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小麦EST-SSRs分子标记的特性及其遗传作图 总被引：1，自引：0，他引：1
为了解普通小麦EST来源的微卫星的多样性,从大约1 000个包含微卫星的ESTs中设计了300对引物,研究和评估了它们的多态性水平,并且将多态性标记加入到现有的遗传图谱中.在五种不同类型的重复单元中,三个碱基的重复单元出现最多,占到77%.几乎所有的EST SSRs标记(99.3%)的重复单元都含有G-C碱基对.37.4%的微卫星都是四次重复.对于扩增和多态性,300对引物中有60对没有扩增,21.3%的扩增引物没能产生预期的扩增片断.58%的标记至少在所用8个材料的一个中显示出多态性.W7984和Opata组合表现出最高的多态性水平.大多数普通小麦EST-SSRs标记的重复次数小于10,并且4次重复是最为普遍的.81个新的EST-SSR位点被添加到两个已有的参照遗传图谱中(62个加到ITMI,19个加到CTCS).研究结果表明小麦EST-SSRs标记展示了一些不同于基因组微卫星的特异特征,在标记发展和其他遗传应用中,这就使得它们能够成为一种非常有价值的资源. 相似文献
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表达序列标签（expressed sequence tags,EST）是开发SSR标记的重要资源.本研究从NCBI中大麻EST数据库中检索到1114个SSR,分布于989条EST序列中,占EST总数的7.66％.其中三、六核苷酸重复基元类型居多,分别占EST-SSR总数的39.84％和34.56％,统计得到三核苷酸重复类型47种,六核苷酸重复类型113种.利用部分EST-SSR序列设计49对SSR引物,其中40对引物有扩增产物,占所设计引物总数的81.63％.进一步用这些引物在24个大麻品种进行多态性检测,29对引物显示多态性,占可扩增引物的72.5％.利用E-7、E-8、E-11、E-18、E-21、E-39及E-48共7对引物构建了24份供试材料的SSR指纹图谱.本研究结果证明了基于大麻EST信息建立SSR标记是一种有效而又可行的方法,并且为这些品种的真伪鉴定和保护提供科学依据. 相似文献
3.
甜菜EST-SSR引物的开发与应用 总被引：3，自引：0，他引：3
利用NCBI公共数据库现有的甜菜(Beta vulgaris L.)表达序列标签(expressed sequence tags,EST)数据信息,开发了甜菜EST-SSR标记。在所有的29830条甜菜EST序列中共确认得到20109条非冗余EST序列,总长为11287.6kb。在含有微卫星重复的6951条EST序列中按照SSR引物设计要求,最终获得了2845个EST-SSR,平均每3.96 kb含有1个SSR。EST-SSR的分布频率和特征分析表明,A/T单碱基重复最多,其次是AAG/CTT三核苷酸重复,AG/CT二核苷酸重复,ACCTCC/AGGTGG等六核苷酸重复最少。随机合成了100对SSR引物,并分别选用6个甜菜品种进行多态性检验,将其按遗传相似性分为两组,多态信息含量(polymorphism information content,PIC)平均值为0.47。本研究证实这种全新的开发甜菜SSR标记的方法具有高效、多态性较高的特点,在甜菜遗传多样性分析、功能基因定位、遗传图谱构建以及比较基因组等研究方面有广阔的利用前景。 相似文献
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橡胶树EST-SSRs发掘研究 总被引：6，自引：2，他引：4
随着橡胶树大量ESTs序列的产生,为EST-SSRs发掘提供了丰富的公共序列资源.本研究首先将11 809条橡胶树ESTs组装成3 932条非冗余序列,其中323条ESTs检索到SSRs 358个,SSRs出现的频率为9.1%.SSR重复单元共93种.其中二核苷酸重复(57.5%)、三核苷酸重复(26.0%)和六核苷酸重复(12.8%)占所有重复单元的96.3%.对323条SSR-ESTs进行特异扩增弓l物设计,共获得158对引物,对48份包括31份魏可汉种质、12份1981'野生种质、2份色宝橡胶、2份光亮橡胶和l份少花橡胶扩增,其中60对引物扩增出l条预期长度DNA片段,占所有设计引物的38%,并筛选到40对具有多态性的引物.EST-SSRs标记的发掘为巴西橡胶树分子辅助育种、种质资源功能遗传多样性分析等研究提供了良好的标记. 相似文献
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小麦-黑麦双二倍体形成过程中微卫星序列的变化 总被引：2，自引：1，他引：1
为了探索小麦-黑麦双二倍体形成过程中微卫星序列的变异情况,为异源多倍体进化及小麦育种研究提供理论参考,以来源于3个组合的小麦-黑麦杂交后代植株及亲本小麦、黑麦为材料,利用已有的小麦和黑麦微卫星标记调查小麦-黑麦双二倍体形成过程中微卫星序列的变化.结果表明,所用的126对小麦SSR引物中,除22对没有扩增出产物外,其余104对引物从每个组合的后代植株中扩增的带型与从其亲本小麦中扩增的带型完全相同.所用的27对黑麦SSR引物中,10对引物从每个组合的后代植株中扩增的带型与其从亲本黑麦中扩增的带型完全相同,10对引物在亲本黑麦、F1植株及3个双二倍体植株之间表现出了多态性,7对引物从亲本黑麦中扩增的条带在所有后代中缺失.说明小麦-黑麦异源多倍体化过程中小麦微卫星序列是相对稳定的,而黑麦微卫星序列比小麦微卫星序列更易受到异源多倍体化的影响.微卫星序列变化是伴随多倍体体化而快速发生的. 相似文献
