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为探讨中国近海石首鱼类的系统进化关系,通过PCR扩增和序列测定,获得了石首鱼类9属13个种类的RAG1基因序列。对序列变异进行分析,基于Kimura双参数法计算属间和种间的遗传距离,并结合GenBank中的同源序列,以攀鲈为外群构建分子系统进化树。将所得的分子数据与形态学分类进行比较,推论如下:(1) 中国近海石首鱼类分为两个类群。(2) 叫姑鱼亚科与石首鱼亚科以极高的置信度(90%)聚类,并处于系统进化树的基部,支持了形态学上二者是原始种类的分类观点。(3) 分子系统树显示黄姑鱼属比银姑鱼属更为原始,但二者在形态分类上归为一个亚科的观点有待进一步商榷。(4) 支持尖头黄鳍牙鱼或与银牙鱼或置于同一牙鱼或亚科的不同属的观点。(5) 支持了形态学上黄鱼亚科分化最晚的结论。 相似文献
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大黄鱼微卫星标记引物在石首鱼科几个近缘种中的通用性研究 总被引：8，自引：1，他引：7
本研究分析了8对大黄鱼（Pseudosciaena crocea）微卫星标记引物在石首鱼科5个亚科8属10个种中的通用性。结果表明，大黄鱼微卫星标记引物在黄鱼亚科鱼类中有较高的通用性，其中位点PC1C4，PC4H12，PC5E11，PC8F5，PC10F10，PC10G6的引物可在小黄鱼（P.polyactis）和棘头梅童鱼（Collichthys lucidus）中获得清晰扩增条带，位点PC7H4引物也可在小黄鱼中扩增，上述可扩增位点在两个种中均得到多个等位基因，表现出较高的多态性；大黄鱼微卫星标记引物在白姑鱼亚科、叫姑鱼亚科、牙[鱼或]亚科及石首鱼亚科鱼类中也有较高的通用性，其中在银牙[鱼或]（Otolithes argenteus）中得到6个可扩增位点（PC1C4，PC4H12，PC7A2，PC7H4，PC10F10，PC10G6），在鮸状黄姑鱼（Nibea miichthioides）、丁氏[鱼或]（Wak tingi）和眼斑拟石首鱼（Sciaenops ocellatus）中各得到5个可扩增位点，在浅色黄姑鱼（N.Chui）和尖头黄鳍牙[鱼或]（Chrysochir aureus）中各得到4个可扩增位点，在皮氏叫姑鱼（Johnius belengerii）中得到3个可扩增位点（PC7H4，PC10F10，PC10G6）。位点PC10F10和PC10G6引物在10个种中都可得到清晰的扩增产物，可作为10种石首鱼的通用标记。引物PC5E11和PC8F5只在黄鱼亚科中得到扩增产物，为黄鱼亚科特异性标记。[中国水产科学，2008，15（2）：237-243] 相似文献
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鲹科鱼类在传统形态分类与分子遗传水平构建的系统分类存在争议，本文通过PCR扩增获得了鲹科（Carangidae）8属9种的线粒体16S rRNA基因片段序列约598bp碱基，结合来自GenBank的3种鲹科鱼类的相应片段序列，并以大斑石鲈Pomadasys maculates为外群，生成供系统发育分析的序列矩阵，利用MEGA version 3.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比和转换/颠换值等，应用最大简约法和邻接法构建系统树。结果显示：（1）支持鲹科下设四个亚科（鲹亚科，鰤亚科，鲳鲹亚科，鰆鲹亚科）阶元的分类系统；（2）所测种类鲹亚科鲹属下不宜设亚属分类阶元；（3）及达副叶鲹与丽叶鲹亲缘关系近，16S rRNA基因片段序列碱基只有1.07%的差异，未达到分属水平，应同属于副叶鲹属的两个不同种，并建议丽叶鲹的中文名用“丽副叶鲹”。 相似文献
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测定了柔鱼亚科(Ommastrephinae)中的柔鱼(Ommastrephes bartramii)、茎柔鱼(Dosidicus gigas)、鸢乌贼(Sthenoteuthis oualaniensis)、发光柔鱼(Eucleoteuthis luminosa)的线粒体COI和16S rRNA基因的部分序列,结合从Gen Bank中获得的玻璃乌贼(Hyaloteuthis pelagica)、鸟柔鱼(Ornithoteuthis volatilis)、大西洋鸟柔鱼(Ornithoteuthis antillarum)的同源序列,以太平洋褶柔鱼(Todarodes pacificus)、阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)为外群,运用贝叶斯法(BI)构建了分子系统树,同时联合了2个基因片段序列,运用贝叶斯联合模型综合探讨了柔鱼亚科种类的系统发育关系。研究发现,除16S rRNA基因外,COI基因片段和联合模型所构建的系统树拓扑结构完全一致;结合形态学资料,发现玻璃乌贼、发光乌贼和鸢柔鱼亲缘关系较近,且形态上都出现了外套膜大型发光器,是柔鱼亚科中分化较晚的种类;其次茎柔鱼、柔鱼与其它种类存在较大的遗传距离,形态上丢失了内脏和眼球发光器,可能预示着柔鱼亚科种类一个新的进化方向;鸟柔鱼属两个种为柔鱼亚科中最原始种类,且为褶柔鱼亚科向柔鱼亚科进化过程中的过渡物种。 相似文献
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珠江口鱼类组成分析 总被引：20，自引：2，他引：18
