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1.
根据GPV H1株核苷酸序列，设计了扩增VP1-VP3基因非重叠序列的1对引物，对其结构蛋白VP1与VP3非重叠核苷酸序列进行PCR扩增，将PCR产物纯化、回收后制备出GPV VP1-VP3基因DIG标记核酸探针，其标记效率达到0．1pg／μl。特异性检测结果表明，该探针能与GPV不同毒株核酸发生特异性杂交，而与对照的DPV、GPMV等病毒的核酸杂交反应均为阴性；敏感性检测结果表明该探针对GPV的最低检出量为0．032ng。上述试验结果表明该探针可以用于GPV感染临床病料的检测。 相似文献
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核酸探针检测犬瘟热病毒方法的建立和初步应用 总被引：2，自引：0，他引：2
根据犬瘟热病毒（CDV）基因序列的结构特点,在其编码核衣壳蛋白的高度保守基因区内,设计合成一对特异性引物.以RT-PCR技术从CDV基因中扩增出了一段长度为430 bp的核苷酸cDNA,并制备出地高辛标记的CDV核酸探针.特异性检测结果表明,该探针能与CDV标准株和地方分离株核酸发生特异性杂交,而与对照的NDV、MV等病毒的核酸杂交反应均为阴性.敏感性检测结果表明,该探针对CDV的检出量可达到0.1 pg.用所制备的核酸探针对某宠物诊所疑似犬瘟热病例进行临床诊断初步应用试验,表明该标记探针完全可用于CDV的临床检测. 相似文献
3.
《中国兽医学报》2016,(12):2001-2004
根据GenBank发表的1株鸭细小病毒全基因组序列设计1对特异性引物,利用PCR扩增得到大小为301bp的片段,回收纯化后用地高辛进行标记,制备鸭细小病毒地高辛标记探针。特异性试验表明,该探针仅与鸭细小病毒发生特异性杂交反应,与GPV、MDPV、DcuV、DEV、DHAV-I、H9N2亚型AIV、N-DRV、NDV、TMUV杂交反应均为阴性。敏感性试验表明,该探针对鸭细小病毒核酸的最低检测量为25pg。应用制备的探针对山东、江苏和安徽等地采集的61份患病鸭和30份健康鸭组织进行检测,阳性率分别为97%和0%,与病毒分离结果符合率为98%。上述结果显示,本研究制备的探针特异性强、敏感性高,为该病的诊断和流行病学调查提供可靠的方法。 相似文献
4.
猪圆环病毒2型地高辛标记探针检测方法的建立与应用 总被引：1，自引：0，他引：1
根据GenBank中已发表的猪圆环病毒2型(PCV-2)基因序列,在ORF2内设计1对特异性引物,利用PCR反应扩增出371 bp的核酸片段,回收并纯化PCR产物,用地高辛标记,建立了地高辛标记核酸探针诊断PCV-2的方法。该探针与8个PCV-2重组菌的核酸抽提物均能发生特异性杂交,而与对照猪圆环病毒Ⅰ型(PCV-1)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪细小病毒(PPV)、猪伪狂犬病病毒(PRV)的核酸杂交均为阴性;对PCV-2 DNA的最低检测量为10 pg。 相似文献
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6.
将含新城疫病毒 (NDV)四平株 F基因的重组质粒 (p KSF)经 Eco R 及 Xba 双酶切 ,回收 340 bp的 c DNA片段 ,制备了地高辛标记的 c DNA探针。特异性检测表明 ,该探针对含 NDV F基因的 p KSF呈现特异性 ,而对照载体质粒及鸡痘病毒 (FPV 2 82 E4 )的核酸均呈阴性 ;敏感性检测表明 ,该探针对同源 DNA的检出限量为 4 0 pg。应用该探针对含 NDV F基因的重组鸡痘病毒 v FV2 82进行杂交检测 ,结果呈阳性。以上结果表明 ,该探针可成功用于含 NDV F基因的重组鸡痘病毒的鉴定 相似文献
7.