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利用RAPD和微卫星标记对协优杂交稻及其亲本进行区别与鉴定 总被引：14，自引：2，他引：12
选用400个随机寡核苷酸和40个荧光标记的微卫星引物对,对我国主栽的协优杂交稻组合及其亲本进行多态性分析。RAPD分析显示,400个随机寡核苷酸引物中,有364个能够在供试基因型材料中扩增出肉眼可见的DNA条带,其中28个显示扩增的多态性,这中间9个引物产生的13条多态性条带具有清晰、易分辨的特点,可以在供试的水稻组合与亲本之间,以及杂交组合之间进行区别和鉴定。微卫星分析指出,40对荧光标记引物中,13对引物产生的31条标记带,能够在供试基因型材料中显示稳定的多态性,且杂种表现为双亲的互补型。与RAPD相比,微卫星分析具有多态性强、精确性高和重复性好的特点。 相似文献
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油菜与诸葛菜的几种分子标记比较研究 总被引：2，自引：0，他引：2
利用分子标记（随机引物，简单重复序列，微卫星DNA重复序列，rDNA-ITS)比较研究了白菜型油菜与诸葛菜的亲缘关系。RAPD分析表明，诸葛菜与白菜型油菜PCR产物相似性只有10％左右；简单重复序列（SSRs)标记中引物B.n.12A的PCR产的表明诸葛菜与白菜型油菜有明显差异，诸葛菜没有扩增产物，白菜型油菜具有明显的扩增产物；引物ITS4－IT5的PCR产物也有明显的差异。这些结果说明白菜型油菜与诸葛菜的亲缘关系不是很近。结合其他学者的工作，讨论了甘蓝型油菜，芥菜型油菜与诸葛菜的亲缘关系。 相似文献
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大豆EST-SSR标记开发及与Genomic-SSR的比较研究* 总被引：9，自引：0，他引：9
本研究对458220条大豆EST序列进行SSR搜索,共检测出EST-SSR序列39989条, 经拼接得到无冗余EST-SSR序列8190条,包括357种重复基元。其中二、三核苷酸重复基元类型居多,分别占无冗余EST总数的11.13%和16%,统计得到二核苷酸重复类型12种,三核苷酸重复类型60种。以含有简单重复序列的无冗余EST序列设计200对引物,其中148对引物有清晰且单一条带扩增产物,以30份大豆品种资源进行引物筛选,获得多态性引物31对。以21份大豆不同基因型的基因组DNA为模板选取30对显示多态性的大豆EST-SSR引物和30对大豆基因组SSR引物进行扩增,带型统计结果显示：大豆EST-SSR与基因组SSR在供试基因型间多态性指数均值分别为0.55 和0.44,二者揭示的多态性水平差异不大。从而说明利用生物信息学方法基于大豆EST开发SSR标记是切实可行的,大豆EST-SSR可以用于大豆遗传多样性分析,是大豆DNA分子标记体系的一个重要补充。 相似文献
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植物分子标记技术原理及其在茶树育种中的应用 总被引：15，自引：1，他引：15
本简述了限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism，RFLP)、随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA，RAPD)、任意引物PCR(Abitray Primer-PCR，APPCR)微卫星(microsatellite)或称简单序列重复(simple sequence repeat，SSR)、简单重复间序列ISSR(Inter-Simple Sequence Repeat)、序列标签位点(sequence tagged site，STS)技术和割裂扩增多态性(Cleaved Amplified Polymorphic Sequence，CAPS)技术，扩增片段长度多态性(amplIfied fragment length polymorphism，AFLP)等植物分子标记技术原理，综述了该技术在茶树分类学及遗传多样性的研究、品种鉴定和亲缘关系鉴定、构建茶树的遗传图谱以及分子标记辅助育种等方面的应用现状。 相似文献
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花生EST资源的SSR信息分析 总被引：6，自引：0，他引：6
微卫星或简单重复序列(simple sequence repeats,SSR)存在于表达序列标签(expressedsequence tags,ESTs)中。为了在花生中开发EST-SSR功能性标记,利用生物信息学对NCBI公共数据库中的41501条花生ESTs序列进行EST-SSRs特征分析。剔除冗余序列,得到全长为5125.94kb的无冗余EST8391条。在这些序列中搜索出1109个SSR,分布于946条EST中,出现频率是11.27%。这些EST-SSR的平均长度为18.16bp,平均分布频率1/4.62kb。在1～6bp的重复基元中,三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高(49.23%),其次是二核苷酸(32.83%)、单核苷酸(14.88%)。AG/CT和AAG/CTT是二、三核苷酸中的优势重复基元,分别占二、三核苷酸重复的71.43%和31.50%。本研究为开发多态性花生微卫星标记提供了候选序列。 相似文献
