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1.
通过分析分离自病猪血液、器官的细菌生物学特性,探讨高热病猪发病病因,寻找预防、治疗的方法。取3头高热病猪组织、血液用羊血及伊红美兰琼脂平板培养、分离出的3株菌株,经VITEK2革兰氏阴性细菌鉴定卡全自动微生物鉴定;ASTGN10药敏卡,药敏分析系统鉴定;小鼠毒力实验;血清凝集实验;16SrRNA基因鉴定;致泻毒力基因鉴定。结果3株均为大肠埃希氏菌(Escherichiacoli)大肠埃希氏菌,并经16SrRNA基因鉴定与GenBank比对结果,3株细菌均鉴定为大肠杆菌。3株菌对氨曲南、头孢吡肟等药物敏感,而对庆大霉素、四环素等耐药。菌株对小鼠有较强的致病力。菌株与159种大肠杆菌诊断血清均不凝集,说明这些菌不是常见的大肠杆菌致病型。致泻毒力基因鉴定均为阴性。分离出3株非常见致病型大肠杆菌在当地猪高热症暴发中起到重要作用。高热病猪尽早配合使用敏感抗生素治疗有减轻病情、减少病死率的效果。 相似文献
2.
对江西省某家养野猪场临诊疑似副猪嗜血杆菌（Haemophilusparasuis,Hps）感染的病例进行细菌分离鉴定,PCR扩增分离菌株的16SrRNA并进行测序分析,并对分离菌进行细菌形态、生化鉴定和PCR鉴定及序列比对分析。结果显示,获得1株家养野猪源Hps分离株（命名为HPJXYZ01）,该分离株与国内外参考菌株序列之闻的同源性为93．1％～99．2％,与本实验室江西省家猪源分离株的同源性为84％～92．1％。结果表明,江西省家养野猪中存在Hps感染,分离株与国内外家猪源Hps间的16SrRNA序列差异不大,Hps16SrRNA核苷酸序列比较稳定,其进化不存在明显的地域相关性。 相似文献
3.
1881年，巴斯德（Pasteur）首次描述了禽霍乱和牛及其它动物的出血性败血症，并分离得到巴氏杆菌。1885年由Kitt分离培养得到病源菌，直到1920年才将分离物做了较为可靠地鉴定，并发现人也可被感染。1887年，为了纪念巴斯德在微生物方面所做的工作，将此菌命名为巴斯德氏菌。其中多杀性巴氏杆菌（Pasteurella multocida，P．m）可感染猪、马、牛、家禽等多种动物， 相似文献
4.
为了确定石河子地区规模化羊场出现呼吸道症状死亡羊的细菌性病原,采用常规细菌分离鉴定方法、细菌16SrRNA序列分析以及多杀性巴氏杆菌特异性基因kmt,从病变肺组织分离鉴定细菌,利用5个荚膜血清型特异性基因确定其血清型,扩增分离株的16个毒力相关基因,分析分离菌致病性和对常用抗菌药物的耐药性。结果表明,从病羊的病变肺组织中分离鉴定到一株血清D型多杀性巴氏杆菌,具有较强的致病性;携带8个毒力相关基因,其片段序列与NCBI上己公布的多杀性巴氏杆菌参考株同源性在99%以上;分离株对青霉素、林可霉素、庆大霉素、复方新诺明耐药,对其他23种药物敏感。 相似文献
5.
从湖南娄底某猪场病猪组织中分离出6株细菌,通过培养特性、细菌染色镜检、16sRNA基因扩增及序列BLAST分析等系统鉴定,确定为猪链球菌。并对分离菌与GenBank中收录的17株猪链球菌的16SrRNA基因序列的进行同源性比对,结果显示,6株分离菌的16SrRNA基因序列与收录菌株同源性为99%以上。药物敏感试验表明,分离细菌对头孢类、β内酰胺类药物高度敏感、对磺胺类、氨基糖苷类、喹诺酮类、四环素类药物产生耐药。而6株分离细菌对氯霉素类药物的敏感,但敏感性有差异。 相似文献
6.
