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1.
采用PCR-RFLP分析方法,对洞庭湖、武汉两地的二倍体和四倍体泥鳅线粒体DNAND-5/6基因多态性及4个群体遗传变异和遗传关系进行了研究。结果表明,120尾泥鳅mtDNAND-5/6扩增片段长度均为2.2kb;从13种限制性内切核酸酶中筛选出6种多态性内切酶(HaeⅢ、DraⅠ、RsaⅠ、TaqⅠ、HinfⅠ、MspⅠ),对扩增产物进行酶切,共检测到66种单倍型。泥鳅群体内单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.7679～0.9385和0.01041～0.03212;其中,洞庭湖二倍体核苷酸多样性最高(0.03212),武汉二倍体其次(0.02452),二倍体群体内核苷酸多样性高于四倍体。群体间的核苷酸多样性(π)大小为0.02588～0.04144,平均值为(0.031737±0.000005)。群体间的核苷酸歧化距离(δ)大小为0.00462～0.01617,平均值为(0.010659±0.000003);其中,武汉二倍体和四倍体之间的核苷酸歧化距离最大(0.01617),武汉四倍体和洞庭湖二倍体之间的核苷酸歧化距离最小(0.00462)。MonteCarlo模拟x2检验表明,4个群体间的单倍型频率存在极显著差异(P<0.0001)。UPGMA聚类分析表明,武汉四倍体、洞庭湖二倍体和四倍体聚为一支,亲缘关系较近;武汉二倍体为单独一支。 相似文献
2.
采用PCR-RFLP方法,对采自安徽怀远、河南范县及安徽舒城的3个群体共112尾泥鳅(Misgurnus anguilli-caudatus)线粒体DNA(mtDNA)的D-loop区段进行PCR扩增,使用11种核酸限制性内切酶进行酶切。结果显示,在11种内切酶中,8种有酶切位点,4种存在个体间变异,共产生7种单倍型。怀远、范县和舒城群体的核苷酸多样性指数为0.0033、0.0083、0.0011,单倍型多样性指数分别为0.6048、0.8370、0.2344。范县与怀远、舒城群体间的Rogers遗传距离分别为0.3456和0.6847,怀远和舒城群体间的Rogers遗传距离为0.6326。SspⅠ的酶切类型C组成的单倍型在舒城群体中占87.5%,而在范县群体中为0;同时发现,SspⅠ的酶切类型C、D和XspⅠ的酶切类型B分别组成的单倍型仅在范县群体中存在。 相似文献
3.
采用PCR-RFLP方法,对采自安徽怀远、河南范县及安徽舒城的3个群体共112尾泥鳅（Misgurnus anguilli-caudatus）线粒体DNA（mtDNA）的D-loop区段进行PCR扩增,使用11种核酸限制性内切酶进行酶切。结果显示,在11种内切酶中,8种有酶切位点,4种存在个体间变异,共产生7种单倍型。怀远、范县和舒城群体的核苷酸多样性指数为0.0033、0.0083、0.0011,单倍型多样性指数分别为0.6048、0.8370、0.2344。范县与怀远、舒城群体间的Rogers遗传距离分别为0.3456和0.6847,怀远和舒城群体间的Rogers遗传距离为0.6326。SspⅠ的酶切类型C组成的单倍型在舒城群体中占87.5%,而在范县群体中为0;同时发现,SspⅠ的酶切类型C、D和XspⅠ的酶切类型B分别组成的单倍型仅在范县群体中存在。 相似文献
4.
3个群体草鱼mtDNA D-Loop的PCR-RFLP分析 总被引：10，自引：0，他引：10
采用PCR技术对江西瑞昌、湖南长沙、天津宁河3个群体的144尾草鱼线粒体DNA（mtDNA）D—Loop区段的限制性片段长度多态性（RFLP）进行了分析。PCR扩增出的mtDNA D—Loop区段，用11种核酸内切限制酶酶切。结果显示：扩增出的142尾试验鱼的mtDNA D-Loop区段为1．6kbp，长沙群体中的两尾为1．8khp，个体间存在长度变异现象；6种限制酶具有酶切位点，共检测到两种单倍型，其中长沙群体中有长度变异的两尾为一种单倍型，142尾为另一种单倍型；瑞昌和宁河两群体内的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数均为0，长沙群体内的分别为0．0816、0．00315；长沙群体与瑞昌（或宁河）群体间的核苷酸歧化距离以及Rogers遗传距离分别为0．0000343和0．6783；X^2检验结果显示3个群体间的遗传差异不显著（P〉0．05）。表明离草鱼mtDNA D—Loop区段的遗传多样性很低。 相似文献
5.