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2017—2018年,在同安镇粮食产能区示范推广水稻病虫害绿色防控与统防统治融合技术模式,取得了显著成效。融合技术示范区比常规区减少用药2~3次,用药量减少37.6%,防治成本降低400元/hm^2;水稻产量增加12.8%,收益增加2 835元/hm^2。 相似文献
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《Journal of Crop Improvement》2013,27(1):313-324
Summary Arbuscular mycorrhizae were inoculated into phosphorus-deficient soil fertilized with either organic or chemical fertilizer with cucumber (Cucumis sativus L.) as the first crop and lettuce (Lactu-ca sativa L.) as the second crop but without additional fertilization and AM inoculation. AM increased dry matter and fruit yield of cucumber significantly in the unfertilized, organic-fertilized and P-deficient plants compared with the fully chemical-fertilized plants. AM inoculation increased the available phosphorus in plant and soil by around 30% for all treatments except for those chemically-fertilized. The rate of AM infection did not differ significantly among the fertilization treatments, but the infection intensity was higher in unfertilized, organic-fertilized and phosphorus-deficient treatments than chemical-fertilized treatment. The residual effects of AM-inoculated to cucumber were evident for lettuce in all pre-treatments that were unfertilized and un-inoculated for the second cropping. Without P-fertilization, neither crop could grow optimally even when the soil was inoculated with AM, suggesting that AM could not serve as a substitute for phosphorus fertilizer. However, the other beneficial effects of AM on crop growth and yield could not be fulfilled with phosphorus fertilizer. 相似文献
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百香果是海南省的新兴产业,也是我国多个省区扶贫攻坚的重要产业。病虫害是影响百香果产业的重要因素,随着海南百香果种植面积越来越大,病虫害对百香果产业的不利影响越来越凸显。由于缺乏百香果病虫害种类调查鉴定的基础性研究,许多种植户对田间发生的病虫害种类识别不足,从而影响了百香果病虫害的防控效果。为了摸清海南百香果种植区的病虫害种类,于2019—2021年对海南省儋州市、乐东县、屯昌县、文昌市、三亚市、东方市、保亭县、白沙县、海口市等百香果种植区的病虫害进行了系统调查与鉴定,并对其发生危害特点进行了研究。鉴定发现海南百香果种植区的病害有11种,分别是病毒病、茎基腐病、炭疽病、疮痂病、疫病、灰霉病、果腐病、褐斑病、烟煤病、藻斑病和缺镁。重要病害为病毒病和茎基腐病,危害程度分别为4级和3级,炭疽病和疮痂病危害也较重,危害程度均为2级,其他病害危害较轻。害虫有28种,分别是黄胸蓟马、茶黄蓟马、红带蓟马、美洲棘蓟马、普通大蓟马、咖啡木蠹蛾、美洲斑潜蝇、橘小实蝇、斜纹夜蛾、双线盗毒蛾、绿丽刺蛾、白带锯蛱蝶、烟粉虱、温室白粉虱、柑橘粉蚧、木槿曼粉蚧、藤壶蜡蚧、茶角盲蝽、樟颈曼盲蝽、稻绿蝽、中稻缘蝽、茶小绿叶蝉、丽球瓢蜡蝉、绿鳞象甲、眼斑芫菁、白条豆芫菁、甘薯梳龟甲和朱砂叶螨。重要害虫为黄胸蓟马和咖啡木蠹蛾,危害程度均为3级,茶黄蓟马和美洲斑潜蝇的危害也较重,危害程度均为2级,其他害虫危害较轻。软体动物3种,分别是灰巴蜗牛、同型巴蜗牛和一种尚未鉴定的蛞蝓。本研究明确了海南百香果种植区病虫害具体种类,新发现百香果病害1种和害虫24种,为海南百香果病虫害的精准防控提供技术支撑。 相似文献