肺炎克雷伯氏菌强毒株的分离鉴定及16-23SrRNAITS序列分析 总被引：1，自引：1，他引：0
为确诊疑似仔猪肺炎克雷伯氏菌(K.pneumonia)感染,并研究其病原的致病性、耐药性、16-23SrRNA ITS系统进化特征,本研究从云南因肺炎、腹泻而大量死亡的仔猪中分离到1株革兰氏阴性短粗杆菌,命名为KP14013,对其进行生化鉴定、16SrRNA鉴定,研究其对小白鼠和仔猪的致病性,并对其16-23SrRNA ITS基因进行测序和遗传进化分析。结果显示,KP14013分离株生化特征与肺炎克雷伯氏菌相符,其16SrRNA与GenBank中23株肺炎克雷伯氏菌代表株之间的同源性均为99%,将KP14013鉴定为肺炎克雷伯氏菌。KP14013对小白鼠半数致死量(LD50)为3×101.8 CFU,腹腔注射3×108 CFU可使仔猪100%致死。16-23SrRNA ITS系统进化关系结果表明,KP14013与GenBank中收录的15株肺炎克雷伯氏菌形成进化树的一个分支,属于同一个亚群,它们之间的核苷酸同源性为98.4%~99.2%。本研究证实了肺炎克雷伯氏菌是该起仔猪腹泻大量死亡的病原;KP14013分离株为毒力极强菌株,具有多重耐药性,其16-23SrRNA ITS与GenBank中收录的肺炎克雷伯氏菌代表株之间核苷酸存在差异,可用于肺炎克雷伯氏菌菌株间的鉴别。 相似文献
7.
鸡奇异变形杆菌的分离鉴定和16S rRNA基因序列测定与系统进化分析 总被引：2，自引：0，他引：2
从山东泰安一鸡场发病雏鸡眼中分离到1株致病菌(编号为QY),通过细菌形态学等常规鉴定符合奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)特性。用奇异变形杆菌阳性血清诊断结果呈阳性,人工感染证明该菌株是造成该鸡场雏鸡大批发病死亡的致病菌。药敏试验结果显示对头孢类、恩诺沙星等高度敏感,而对青霉素和复合磺胺等不敏感。以细菌16SrRNA基因通用引物进行PCR扩增,得到QY的16SrRNA基因序列,长约1 453bp(GenBank,登录号为GU477712)。将该序列与GenBank中序列进行Blast比对,发现与其匹配度最高的均是奇异变形杆菌各株系的16SrRNA序列,均高达98%以上。运用DNAStar软件与其中10株奇异变形杆菌分离株构建系统进化树,结果表明,分离株(QY菌株)与10个代表菌株的同源性均为98.9%～99.9%,其中与AB272366同源性最高为99.9%。从分子水平证明该菌是奇异变形杆菌并分析了其遗传进化规律,为鸡奇异变形杆菌的鉴定及其引起的疾病的诊断与治疗提供了参考。 相似文献
8.
对21株分离自河南及山西地区的鸡杆菌的16SrRNA基因序列进行研究,以此分析分离株的进化关系并确定其在鸡杆菌属中所属的具体种。采用PCR方法扩增其16SrRNA基因序列,然后克隆测序。用DNAStar软件对21个菌株的序列及GenBank中已公布的鸡杆菌属相关菌株序列进行同源性比较,结果发现21株分离株之间的核苷酸序列同源性为96．0oA～100％,同鸭源鸡杆菌F279（Gallibacteriuman atis F279）（AF228002）的同源性为95．3％～99．3％,同输卵管炎鸡杆菌F150（Gallibacterium salpingitidis F150）（EU424000）的同源性为88．3％～91．5％,同虎皮鹦鹉鸡杆菌F450（GallibacteriummelopsittaciF450）（EU339196）的同源性为90．3％～93．3％,同海藻糖发酵鸡杆菌52-S3-90（Gallibacteriumtrehalosi fermentans52-s3—90）（EU339199）的同源性为88．2％～91．4％,同多杀性巴氏杆菌CCUG179（P．multocida CCUG17977）（AF294411）的同源性为85．5％～88．8％,对21株细菌的序列同以上菌株的16SrRNA基因序列进行遗传进化树分析,显示21株细菌同鸭源鸡杆菌F279（AF228002）构成一个单独的大分支。结果表明,所有分离株均属于鸭源鸡杆菌,首次大量报道了来源于河南、山西省不同地区的鸡杆菌的16SrRNA基因序列,为鸡杆菌分类的研究提供了参考。 相似文献
9.