根据1998年珠江口水域尖尾罟网和掺缯网周年月度渔业资源调查资料,采用因子分析、回归分析和聚类分析方法分析了珠江口鱼类的种类组成、生物学特征及季节变化规律。结果表明,珠江口水域的鱼类主要是沿岸或河口性的小型鱼类,棘头梅童鱼、皮氏叫姑鱼、银鲳、孔Jia虎鱼、红狼牙Jia虎鱼、触角沟Jia虎鱼、矛尾Jia虎鱼、拟预选尾Jia虎鱼、眶棘双边鱼、双线舌鳎、半滑舌鳎、凤鲚、勒氏短须石首鱼、丽叶Shen、前鳞骨鲻、龙头鱼、带鱼、短带鱼、小带鱼、鳓鱼、黄鲫、日本Ti、康氏小公鱼、黄吻棱Ti、棕腹刺Tun、黄鳍东方Tun、火枪乌贼、杜氏枪乌贼等,是珠江口鱼类组成的主体。鱼类组成的季节变化明显,但底栖种类和中上层种类存在着时间上的差异。 相似文献
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首次报道苏州及邻近地区鱼白亚科鱼类的重新定名和种名的重新整理 ,确认该亚科有 7个属 13个种及亚种 ,占全国鱼白亚科 17个属 6 6个种及亚种的 4 1 18%和 19 70 % ,首次报道尖头鱼白COxycephalusBleeke为本地区的新记录种。鱼白亚科种类在中国淡水鱼类区划分布华东区鱼类区系中占有重要地位 ,具有一定的代表性 ,该地区鱼类属江可平原区鱼类区系复合体种类 ,属、种数量明显超过中印山麓鱼类及印度平原区系复合体种类。针对该地区鱼白亚科鱼类种群数量减少和鱼体逐渐小型化的趋向 ,认为亟待对其资源采取繁殖保护以及经济种类增殖和种群调控措施。 相似文献
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大黄鱼（Pseudoseiaena crocea Richardson），俗称黄花鱼、黄瓜鱼、红瓜等，在分类上隶属于鲈形目、石首鱼科、黄鱼属。大黄鱼属于暖温性、广盐性的河口鱼类。其肉质细嫩洁白、味道鲜美、营养丰富，还有较高的药用价值，为我国传统的美食海鱼。 相似文献
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Randa Abu-Hakima 《Fisheries Research》1984,2(3):177-200
Aspects of the reproductive biology of Pomadasys argenteus, Otolithes argenteus and Pampus argenteus are described. Maturation of the gonads is divided into 8 arbitrary stages, and the distribution of the stages in an annual cycle is reported. In Pomadasys argenteus there is a major spawning period from February to April and another minor one in October. In Otolithes argenteus there is one distinct spawning period from January to April. The spawning season of Pampus argenteus extends from March to August. The histology of the gonads and the distribution of oocytes of different diameters in the ovaries of the 3 fish species are described. The distribution of oocyte diameters in the ovary of Pampus argenteus is polymodal and characteristic of serial spawners, whereas the distribution of oocyte diameters in Pomadasys argenteus and Otolithes argenteus corroborate the finding that these fish are single spawners. The estimated potential fecundity for Pomadasys argenteus ranged from 6 25 848 to 2 424 846, for Otolithes argenteus from 53 676 to 7 163 954 and for Pampus argenteus from 765 675 to 2 537 774. 相似文献
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辽东湾斑海豹线粒体苏氨酸和脯氨酸及控制区部分序列分析 总被引：1，自引：1，他引：1
通过PCR产物测序法,测定了46只辽东湾斑海豹线粒体DNA的一段包括部分苏氨酸和脯氨酸tRNA基因及部分控制区的717 bp序列,得到17个序列单元型。与港海豹相比,所有辽东湾斑海豹17个单元型在控制区序列中都有2处缺失,是区分港海豹和斑海豹的种间分子标记。与日本海和鄂霍次克海区斑海豹m tDNA相同片段进行比较研究,发现辽东湾斑海豹的线粒体控制区DNA的单元型比例相对较少,遗传多样性水平相对较低。辽东湾斑海豹m tDNA的16296位点即苏氨酸tRNA基因序列的最后一位有1个C碱基的插入,16607位点存在T/C转换,这两个变异位点是鉴别辽东湾斑海豹与日本及鄂霍次克海区斑海豹的重要分子标记。初步表明,辽东湾斑海豹与日本海、鄂霍次克海斑海豹是属于不同的地理种群,或者辽东湾斑海豹同这两个海区斑海豹未发生基因交流或者雌性个体的相互交流。 相似文献