将提纯的貂肠炎病毒(MEV)中间复制型DNA(RF-DNA),以HinaⅡ酶切,回收0.7kbC片段并克隆至质粒pBR322中,构成重组质粒pBM,经转化大肠杆菌RRⅠ并扩增后,提纯pBM,酶切电泳回收克隆的C片段,以[α-32P]dATP标记C片段和pBM,用光生物素标记pBM,分别制成放射性同位素和光生物素核酸探针。采用打点杂交技术检测了5种肉食兽细小病毒的细胞培养物和非细小病毒科5种病毒的细胞培养物,同时检测了貂和犬的粪便样品33份。结果表明,32P标记的C片段和pBM探针与光生物素际记的pBM探针均具有相同的杂交特异性,与5种肉食兽细小病毒及感染细小病毒的貂、犬粪样呈杂交阳性反应,与其他科病毒及健貂、犬粪样呈阴性。同位素32P和光生物素标记探针分别检出1 pg和10 pg貂肠炎病毒RF-DNA,敏感性比血凝试验分别离100倍和10倍。 相似文献
8.
用地高辛标记核酸探针检测猪细小病毒的研究 总被引：3，自引：0，他引：3
根据猪细小病毒(PPV)基因组序列,设计引物克隆了PPV YK株保守序列NS1基因,将NS1基因纯化,利用地高辛标记制备了NS1基因PCR产物探针和克隆NS1探针,两种核酸探针的标记都达到了0.1 pg/μL。特异性试验结果表明,这两种探针都能与PPV DNA发生特异的阳性杂交,而与对照的PRV、PCV、PRRSV和HCV的核酸杂交呈阴性。敏感性试验结果表明,克隆NS1探针敏感度为0.5 pg/μL,NS1基因PCR产物探针敏感度为1 pg/μL。综上所述,这两种DIG标记探针特异性强,敏感性高,可用于PPV的检测。 相似文献
9.
根据GenBank中已经发表的B亚型禽偏肺病毒F基因的保守序列设计并合成1对引物,利用RT—PCR扩增出1条与目的片段大小一致的725bp基因片段,回收、纯化PCR产物,用地高辛标记,制备出地高辛标记的aMPV核酸探针。特异性检测结果表明,该探针能与aMPV核酸发生特异性杂交,而与H9N2亚型AIV、NDV、IBV、ORT和E．coil的核酸杂交反应均为阴性;敏感性检测结果表明,该探针对aMPV的最低检出量为5Pg。应用制备的探针对山东省不同地区的605份商品肉鸡和122份商品肉鸭进行了核酸探针检测,阳性检出率分别为36．59％和34．51％。本试验制备的aMPV地高辛探针特异性强、敏感性好,对样品的检测结果表明山东省部分地区的商品肉鸡、肉鸭中普遍存在aMPV感染。 相似文献
10.
用地高辛标记的核酸探针检测猪伪狂犬病毒野毒感染的研究 总被引：2，自引：0，他引：2
利用PCR技术从带有伪狂犬病毒（PRV）gE基因的重组质粒pMD18-T-gE中扩增回收约304bp大小的片段,并制备出地高辛标记的gE基因核酸探针。特异性检测结果表明,该探针能与重组质粒DNA发生特异性杂交,而与对照的PRVBartha-k61株疫苗毒DNA、猪细小病毒（PPV）DNA、猪圆环病毒（PCV）DNA、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRsV）cDNA、猪瘟病毒（CSFV）cDNA的杂交反应均为阴性;敏感性检测结果表明,该探针对PRV野毒的最低检出量为4pg。应用该探针对11份繁殖障碍病料进行了杂交检测,共检出4份阳性病料,该结果与PCR检测结果一致,表明该核酸探针可用于猪伪狂犬病野毒感染的临床诊断。 相似文献
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探针检测鸭黄病毒的地高辛标记DNA的制备与应用 总被引：1，自引：0，他引：1
利用RT-PCR方法扩增鸭黄病毒的NS3基因406bp的特异性片段,回收并纯化PCR产物,用地高辛标记,制备核酸探针。特异性试验结果表明,该探针仅与鸭黄病毒的核酸特异性杂交,而与鸭瘟病毒、H9N2禽流感病毒、新城疫病毒、传染性法氏囊病病毒、减蛋综合征病毒的核酸杂交均为阴性。敏感性试验表明,该探针对鸭黄病毒的RNA最低检出限量为100μg/L。对疑似黄病毒感染鸭的肝脏、肺脏、脾脏、输卵管、卵泡膜和泄殖腔棉拭子进行检测,以卵泡膜的检出率最高。该研究为鸭黄病毒感染的诊断和流行病学调查提供了一种可靠的方法。 相似文献
12.