为了解猪雷极氏普罗菲登斯菌(P.rettgeri)的生物学特性、致病性及16SrRNA基因系统进化关系,从发生严重腹泻、血便的哺乳仔猪群的内脏器官中分离到1株病原菌,根据形态特征、培养特性、生化特性、16SrRNA基因序列分析鉴定为P.rettgeri。小鼠攻毒试验证实,该分离菌株对试验小鼠有较强致病力,哺乳仔猪回归试验可复制出与临床上相似的典型症状,并从发病死亡小鼠及哺乳仔猪中分离到攻毒菌株。系统进化分析表明,分离菌株与雷极氏普罗菲登斯菌系统进化关系最为密切,其16SrRNA基因序列与雷极氏普罗菲登斯菌代表菌株的同源性在97.3%~99.6%之间。药敏试验结果表明,分离菌株对头孢哌酮钠、头孢噻肟钠、头孢曲松钠、头孢唑啉、头孢呋肟、头孢吡肟、阿莫西林、链霉素、氨曲南、诺氟沙星、左氟沙星、恩诺沙星、卡那霉素、氨苄青霉素、米诺环素、链霉素、阿米卡星等多数药物敏感。首次报道了雷极氏普罗菲登斯菌可以引起哺乳仔猪严重腹泻,提示在仔猪腹泻中应注意该菌感染的诊断、监测和防控。 相似文献
10.
袋鼠源铜绿假单胞菌分离鉴定 总被引：1，自引：0，他引：1
为确定袋鼠死亡原因,本研究采用Biolog快速鉴定系统、16SrRNA序列分析以及传统细菌鉴定方法对2株分离自北京动物园袋鼠肺脏的菌株进行形态学、培养特性、生化特性、小鼠致病性、系统发育分析等生物特性的鉴定和分析,结果表明2菌株均为铜绿假单胞菌,对昆明小鼠有强致病性。系统发育分析结果表明2株袋鼠源铜绿假单胞菌16SrRNA序列与ATCC10145模式株差异很小,同源性分别为99.9%和100%,并且位于系统发育树的同一分支。 相似文献
11.
Thirty-five isolates of Pasteurella multocida from the vagina and respiratory tract of sheep were compared by analysing their capsular polysaccharide types and outer membrane protein profiles. The phylogenetic relationships of selected isolates with respect to reference strains of P. multocida were also determined by comparative 16S rRNA sequence analysis. Three capsular types, A, D and F, and three major outer membrane protein types were identified, and there were four different combinations of these characteristics which probably marked four individual clones of P. multocida. Strains representing three of these clones were recovered from cases of ovine pneumonia, whereas isolates of the fourth clone were associated exclusively with the vagina of healthy ewes and the liver of a dead septicaemic lamb on the same farm. Analysis of the 16S rRNA sequences showed that there was 100 per cent identity between representative pneumonic isolates and reference strains of P. multocida subspecies galliseptica and P. multocida subspecies multocida. The 16S rRNA genes of representative vaginal and liver isolates from the same farm were identical but differed from the other strains at one nucleotide position, providing strong evidence that the vaginal and liver isolates represent a distinct subpopulation of P. multocida. 相似文献
12.
参考GenBank中兔巴氏杆菌16SrRNA和波氏杆菌的fim2的基因序列,应用Premier 5.0软件在二者高度保守区设计了2对引物,建立了适合巴氏杆菌和波氏杆菌快速检测的多重PCR检测方法。以该方法对巴氏杆菌和波氏杆菌参考菌株进行PCR扩增,分别能从各自的基因组中扩增出与试验设计相符的644bp和425bp的特异性DNA片段。将扩增所得的DNA片段进行克隆测序,测序结果表明分别为巴氏杆菌16SrRNA和波氏杆菌fim2基因序列。该方法对波氏杆菌的检测下限为4×102 CFU,对巴氏杆菌的检测下限为6×101 CFU。对兔源性沙门菌、葡萄球菌、大肠杆菌、魏氏梭菌扩增结果为阴性。表明所建立的RT-PCR检测技术具有特异、快速和敏感的特点,可用于鉴别诊断兔巴氏杆菌和波氏杆菌以及2者混合感染。 相似文献
13.