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Textile fibers were obtained from secondary polyethylene terephtalate (PET) and its mixtures with primary PET at initial orientation of 18000–33000 %, rate of additional orientation drawing 3.5–6.5 times and temperature of thermal fixation 363–413 K. The fibers’ tensile strength was found to decrease and elongation at break to increase with the decrease of their linear density under the conditions of fibers formation. For the fibers based on polymer mixtures, the presence of oxidized fragments in the secondary PET limited the compatibility of the two polymers which resulted in deteriorated tensile properties. The linear density (4–16 dtex), tensile strength (30–50 cN/tex) and elongation at break (20–60 %) of the PET fibers obtained were close to these for the industrially produced polymer fibers. The values of the average diameter of the fibers formed and oriented under laboratory conditions allows classifying them between the fine and the coarse textile fibers which makes them suitable for the textile industry. 相似文献
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为明确春季调控措施对冬小麦生长发育和籽粒产量的影响,以冬小麦品种石新828为材料进行田间试验,4个处理分别为:起身期追全部氮肥(除基肥外,下同)并叶面喷多效唑(N1);起身期追2/3氮肥并喷多效唑+拔节期追1/3氮肥(N2);起身期追1/3氮肥+拔节期追2/3氮肥(N3);拔节期追全部氮肥(N4)。生育期间测定群体和个体生育特性,成熟期调查产量性状。结果表明,N1和N2处理小麦拔节期的总茎数、叶面积指数(LAI)和干物质积累量均显著高于N4和N3处理。孕穗期N4和N3处理小麦的总茎数、LAI和干物质积累量显著高于N1和N2处理。开花到成熟期各处理的总茎数、LAI和干物质积累量差异均不显著。孕穗期前,不同处理的株高差异不显著,孕穗期后,N4处理的株高最高,且显著高于N1处理。各处理基部节间直径和中上部节间长的差异不显著,N4处理基部第一节间长度显著大于其他处理。随追氮时期前移或前期施氮量增多,不孕小穗数减少,结实小穗和穗粒数增加,N1比N4处理不孕小穗数显著减少,结实小穗和穗粒数显著增多。N1处理小麦成熟期的千粒重最高,且显著高于N4处理。N1处理的籽粒产量最高,且显著高于N3和N4处理。起身期追氮配合多效唑调控,可以获得比拔节期追氮更高的穗粒数和千粒重,从而获得更高的产量。 相似文献
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《Plant Production Science》2013,16(4):281-285
AbstractTwo cultivars of spinach and one cultivar of komatsuna were sand cultured using a nutrient solution with Na and K in various combinations. The growth (fresh weight of shoot) of spinach cv. Atlas was significantly increased when 1.4 mM KC1 of the 7 m M KO was replaced with 1.4 mM NaCl, although the growth was reduced when more KC1 was replaced with NaCl. In another spinach cv. All Right, however, NaCl substituting for 20% of KC1 showed no significant effects. In komatsuna, Na used in place of K at any ratio reduced the growth. The growth of spinach cv. Atlas was increased by applying 20 mM NaCl, irrespective of K dose (480 - 2400 mg K2O per 1/2000 a Wagner pot). The growth of spinach cv. All Right was also increased by 20 mM NaCl when K was at a deficient level (480 - 960 mg K20 per pot), but was not when K was at: an excessive level (1920 - 2400 mg K2O per pot). In komatsuna, 20 mM NaCl reduced the growth. In spinach, Na prevented the decrease of the photosynthetic rate and stomatal conductance caused by K deficiency. 相似文献