鹅细小病毒和番鸭细小病毒双重PCR检测方法的建立 总被引：1，自引：0，他引：1
根据GenBank上登录的鹅细小病毒(GPV)和番鸭细小病毒(MDPV)基因序列,分别设计合成针对GPV非结构蛋白(NS)和MDPV NS2-VP1基因片段的2对引物GPV U/L和MDPV U/L,将GPV和MDPV提取核酸混合后作为模板,优化PCR反应条件,建立了能同时检测这2种病毒的双重PCR。特异性试验结果显示,引物GPV U/L仅特异性扩增出GPV-GZ1和GPV-GZ2株730bp核酸片段,引物MDPVU/L仅特异性扩增出MDPV的624bp核酸片段,双重PCR扩增出长度分别为730bp和624bp的2条特异性片段,而扩增鸭瘟病毒(DPV)和鹅副黏病毒(GPMV)的核酸扩增结果均为阴性。敏感性试验结果显示,双重PCR能同时检测到14.4pg的GPV核酸和28.8pg的MDPV核酸。结果表明,建立的双重PCR可用于GPV和MDPV的鉴别诊断和联合检测。 相似文献
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二重PCR检测鸭瘟病毒和鹅细小病毒的初步研究 总被引：1，自引：0，他引：1
根据鸭瘟病毒(Duck plague virus,DPV)DNA聚合酶基因和鹅细小病毒(Goose parvovirus,GPV)NS基因序列分别设计2对引物,应用这2对引物对混合样品中鸭瘟病毒和鹅细小病毒进行了二重PCR扩增。PCR产物的琼脂糖凝胶电泳结果表明2条特异性带为563bp(DPV)和1146bp(GPV),与实验设计相符,且与常规单一PCR结果一致。二重PCR反应检测出的DPV含量相当于20个PFU;检测出的GPV含量相当于0.1个ELD50,对禽痘病毒和减蛋综合征病毒的核酸未能扩增出任何条带,特异性良好。该二重PCR能够在一次扩增反应中检测两种病毒,为两种鹅病的病原检测和诊断提供了一种简便、经济、快速的手段。 相似文献
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鸡致病性外源性禽白血病病毒特异性核酸探针交叉斑点杂交检测试剂盒的研制 总被引：1，自引：0，他引：1
用特定引物通过PCR合成了经地高辛标记的鸡致病性外源性及内源性禽白血病病毒特异性核酸探针,通过交叉斑点分子杂交,这些探针将可用于检测病料样品中致病性外源性禽白血病毒特异性核酸的存在。利用此试剂盒,对从病料组织样品中提取的基因组DNA作交叉斑点分子杂交或对提取的DNA用相应引物扩增后的PCR产物作交叉斑点分子杂交,可在24～36h内完成检测并报告结果。 相似文献
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感染细胞与痘疹样本中山羊痘病毒PCR检测方法的建立 总被引：1，自引：0，他引：1
比较Trizol法和SDS-蛋白酶K法提取山羊痘病毒DNA后,根据山羊痘病毒P32基因设计引物,建立了能检测感染细胞培养物与组织病料的PCR方法,结果显示以SDS-蛋白酶K法提取的病毒DNA在含量与纯度上均明显高于Trizol法;该PCR方法对山羊痘标准毒株细胞感染物能扩增出特异性的DNA条带,最小检出量为40.625ng;且能检出山羊痘疫苗毒Y株、贵州现场分离毒LD株和QL株的细胞感染物以及山羊痘疹样本中病毒DNA,而对鸡痘疫苗毒株感染细胞、正常细胞及正常山羊皮肤均为阴性反应。这些结果表明,建立的PCR方法具有特异性强、可靠性好、灵敏度高等特点,可用于山羊痘的临床诊断。 相似文献
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Development of a specific biotinylated DNA probe for the detection of Renibacterium salmoninarum. 