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青蛤(Cyclina sinensis),俗称黑蛤,铁蛤,圆蛤和牛眼蛤等,隶属于瓣鳃纲（Lamellibranchia）、异齿亚纲 （Heterodonta）、帘蛤目（Venerida）、帘蛤科（Veneridae）,青蛤亚科（Cyclina）,广泛分布于朝鲜,日本和中国沿海的滩涂及河口地区。青蛤味道鲜美,具有较高的营养价值,且受重金属污染程度较低,是我国南北沿海重要的养殖品种。本文首次从青蛤的生物学与渔业生态学两大角度,系统的综述了迄今为止有关于青蛤的大部分研究,肯定前人研究成果的同时,也为今后有关青蛤的研究提供了研究方向,旨在为相关领域的科研和生产提供较为丰富的参考材料,增进人们对青蛤的认知。 相似文献
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罗非鱼种间,尤其是尼罗罗非鱼与杂种尼奥罗非鱼之间,很难区分。本文对尼罗罗非鱼、奥利亚罗非鱼、莫桑比克罗非鱼和杂交种尼奥罗非鱼（尼罗罗非鱼♀×奥利亚罗非鱼♂）和红罗非鱼的核糖体DNA内部转录间隔子1（ITS1）序列及其两侧的18S和5．8s部分序列特征进行分析,以筛选种间鉴别标记。PCR扩增产物大小约700bp,测序结果表明,（去除引物后）18S长146bp,5．8S长66bp,不同种类之间无差异;ITS1长383-483bp,因种类不同而异,其GC含量大于AT含量,达到67．1％。序列比对分析结果表明,18S和5．8s片段高度保守,但各有3个变异位点可以把上述几个种和杂种相互区分开;18S序列上有一个UnbI限制性酶切位点,可作为尼罗和尼奥罗非鱼的鉴别标记。ITS1序列种间变异大,系统发育分析表明,所研究的5个种聚成2个类群,尼罗与尼奥罗非鱼为一组,莫桑比克-红罗非鱼-奥利亚罗非鱼为另一组。组内种间遗传距离较小,尼罗和尼奥罗非鱼的种间遗传距离为0．006;莫桑比克、奥利亚和红罗非鱼的种间遗传距离在0．007-0．009之间;两组罗非鱼之间的遗传距离较大,在0．030-0．035之间,表明罗非鱼ITS1序列多态性较高,适合于种类区分。结合部分18S和5．8S序列,细胞核rDNA具有鉴别罗非鱼及其杂种的潜力。 相似文献
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Ancestry and amphidromy in island freshwater fish faunas 总被引：2，自引：0，他引：2
R M McDowall 《Fish and Fisheries》2004,5(1):75-85
Amphidromy is a frequent attribute of fish faunas of remote islands, where the presence of freshwater fishes creates perplexity as to how such remote places came to have ‘freshwater fish’. Not infrequently, the fact that amphidromous species spend part of their lives in the sea is invoked as indicating that such species have marine ancestries, and this is the implied explanation for presence of freshwater fishes on islands. However, examination of the ranges of some amphidromous species, and of the distributions of genera to which amphidromous fishes belong, strongly suggests that amphidromy, especially in the gobies of the subfamily Sicydiinae, is a widespread, probably ancestral trait. Rather than such amphidromous fish having a marine ancestry, their marine life stages are themselves the likely key element in explaining their distributions. 相似文献