为探究缅甸蟒肺炎病因,本研究对海南文昌缅甸蟒养殖场的4条发病缅甸蟒进行了肺和心血组织的病原菌分离纯化、菌落及染色形态观察、生化、和16S rRNA分子鉴定,最后对各分离菌株进行了体外药敏实验。结果显示,全部分离株菌落及细胞形态特征一致,均为革兰氏阴性杆菌;糖醇发酵等生理生化特性与肠道沙门氏菌一致;根据16S rRNA基因的同源性比对,发现分离菌株与肠道沙门氏菌Salmonella enterica subsp.houtenae DSM 9221菌株同源性达到99%,可确定分离株全部为肠道沙门氏菌。通过23种抗菌药物的药物敏感性显示,所分离菌株对氟罗沙星等12种抗生素完全敏感。本研究结果表明海南文昌缅甸蟒肺炎病因为沙门氏菌感染,体外药敏实验可为该病的抗生素治疗提供使用参考。 相似文献
14.
Real-time PCR for detection and differentiation of Streptococcus equi subsp. equi and Streptococcus equi subsp. zooepidemicus 总被引：1，自引：0，他引：1
Strangles is a contagious equine disease caused by Streptococcus equi subsp. equi. In this study, clinical strains of S. equi (n=24) and Streptococcus equi subsp. zooepidemicus (n=24) were genetically characterized by sequencing of the 16S rRNA and sodA genes in order to devise a real-time PCR system that can detect S. equi and S. zooepidemicus and distinguish between them. Sequencing demonstrated that all S. equi strains had the same 16S rRNA sequence, whereas S. zooepidemicus strains could be divided into subgroups. One of these (n=12 strains) had 16S rRNA sequences almost identical with the S. equi strains. Interestingly, four of the strains biochemically identified as S. zooepidemicus were found by sequencing of the 16S rRNA gene to have a sequence homologous with Streptococcus equi subsp. ruminatorum. However, they did not have the colony appearance or the biochemical characteristics of the type strain of S. ruminatorum. Classification of S. ruminatorum may thus not be determined solely by 16S rRNA sequencing. Sequencing of the sodA gene demonstrated that all S. equi strains had an identical sequence. For the S. zooepidemicus strains minor differences were found between the sodA sequences. The developed real-time PCR, based on the sodA and seeI genes was compared with conventional culturing on 103 cultured samples from horses with suspected strangles or other upper respiratory disease. The real-time PCR system was found to be more sensitive than conventional cultivation as two additional field isolates of S. equi and four of S. zooepidemicus were detected. 相似文献
15.
猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌复合PCR检测方法的建立 总被引：2，自引：0，他引：2
目的建立可以同时检测猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的快速而可靠的PCR检测方法。方法和结果根据胸膜肺炎放线杆菌的Apx-VIA基因序列、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的16SrRNA基因序列设计5条引物。猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌模板的PCR扩增产物大小分别为342bp,485bp和1258bp。复合PCR对1～12型猪胸膜肺炎放线杆菌标准株,6株多杀性巴氏杆菌标准株,1～15型副猪嗜血杆菌以及25株经生化鉴定确认为上述三种细菌的分离株的基因组DNA作为模板进行检测,均获得预期大小的扩增产物。以猪放线杆菌、吲哚放线杆菌等14种常见细菌作为阴性对照进行PCR检测,结果仅有支气管败血波氏杆菌产生了可以和上述三个特异性条带明显区分的PCR产物。复合PCR针对胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的敏感性分别为14pg、34pg和37pg。结论本研究建立的复合PCR特异性好,敏感性高,可以用于猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的快速检测。 相似文献
16.
Dey S Singh VP Kumar AA Sharma B Srivastava SK Singh N 《Research in veterinary science》2007,83(1):1-4
The phylogenetic relationships of five isolates of Pasteurella multocida serotype B:2 belonging to buffalo, cattle, pig, sheep and goat were investigated by comparative sequence analysis of 16S rRNA gene. The 1468bp fragment of 16S rRNA gene sequence comparison showed that the isolates of cattle (PM75), pig (PM49) and sheep (PM82) shared 99.9% homology with the buffalo isolate (vaccine strain P52) whereas, the goat isolate (PM86) shared 99.8% homology with the vaccine strain. The 16S rRNA gene sequences of these isolates were also found monophyletic with type B reference strain NCTC 10323 of P. multocida subsp. multocida. The present study indicated the close relationships of haemorrhagic septicaemia causing P. multocida serotype B:2 isolates of buffalo and cattle with other uncommon hosts (pig, sheep and goat). 相似文献
17.