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下载免费PDF全文 H Hariharan B Qian B Despres F S Kibenge S B Heaney D J Rainnie 《Canadian journal of veterinary research》1995,59(4):306-310
A specific DNA probe for the identification of Renibacterium salmoninarum, the causative agent of bacterial kidney disease (BKD), was developed from one of 3 clones pRS47, pRS49, and pRS26 of 5.1 kb, 5.3 kb, and 11.3 kb, respectively. The biotinylated pRS47/BamHI insert probe was tested on 3 dilutions of DNA extracted from 3 strains of R. salmoninarum and from 1 strain each of Arthrobacter protophormiae, Aeromonas salmonicida, Corynebacterium aquaticum, Carnobacterium piscicola, Listonella anguillarum, Micrococcus luteus, Pseudomonas fluorescens, Vibrio ordalii, and Yersinia ruckeri. In a dot blot assay, this probe hybridized only with the DNA from the R. salmoninarum strains. When used on kidney samples from fish challenged with R. salmoninarum, the dot blot hybridization assay with the probe was found to be as sensitive as culture. In a fluorescent antibody test, samples that were negative in culture and dot blot hybridization showed no more than one fluorescing cell in 50 microscopic fields examined. This DNA probe, therefore, has the potential for use in the diagnosis of BKD of fish. 相似文献
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斑点杂交法在鸡毒支原体污染检测中的应用 总被引：1，自引：0，他引：1
试验根据GenBank中登录的鸡毒支原体16S rRNA基因序列,用DNAStar和Primer 5.0软件自行设计探针,并进行地高辛标记。采用带正电的尼龙膜对提取的鸡毒支原体DNA进行斑点杂交反应,建立最佳的反应条件,并采用建立的条件对市场上随机购买的鸡新城疫活疫苗进行检测。结果显示,运用斑点杂交反应可以从疫苗样品中检测到支原体的污染,检出率为23.3%(7/30)。表明该方法快速、特异性、敏感性高,对生物制品中支原体污染的快速检测具有较高的应用价值。 相似文献
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Infectious hypodermal and hematopoietic necrosis virus is the causative agent of a shrimp disease which causes economic losses on a global scale. A pair of primers, I2814F/I3516R, was designed from the IHHNV genomic sequence (GenBank) that encodes for structural protein corresponding to nucleotides 2814-3516, which amplifies a 703 base pair (bp) region from the virus genome. PCR amplification with the primers generated a product of the expected size from the purified IHHNV DNA of Litopenaeus vannamei and IHHNV-infected penaeid populations but not from the IHHNV-free shrimp, white spot syndrome virus (WSSV) and hepatopancreatic parvovirus (HPV). The PCR amplicon described above was labeled with digoxigenin (DIG)-11-dUTP as a probe used for dot blot hybridization and in situ hybridization test. Under the optimized PCR conditions, the primers were detected by as little as 20 fg of purified IHHNV DNA, which contained only 8.83 x 10(3) copies of IHHNV, a 1000-fold greater than using dot blot hybridization. Sections of histopathology showed eosinophilic intranuclear inclusions (Cowdry type A inclusions or CAIs) in infected tissues while in situ hybridization, cells displayed an intense reaction with the DIG-labeled probe. PCR assay was developed to detect IHHNV in penaeid shrimp and other crustaceans from the rearing ponds of China (March 2001-June 2004). The positive rate was 51.5% (154 out of 299) and 8.3% (2 out of 24) for penaeid shrimp and crab samples, respectively. The survey demonstrated the presence of IHHNV in China. 相似文献