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中国海口足类动物区系具有丰富的物种多样性,是我国海洋底栖生物中的重要经济类群。口足类的属内种间鉴别特征有的极为相似,仅依靠传统的形态分类方法很难对近缘种和疑难种进行准确的鉴定。DNA条形码技术可以弥补传统形态学鉴定的某些局限,为物种鉴定提供了有效的工具。该研究探讨了利用线粒体COI序列对中国海口足类进行物种鉴定的可行性,共获得口足目4总科6科24属38个种的204条线粒体COI序列,与Gen Bank收录的14种42条口足类同源序列进行比对,结果显示口足类COI基因不存在碱基插入缺失现象,碱基组成偏倚明显,A+T含量(63.5%)显著高于G+C含量(36.5%)。基于Kimura双参数模型计算遗传距离,结果显示遗传距离随着分类阶元的增高而增大。同物种种内个体间的遗传距离变化范围在0%~3.91%,平均值为0.76%。同属内各物种间的遗传距离变化范围为6.55%~18.99%,平均值为12.91%。同科内不同属间的遗传距离变化范围为9.16%~23.32%,平均值为16.89%。不同科间的遗传距离变化范围为16.52%~26.6%,平均值为21.31%。由此可见,口足类COI基因的种间和种内遗传距离存在明显的间隙。基于COI序列构建的口足类邻接关系树显示所有包含大于1个个体的物种均可形成单系群,且节点支持率均为100%。本研究证明了COI序列作为DNA条形码标准基因在口足类物种鉴定中的有效性。此外,研究发现中国沿海分布的口虾蛄可能至少存在两个隐存种,实证了基于COI序列的DNA条形码技术能够用于口虾蛄隐存多样性的探究。 相似文献
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中国东南沿海青蟹线粒体COI基因部分序列分析 总被引：17，自引：1，他引：17
对我国东南沿海5个地区的72个青蟹个体的线粒体细胞色素氧化酶亚基I (COI)部分序列序列进行了测定和分析。获得的72个细胞色素氧化酶亚基I (COI)序列可分为12个单倍型，与GenBank中已知的Scylla paramamosain COI序列的相似性达到98%以上，与其它3种
青蟹的差异为7.36%～15.54%。这些序列与S. paramamosain的遗传距离仅为0.00783，但是与S. serrata、S. olivacea和S. tranquebarica〗的遗传距离却分别达到0.11659、0.17812和0.08423。序列特征、遗传距离和系统进化等分析结果都表明本文研究的青蟹为S. paramamosain。结果提示，在进行青蟹属相关研究应当仔细鉴别采集样本的种类。 相似文献
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Tetsuya Akasaki Toshiro Saruwatari Hirosuke Tomonaga Soei Sato Yoshiro Watanabe 《Fisheries Science》2006,72(3):686-692
ABSTRACT: Quality control of imported fish products is a constant challenge for Customs officials. To help officials access the quality and integrity of imported fish products, and to enhance the effectiveness and accuracy of product screening, a method was developed to identify boiled and dried larval and juvenile sardines (Chirimen) at the genus level by direct sequencing using a partial sequence (606 bp) of mitochondrial 16S rDNA. A phylogenetic tree was constructed, based on nucleotide sequences of seven kinds of Chirimen imported from four countries with 16 standard samples belonging to the orders Clupeiformes and Salmoniformes. To identify the fish genera in imported Chirimen, bootstrap values and branch lengths of the phylogenetic tree as well as genetic distances were used. The data revealed that Chirimen imported from China and Korea contains species of the genus Engraulis . Regarding other imported Chirimen, the least that could be verified was that the sardine ingredients do not belong to regulated genera. 相似文献
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在鲤科鱼类中雅罗鱼亚科鱼类起源较早,形态差异显著。迄今为止,有关雅罗鱼亚科的系统发育关系还存在很大的争议。本文以新疆分布的雅罗鱼亚科鱼类为对象,采用线粒体DNA中的cyt b基因序列,用贝叶斯联合模型分析数据,重建了雅罗鱼亚科的系统发育关系;结合鲤亚科和裂腹鱼亚科,用松散分子钟估算了雅罗鱼亚科属间的分歧时间。结果显示：丁鱥属（Tinca）处于系统发育树的基部,新疆雅罗鱼亚科鱼类中丁鱥属（36Ma）和鱥属（Phoxinus）（29Ma）的起源于渐新世,而欧鳊属（Abramis）（20Ma）、拟鲤属（Rutilus）（18Ma）、雅罗鱼属（Leuciscus）（13Ma）起源于中新世。 相似文献