副猪嗜血杆菌的分离鉴定及16S rRNA序列分析 总被引：1，自引：1，他引：0
从云南某规模化养猪场病猪肺脏分离到1株革兰氏阴性小杆菌,经细菌生化鉴定、PCR鉴定和16S rRNA序列比对鉴定为副猪嗜血杆菌。抗生素药物敏感试验结果表明,分离菌株对四环素、红霉素、氯霉素、头孢噻吩高敏;对庆大霉素、氧氟沙星、诺氟沙星中敏;对磺胺甲唑耐药。16S rRNA分析结果表明,该分离株与GenBank中的Hps参考株AB078973(基因登录号)同源性为100%,将分离菌株鉴定为副猪嗜血杆菌。16S rRNA遗传进化关系表明,分离株与副猪嗜血杆菌3株血清5型参考株AB078972、AB078973、AB078974的16S rRNA序列位于一个分支上,遗传进化关系最近,它们之间的核苷酸同源性在99.0%~99.4%之间,初步鉴定为血清5型副猪嗜血杆菌,致病性试验结果表明,分离菌株对小白鼠有强致病性,命名为YN-1株。 相似文献
18.
对出现精神沉郁、食欲减退、拉稀、脚软和共济失调症状,其后死亡,的鸭病例,进行常规诊断、动物试验,结果分离到一株细菌,命名为GDYJS-1.分离株通过生长特性、凝集试验、染色特性及VITEK-32微生物鉴定系统生化试验鉴定为沙门氏菌;16S rRNA基因序列的测定与分析,鉴定为鼠伤寒沙门氏菌. 相似文献
19.
应用16S rRNA基因测序法鉴定禽多杀性巴氏杆菌的研究 总被引：4，自引：0，他引：4
应用 16SrRNA基因测序法对以疫苗标准强毒株C4 8_1和弱毒疫苗代表株G190E4 0为阳性对照株和分离鉴定的 2株禽源多杀性巴氏杆菌Chicken/guangxi/ 2 0 0 0_1、Chicken/guangdong / 2 0 0 2_1株 ,进行 16SrRNA基因序列分析。结果表明 ,2株分离菌与对照的强弱毒株之间的同源性为 10 0 %。后经Blastn分析Chicken/guangxi/ 2 0 0 0_1、Chicken/guangdong /2 0 0 2_1、C4 8_1、G190E4 0株与已发表 11株多杀性巴氏杆菌同源性高达 10 0 % ,与已发表的 34株多杀性巴氏杆菌同源性均超过 98% ,同时与其它巴氏杆菌种如溶血巴氏杆菌等同源性均低于 96 % ,进一步证实Chicken/guangxi/ 2 0 0 0_1、Chicken/guangdong / 2 0 0 2_1分离株均为多杀性巴氏杆菌。生化实验鉴定表明Chicken/guangxi/ 2 0 0 0_1、Chicken/guangdong / 2 0 0 2_1、C4 8_1、G190E4 0菌株均为subsp .Multocida亚种。 相似文献
20.
R A Tapp A F Roy R E Corstvet V L Wilson 《Journal of veterinary diagnostic investigation》2001,13(3):219-229
Cat scratch disease (CSD) has been difficult to diagnose in animals because of the protracted clinical course of infection and the quiescent phases when the microbial culprit lies dormant. The causative agent in CSD appears to be multiple species and strains of Bartonella. Using polymerase chain reaction (PCR) techniques for amplification of highly variable regions of the 16S ribosomal RNA (rRNA) gene sequence, a very sensitive species- and strain-specific assay for CSD-causing Bartonella species was developed. PCR primers were designed to specifically amplify the 16S rRNA gene of Bartonella species but not of other microbial pathogens. This initial PCR was multiplexed with a universal primer set, based on conserved sequence regions in the 16S rRNA gene, that provides a 162-bp fragment in all species tested. Subsequently, 3 distinct nested PCR primer sets enabled the individual amplification and specific detection of Bartonella henselae type 1, B. henselae type II, and B. clarridgeae. Thus, this 2-step PCR procedure enabled the sensitive detection and identification of these species and the B. henselae genotype by exploiting minor sequences differences. Verification of these results were demonstrated with both sequencing and ligase chain reaction techniques. The diagnostic usefulness of this CSD test has been demonstrated by the analysis of specimens from control and infected cats. The diagnosis was confirmed and the specific B. henselae strain was correctly identified in peripheral blood specimens obtained from control and strain-specific CSD-infected cats. Such an accurate and sensitive diagnostic tool for the detection and identification of CSD causative agents should be a useful for the medical, veterinary, and scientific communities. 相似文献