纳米二次离子质谱技术(NanoSIMS)在微生物生态学研究中的应用     

胡行伟  张丽梅  贺纪正 《勤云标准版测试》2013,33(2):348-357

超高分辨率显微镜成像技术与同位素示踪技术相结合的纳米二次离子质谱技术(NanoSIMS)具有较高的灵敏度和离子传输效率、极高的质量分辨率和空间分辨率(＜ 50 nm),代表着当今离子探针成像技术的最高水平.利用稳定性或者放射性同位素在原位或者微宇宙条件下示踪目标微生物,然后将样品进行固定、脱水、树脂包埋或者导电镀膜处理,制备成可供二次离子质谱分析的薄片,进一步通过NanoSIMS成像分析,不仅能够在单细胞水平上提供微生物的生理生态特征信息,而且能够准确识别复杂环境样品中的代谢活跃的微生物细胞及其系统分类信息,对于认识微生物介导的元素生物地球化学循环机制具有重要意义.介绍了纳米二次离子质谱技术的工作原理和技术路线,及其与同位素示踪技术、透射电子显微镜(TEM)、扫描电子显微镜(SEM)、荧光原位杂交技术(FISH)、催化报告沉积荧光原位杂交技术(CARD-FISH)、卤素原位杂交技术(Halogen In Situ Hybridization,HISH)等联合使用在微生物生态学研究方面的应用.  相似文献   

EUB338探针对真细菌细胞的检测灵敏性分析(英文)     

王晓丹 《（《农业科学与技术》）编辑部》2011,(10)

[目的]探讨EUB338探针对真菌的检测灵敏度。[方法]以16株常见真菌为材料,使用荧光原位杂交法进行了分析。[结果]EUB338探针检测灵敏度的平均值为63.9%,改良方法可将检测灵敏度平均值提高到71.3%。[结论]该研究可为从分子生物学角度检测土壤真细菌提供科学依据。  相似文献   

荧光原位杂交技术在鱼类基因定位研究中的应用     

鲁翠云  张明昭  李超  郑先虎  邱高峰  孙效文 《鲑鳟渔业》2013,(4):51-57

荧光原位杂交fluorescence in situ hybridization,FISH）技术是一种简单而有效的染色体上物理定位DNA序列的技术。本文介绍了荧光原位杂交技术的基本原理以及实验流程,综述了近年来FISH技术在鱼类基因定位方面的应用,如来源于细菌人工染色体（bacterial artificial chromosome,BAC）文库的单拷贝基因的定位、核糖体基因和组蛋白基因等中度重复序列的定位、着丝粒特异序列和性别特异序列等高度重复序列的定位以及其他重复序列的定位等,用于研究特定基因定位、性染色体鉴定及种间杂交等遗传学问题,并展望了此技术在定位鱼类经济性状相关标记或基因、性别相关标记或基因及种特异染色体标记中的应用前景。  相似文献   

Cytogenetic studies of Atlantic mojarras (Perciformes – Gerreidae): chromosomal mapping of 5S and 18S ribosomal genes using double FISH     

Leonardo Luiz Calado  Luiz Antônio Carlos Bertollo  Gideão Wagner Werneck Felix da Costa  Wagner Franco Molina 《Aquaculture Research》2013,44(5):829-835

Fish of the family Gerreidae, mainly species of the genera Diapterus and Eugerres, have high potential for cultivation, because of their saline tolerance. A detailed cytogenetic analysis of Diapterus auratus, Diapterus rhombeus and Eugerres brasilianus was conducted using conventional staining, C‐banding, Ag‐NOR, AT/GC‐specific fluorochrome staining and mapping of ribosomal sequences with 5S and 18S rDNA probes. All the species exhibited symmetrical karyotype, 2n = 48 acrocentric chromosomes. Ag‐NORs and 18S rDNA are present in the interstitial position on pair 1 (genus Diapterus) and pair 6 in Eugerres brasilianus. The 5S rDNA sites, located in the interstitial position (pair 11), are conserved in the three species. Heterochromatic regions are similar in the Diapterus species, showing a pattern of reduced and centromeric bands, differing from E. brasilianus, where, in addition to these, more prominent interstitial bands were observed. GC‐rich regions are located at ribosomal sites. Karyotypic comparison between Diapterus and Eugerres reveals similarity in chromosomal macrostructure, differing in C‐positive heterochromatin distribution and position of 18S sites, indicating the occurrence of structural microrearrangements. Although complementary analyses are needed, the similarities observed for these and other species suggest the possibility of breaking postzygotic barriers and their potential use, through induced interspecific or intergeneric hybridizations.  相似文献   

皱纹盘鲍染色体C带和rDNA定位   总被引：3，自引：3，他引：0  

蔡明夷  刘贤德  陈紫瑩  蔡冰冰  柯才焕 《水产学报》2013,37(7):1002-1008

为了提高对皱纹盘鲍染色体的辨识水平,实验利用 Ba(OH)₂ 处理显示了皱纹盘鲍染色体的C带,并用荧光原位杂交分析(fluorescence in situ hybridization,FISH)研究了核糖体大亚基rDNA在皱纹盘鲍中期染色体上的数目与位置。核型结果显示,皱纹盘鲍染色体组包含7对中部着丝粒染色体和8对亚中部着丝粒染色体,另有3对染色体介于中部着丝粒染色体与亚中着丝粒染色体之间(m/sm)。C显带结果显示,8对染色体有稳定的着丝粒C带,5～7对染色体上有中期相间多态的端部C带,3对染色体上有同源染色体异态的臂间C带。FISH 分析显示,皱纹盘鲍中期染色体上分布着4个大亚基 rDNA位点,分别位于2号短臂(2S)、7号短臂(7S)、12号短臂(12S)和18号长臂(18L)的端部。研究结果为皱纹盘鲍染色体辨识提供了新的特征与标记,为进一步研究皱纹盘鲍种群的染色体多态和鲍属染色体进化提供了基础资料。  相似文献   