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Gas-exchange characteristics of potato (Solanum tuberosum L.) canopies were determined with crop enclosures under condition of optimal water supply, during soil water depletion, and during recovery from drought-stress. The plants were grown under a rainshelter in large containers with 2-m2 surface area. Control plants received water throughout the growth period. In Expt. 1, transient drought was imposed by interrupting water supply completely for 22 days. During the 33-day period of drought treatment in Expt. 2, the stressed plants received half the amount of water that was given to the control plants (irrigations 2–3 times per week).
During soil water depletion, stomatal conductance of the canopy was reduced earlier and more than photosynthesis. This resulted in a lower internal carbon dioxide concentration in the leaves of stressed plants and a higher ratio between photosynthesis and stomatal conductance. The value of that ratio increased as soil water potential dropped.
Water-use efficiency ( ) increased during drought stress. The cultivar Bintje showed a larger ratio between photosynthesis and stomatal conductance of the canopy and a higher than cv. Saturna, both for optimal water supply and during drought stress.
Photosynthesis and conductance of the canopy started to recover immediately upon rewatering, even when relative values had declined to 20–30% during the preceding stress period. After release from stress, the leaves in the top layer of the canopy had a higher stomatal conductance in treated plants than in control plants. 相似文献
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本文建立了气质联用仪测定稻田环境中苯醚甲环唑和嘧菌酯的残留分析方法,对苯醚甲环唑和嘧菌酯在水稻、土壤和田水中的消解动态和残留规律进行了研究。苯醚甲环唑和嘧菌酯在糙米、稻壳、植株、土壤和田水中的最低检测浓度均为0.20 mg/kg,最小检出量为0.2 ng,在不同样品中的平均加标回收率为80.8%~109.5%,相对标准偏差在1.7%~19.7%之间。田间试验结果表明,苯醚甲环唑和嘧菌酯在水稻植株和田水中的残留消解动态规律均符合一级动力学反应模型,苯醚甲环唑在水稻植株和田水中的残留消解半衰期分别为6.3~11.6 d和1.4~11.6 d;嘧菌酯在水稻植株和田水中的残留消解半衰期分别为3.6~8.7 d和2.9~23.1 d。以推荐剂量600 g/hm2和1.5倍推荐剂量900 g/hm2,最多施药3次,距最后一次施药15 d时,苯醚甲环唑和嘧菌酯在糙米中的最高残留量分别为0.461 mg/kg和0.634 mg/kg,低于我国国家标准《食品中农药最大残留限量》(GB2763-2014)中规定的糙米中苯醚甲环唑最大残留限量0.5 mg/kg和欧盟、美国规定的糙米中嘧菌酯最大残留限量5.0 mg/kg。 相似文献