为评估泥鳅、大鳞副泥鳅选育群体的遗传育种潜力,通过聚合酶链反应(PCR)扩增和一代测序技术,获得经两代群体选育的泥鳅自繁(M)、大鳞副泥鳅自繁(P)及其正交(MP)、反交(PM)等4个子代泥鳅种群的线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ基因COⅠ片段,并分析了其遗传多样性和群体结构。结果显示：(1)4种泥鳅的COⅠ基因片段碱基组成相似,均表现为A+T的含量(54.0%～56.2%)高于C+G的含量(43.8%～46.4%);(2)4种泥鳅COⅠ基因片段的682个位点中,共检测到135个多态位点(占19.79%),其中128个为简约信息位点,7个为单碱基变异位点,变异均为转换或颠换,未发现碱基的插入与缺失;(3)M、P、MP、PM各定义15个单倍型,单倍型多态性均为1.000±0.024,核苷酸多态性分别为0.020 66±0.006 48、0.025 80±0.002 31、0.029 61±0.005 62和0.022 30±0.001 94,均具有高单倍型多样性和高核苷酸多态性;(4)M、P、MP、PM种内遗传距离分别为0～0.020、0～0.024、0～0.027和0～0.023,种间遗传距... 相似文献
6.
4个群体鲢mtDNA D-loop的PCR-RFLP分析 总被引：1，自引：0，他引：1
采用PCR技术扩增了湖北监利、江西瑞昌、湖南长沙3个长江野生群体和天津宁河1个人工繁殖群体(已繁殖6代)共158尾鲢(Hypophthalmichthys molitrix)mtDNA D-loop区段,并用14种核酸内切限制酶对扩增片段进行酶切。结果显示:所有试验鱼均扩增出约1.6 kb的DNA片段,10种限制酶有酶切位点,共检测出16种单倍型,以单倍型Ⅰ为主,在各群体中所占比例为57.5%~90.0%。鲢4个群体的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数为0.1885~0.6526和0.001182~0.007570。瑞昌群体与监利群体的Rogers遗传距最小,为0.1250;监利群体与宁河群体的Rogers遗传距最大,为0.2693。χ2检验结果显示4个群体间的遗传差异显著(P<0.01)。在4个群体中,宁河人工繁殖群体的单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数均最高,并且HinfⅠ的C酶切类型为宁河群体所特有,达20.0%。 相似文献
7.
采用PCR技术对乌克兰鳞鲤、德国镜鲤、框鳞镜鲤、红镜鲤和州河鲤共97尾个体的线粒体DNA D-loop及邻近区段进行了扩增,经测序后获得碱基顺序排列清晰的DNA片段,长度分别为1342、1343、1344 bp。共得到8种单倍型(GenBank序列号为MG786481~MG786483,MG786485~MG786487,KC292935,KC292936)。使用Mega 6.0软件计算出5个群体的组内及组间遗传距离,并构建邻接系统树。线粒体DNA D-loop及邻近区段、单独D-loop区段的碱基序列分析结果表明,单倍型Ⅰ至Ⅳ为欧洲血统,碱基差异位点数较多,变异程度较高;单倍型Ⅴ至Ⅷ为亚洲血统,碱基差异位点数较少,变异程度较低。在线粒体DNA D-loop及邻近区段内,德国镜鲤组内平均遗传距离为0.00462,核苷酸多样性指数为0.00458,平均核苷酸差异性为6.150,遗传多样性最大;州河鲤组内的平均遗传距离为0.00065,核苷酸多样性指数为0.00065,平均核苷酸差异性为0.870,遗传多样性最低。 相似文献
8.