土壤微生物多样性及其研究方法综述   总被引：2，自引：0，他引：2  

蔡晨秋  唐丽  龙春林 《安徽农业科学》2011,39(28):17274-17276,17278

围绕土壤微生物多样性的内涵,可将土壤微生物多样性分为遗传多样性、功能多样性、物种多样性和生态多样性4个研究层面;另将土壤微生物多样性的主要研究方法归为3类,即：传统平板培养法、生物化学方法和分子生物学方法,并分别对各方法进行介绍和评述,最后提出该领域研究的发展趋势。  相似文献   

DNA分子原位杂交在植物分子细胞遗传学研究中的应用     

别同德  张伯桥  高德荣  程顺和  马谈斌 《勤云标准版测试》2008,(11)

DNA分子原位杂交(in situ hybridization,ISH)是植物分子细胞遗传学研究的重要工具.简要回顾了DNA分子原位杂交的起源和发展,详细综述了基因组原位杂交(genomic in situ hybridization, GISH)在植物细胞遗传学研究中的应用以及荧光原位杂交(Fluorescence in situ hybridization, FISH)在植物物理作图和染色体识别中的应用.还介绍了Fiber-FISH、BAC-FISH以及Immuno-FISH等新兴技术,最后对FISH技术进行了展望.  相似文献   

硬粒小麦染色体的FISH核型分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

陈星灼  彭红  王亚  杨婷  彭泽  耿广东  张庆勤  张素勤 《种子》2018,(3):12-14,18

采用FISH(荧光原位杂交)技术,分析硬粒小麦(Sauwne 20)染色体的FISH核型特点,为该种质在小麦新品种选育上的应用提供参考。结果表明,Sauwne 20包括14对染色体,Oligo-pTa 535-2红色探针信号主要分布在A组染色体上,而B组染色体上主要分布着明亮丰富Oligo-pSc 119.2-1绿色探针信号;根据这2种探针在Sauwne 20染色体上的分布特点,可以将其不同染色体进行准确地一一鉴别。Sauwne 20与中国春普通小麦的A组和B组染色体的FISH核型基本相似,但又有一定的差别,不同小麦材料间DNA重复序列表现出遗传多样性。  相似文献   

木薯中性/碱性转化酶基因家族11个成员在染色体上的定位     

朱利广  刘平平  欧祥梅  王英  高和琼  庄南生 《热带生物学报》2017,8(3)

中性/碱性转化酶(Alkaline or neutral invertase,N/A-lnv)是木薯淀粉合成过程中的一种关键酶。笔者以木薯华南6号古铜期嫩叶为材料制备染色体标本,利用荧光原位杂交和原位PCR技术对N/A-lnv基因家族的11个成员进行了物理定位。结果表明,基因MeNINV5,MeNINV9和MeNINV10均位于第4号染色体上,其中基因MeNINV9和MeNINV10位于短臂上,到信号点的百分距离分别为68.52和95.35,基因MeNINV5位于长臂上,到着丝粒的百分距离为22.71;基因MeNINV4和nINV1均位于第6号染色体长臂上,到着丝粒的百分距离分别为43.16和80.71;基因MeNINV6和MeNINV7分别位于第7号和第17号染色体的长臂上,信号点到着丝粒的百分距离分别是15.38和57.97;基因MeNINV1,MeNIN,V2,MeNINV3和MeNINV8分别位于第11号、第9号、第5号和第16号染色体的短臂上,信号位点到着丝粒的百分距离分别是40.10,51.88,91.75和76.33。中性/碱性转化酶基因家族内部部分成员之间存在连锁关系。研究结果可为木薯淀粉的高效积累机制及木薯种质遗传改良提供分子细胞遗传学依据。  相似文献   

Molecular characterisation of the gut microflora of healthy and inflammatory bowel disease cats using fluorescence in situ hybridisation with special reference to Desulfovibrio spp     

Inness VL  McCartney AL  Khoo C  Gross KL  Gibson GR 《Journal of animal physiology and animal nutrition》2007,91(1-2):48-53

Inflammatory bowel disease (IBD) is a common cause of chronic large bowel diarrhoea in cats. Although the aetiology of IBD is unknown, an immune-mediated response to a luminal antigen is thought to be involved. As knowledge concerning the colonic microflora of cats is limited and requires further investigation, the purpose of this study was to determine the presence of specific bacterial groups in normal and IBD cats, and the potential role they play in the health of the host. Total bacterial populations, Bacteroides spp., Bifidobacterium spp., Clostridium histolyticum subgp., Lactobacillus-Enterococcus subgp. and Desulfovibrio spp. were enumerated in 34 healthy cats and 11 IBD cats using fluorescence in situ hybridisation. The study is one of the first to show the presence of Desulfovibrio in cats. Total bacteria, Bifidobacterium spp. and Bacteroides spp. counts were all significantly higher in healthy cats when compared with IBD cats, whereas Desulfovibrio spp. (producers of toxic sulphides) numbers were found to be significantly higher in colitic cats. The information obtained from this study suggests that modulation of bacterial flora by increasing bifidobacteria and decreasing Desulfovibrio spp. may be beneficial to cats with IBD. Dietary intervention may be an important aspect of their treatment.  相似文献