but all contain phenolic acids. Pigmented sorghums contain unique anthocyanins that could be potential food colorants. Some sorghums have a prominent pigmented testa that contains condensed tannins composed of flavan-3-ols with variable length. Flavan-3-ols of up to 8–10 units have been separated and quantitatively analyzed. These tannin sorghums are excellent antioxidants, which slow hydrolysis in foods, produce naturally dark-colored products and increase the dietary fiber levels of food products. Sorghums have high concentration of 3-deoxyanthocyanins (i.e. luteolinidin and apigenidin) that give stable pigments at high pH. Pigmented and tannin sorghum varieties have high antioxidant levels that are comparable to fruits and vegetables. Finger millet has tannins in some varieties that contain a red testa. There are limited data on the phenolic compounds in millets; only phenolic acids and flavones have been identified.  相似文献   

14.
概述了海峡两岸农业交流与合作的现状,提出了应该共同呼吁尽快实现两岸“三通”,开放农业生物技术图书期刊资料交流以及开放生物学科方面网络的思路,以便为农业交流与合作的顺畅开展打好基础,并寄希望能够就糖蔗、果蔗以及甘蔗笋等方面的研究与开发到台湾学习取经,开展学术交流或与台湾同行共同开展研究,为我省甘蔗业的发展作出贡献。  相似文献   

15.
种子加工、检验理论与技术现状及思考   总被引:3,自引:0,他引:3  
种子加工及检验是种子向市场流通的关键,是商业化育种中赋予种子商品属性不可或缺的环节。种子加工、检验理论与技术的研究是完善种业产业链、实现规模化商业育种、夯实“育繁推一体化”种业科学的重要一环。中国的种业科学技术体系正在形成与完善之中,受制于行业发展水平,种子加工及检验理论与技术相对薄弱。本文回顾了种子加工及检验理论与技术研究发展历程,提出了完善中国种业科学发展的策略与建议。围绕种业发展的需要,在做好品种优质化繁育的基础上,分析种子加工及检验理论与技术的新方向和新需求,加强种业应用性研究,建立先进的种子质量检验体系,研制适合现代种业发展需求的种子加工设备,打造种子加工产业标准化生产体系,完善种业科学技术学科建设,促进种业产业持续健康发展。  相似文献   

16.
1大豆花叶病毒病 大豆病毒病(Soybean Mosaic Virus,SMV)是世界性病害之一。我国东北地区已鉴定的有5种,即大豆花叶病、顶枯病、蚕豆萎蔫病、南方菜豆花叶病、花生条纹病毒。其中大豆花叶病在全国大豆主要产区都有发生,十分常见。  相似文献   

17.
蔡红 《大豆科技》2001,(3):15-15
近年来,随着大豆播种面积的增长,受病虫危害日趋严重。特别是大豆根潜蝇(又名根明)与根腐病共同发生危害,严重影响大豆的生产。综合防治技术主要手段是三年以上轮作,适时播种及种衣剂拌种等措施。  相似文献   

18.
Summary Between 1993 and 1998 205 different potato cultivars and 1220 accessions/genotypes of wild and cultivated potato species from the IPK Genebank Gatersleben were evaluated. Parameters interesting for starch isolation and especially for the use of starch were determined. Altogether, there was a higher variability in wild potato species than in cultivated potatoes for all characteristics investigated: dry matter content, starch content, protein content, amylose content and mean particle diameter of starch granules.  相似文献   

19.
Yield and quality of winter and spring triticales for forage and grain   总被引:2,自引:0,他引:2  
In field experiments conducted over 2 years in Mediterranean conditions, five winter and five spring triticales were evaluated for forage and grain production in the same cropping season. The experiments had two treatments, namely harvesting for grain only, and dual-purpose forage and grain production. In the latter treatment, forage was cut when the first node was detectable (Zadoks' stage 31), without removing the apical meristems. Grain was harvested when ripe (Zadoks' stage 92) in both cut and uncut plots.
Environmental conditions affected grain production and protein content more than forage yield and quality. Winter triticales yielded about 43% more forage than spring types, but after forage removal the spring types yielded about 36% more grain than winter triticales.
Reductions in grain yield after clipping were more pronounced in winter (32%) than in spring (19%) types. Forage crude protein content was significantly higher in the spring types studied (24.6%) than in the winter types (23.5%), the opposite being true for fibre content (20.7 and 21.6% respectively). Grain crude protein content did not differ between grain and dual-purpose treatments, but was higher in the spring triticales (12.8%) than in the winter types (11.9%). There was more variability for the measured traits within the winter triticales studied than within the spring types.  相似文献   

20.
种子加工及检验是种子向市场流通的关键,是商业化育种中赋予种子商品属性不可或缺的环节。种子加工、检验理论与技术的研究是完善种业产业链、实现规模化商业育种、夯实"育繁推一体化"种业科学的重要一环。中国的种业科学技术体系正在形成与完善之中,受制于行业发展水平,种子加工及检验理论与技术相对薄弱。本文回顾了种子加工及检验理论与技术研究发展历程,提出了完善中国种业科学发展的策略与建议。围绕种业发展的需要,在做好品种优质化繁育的基础上,分析种子加工及检验理论与技术的新方向和新需求,加强种业应用性研究,建立先进的种子质量检验体系,研制适合现代种业发展需求的种子加工设备,打造种子加工产业标准化生产体系,完善种业科学技术学科建设,促进种业产业持续健康发展。  相似文献   

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