研究洞庭湖不同地理群体河蚬的遗传多样性和遗传结构,为其资源合理开发和有效保护提供参考。在6个样点共采集河蚬126只,以线粒体细胞色素b基因部分序列为分子标记,分析扩增与测序后基因序列的单倍型及多样性、核苷酸多样性,计算群体间遗传分化指数等。获得长531bp的序列片段,共检出5种单倍型,变异位点10个;平均单倍型多样性和核苷酸多样性分别为0.559和0.006。6个河蚬群体间的遗传距离为0.006~0.007;遗传分化指数和AMOVA分析显示,河蚬群体间遗传分化低,遗传变异主要来自群体个体内。最大似然法构建的系统进化树中,单倍型DTH1和DTH5聚为一支,DTH2、DTH3、DTH4聚为另一支。中性检验结果显示洞庭湖河蚬群体相对稳定,没有经历过瓶颈效应和突然的群体萎缩等历史事件。洞庭湖6个河蚬群体间不存在显著的遗传差异,可将其作为一个整体进行管理和保护。 相似文献
9.
为了解江苏省主要湖泊内太湖新银鱼(Neosalanx taihuensis)的遗传背景,利用PCR扩增江苏省太湖、高邮湖、洪泽湖和骆马湖4个群体153尾样本的COⅠ基因序列,并进行测序和分析。经比对获得630 bp的基因序列片段,检出7个变异位点,其中简约位点3个,单一位点4个。153尾个体共定义9个单倍型,单倍型多样性为0.580±0.022(0.050±0.047～0.361±0.103),核苷酸多样性为0.001 06±0.000 07(0.000 08±0.000 07～0.000 62±0.000 20),呈现出较低的单倍型多样性和核苷酸多样性的特点。4个群体间的遗传距离为0.000 12～0.001 83。AMOVA分子方差分析表明,太湖新银鱼群体间的遗传差异(76.84%)大于群体内遗传差异(23.16%),遗传变异主要来自群体间。种群间遗传分化系数统计检验表明,太湖和洪泽湖群体及高邮湖和骆马湖群体之间差异不显著。中性检验和歧点分布分析表明,4个太湖新银鱼种群偏离中性进化,历史上经历过种群扩张。研究可为太湖新银鱼种质资源科学保护和合理利用提供理论依据。 相似文献
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运用mtDNAPCR RFLP技术对位于长江中游的洞庭湖、涨渡湖、长湖黄颡鱼(Pelteobagrusfulvidraco)自然群体的种群遗传结构进行比较分析。PCR技术扩增出黄颡鱼mtDNAND1/2基因,选用8种限制性内切酶对PCR产物进行酶切,3个群体的黄颡鱼共检出15种单倍型,单倍型间的遗传距离为0 20%～2 08%(0 8135%±0 4095%)。各不同群体的单倍型在系统树上有部分交叉,虽然不同群体在各单倍型中出现的频率有所不同,但每个群体都和其他群体存在共有的单倍型。尽管单倍型的分布或结构有所不同,但种群间的遗传距离不大,与通江型湖泊相比,两个阻隔型湖泊间的遗传距离更为接近。 相似文献
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在室内控温水族箱中设6℃、11℃、16℃和21℃四个水温组,饲养7周,研究了初始体重为1.72±0.24g的细鳞鱼（Brachymystax lenok）幼鱼摄食和生长的最适水温。结果表明,16℃时细鳞鱼的特定生长率（SGR）、日增重（DWG）、食物转化率（FCE）和摄食率（FI）显著高于其他处理组。这些参数与水温（T）之间的相关关系可用二次回归曲线来描述,特定生长率与水温的回归方程为SGR=（-2.601）＋（0.887）T＋（-0.027）T2;摄食率与水温的回归方程为FI=（0.111）＋（0.292）T＋（-0.009）T2（P〈0.01,R=0.990）;食物转化率水温的回归方程为FCE=（52.828）＋（11.951）T＋（-0.393）T2。细鳞鱼在11～21℃都可以摄食生长,最适水温为15.20℃～16.43℃。 相似文献
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实验测定了黄金鲫血清中超氧化物歧化酶（SOD）、丙二醛（MDA）、过氧化氢酶（CAT）、碱性磷酸酶（AKP）、酸性磷酸酶（ACP）、丙氨酸氨基转移酶（ALT）、天门冬氨酸氨基转移酶（AST）、总胆红素（T －Bil）、直接胆红素（D－Bil）。结果显示：黄金鲫血清中丙二醛含量为（4．68±1．20）nmol／mL ,血清碱性磷酸酶（24．54±0．485）nmol／L ,血清酸性磷酸酶（1．40±0．138）U／L ,血清丙氨酸氨基转移酶（4．36±1．51）U／L ,血清天门冬氨酸氨基转移酶（45．39±29．29）U／L ,血清总胆红素（7．19±3．54）nmol／L ,血清直接胆红素（3．23±1．90） nmol／L ,血清超氧化物歧化酶（82．57±1．69）U／L ,血清过氧化氢酶（10．28±3．62）U／mL。 相似文献
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本文利用生物信息学软件分析了鲤（Cyprinus carpio）基因组中同源框基因Hoxa3a与多种鱼类及其它生物的同源性,构建了分子进化树。结果表明：鲤与斑马鱼（Danio rerio）的序列同源性最高为95%,与大西洋鲑（Salmo salar）等四种鱼类的同源性次之为84%,与米氏叶吻银鲛（Callorhinchus milii）和鳐（Leucoraja erinacea）的同源性最低为74.5%,与三种鸟类的同源性为75%左右。这结果也说明,Hox同源框基因序列在进化上高度保守。在序列比较的同时发现了2个鲤的SNP位点,T101C和A213G。上述研究结果,对于保护生物多样性（尤其是遗传多样性）的研究,揭示生物进化历程及机理具有十分重要的意义。 相似文献
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5月中下旬繁殖季节,用方正银鲫（Carassius auratus gibelio）的卵子分别与麦穗鱼（Pseudorasbora parva）（方正银鲫♀×麦穗鱼♂,简称FM）、方正银鲫（方正银鲫♀×方正银鲫♂,FF）和荷包红鲤（Cyprinus carpio）（方正银鲫♀×荷包红鲤♂,FH）的精子进行人工授精,孵出的仔鱼在网箱中饲养,测定和统计各组子代的存活率、绝对增重率和性比等。结果表明：FF子代的成活率（91.15±1.78%）极显著地高于FM（87.50±2.13%）和FH（85.00±1.04%）（P〈0.01）,FM和FH之间差异不显著（P〉0.05）;FM（20.17±4.33 g）、FH（23.13±3.58 g）子代的出池体质量显著高于FF（18.90±3.82 g）（P〈0.05）,无论雌性还是雄性子代,组间差异均极显著（P〈0.01）,而组内、性别间生长差异不显著（P〉0.05）;FM（99%）、FF（73%）和FH（99%）子代的雌性百分比明显偏向雌性（P〈0.01）,且组间差异极显著,异源精子受精后子代中雌鱼比例明显增高（P〈0.01）。本研究结果证明：银鲫生长性状中存在＂异精效应＂,异源精子对子代的存活率和性别比例有显著影响,对生产中积极利用异源精子提供了数据支持。 相似文献
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采用双列杂交设计对牙鲆Paralichthys olivaceus两个养殖群体：日本群体（J）和中国抗病选育群体（C）进行群体间杂交和群体内自繁,获得C（♀）×C（♂）、J（♀）×J（♂）、J（♀）×C（♂）和C（♀）×J（♂）4个交配组合的子一代。针对受精率、孵化率、白化率和存活率4个性状进行了组合间的比较,计算了各项性状的杂种优势率,对组间各性状进行了方差分析,并进行了相关分析。结果表明,杂交组在受精率、孵化率及存活率上存在着不同程度的杂种优势,其中C（♀）×J（♂）后代在孵化率和存活率两个性状上的杂种优势率分别为33.99%和31.37%。对4个性状的表型相关分析表明,受精率和孵化率的相关系数为0.657,受精率和存活率相关系数为0.432,分别达到了极显著水平（P〈0.01）。分析结果认为,两个不同群体间的种内杂交是牙鲆优良品种培育的有效途径。 相似文献
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华贵栉孔扇贝数量性状的相关性及通径分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为查明华贵栉孔扇贝（Chlamys nobilis）数量性状间的相关性,随机选取526只扇贝,对其形态性状（壳高、壳长、绞合线长和壳厚）和质量性状（总质量、贝柱鲜质量、鲜肉质量、干肉质量和贝柱干质量）进行测量,采用多元回归与通径分析方法研究了5个易测数量性状（壳高、壳长、绞合线长、壳厚和总质量）对鲜肉质量、贝柱鲜质量和贝柱干质量的影响。结果表明,总质量与鲜肉质量、贝柱鲜质量和叭柱干质量呈极显著的正相关（P〈0．01）。多元回归与通径分析显示,这5个易测数量性状指标中,总质量对3个经济性状的正面影响非常大,其他指标的影响较小甚至不明显。 相似文献