鸡呼吸道传染病基因芯片诊断方法的建立   总被引：4，自引：0，他引：4  

陈凤梅  吴时友  尹燕博  牛钟相 《畜牧兽医学报》2005,36(12):1358-1362

随着养禽业集约化程度的不断提高,鸡呼吸系统疾病的发生呈逐年上升趋势.而且大多数的呼吸道疾病不是单一病原感染,而是多种病原混合感染,从临床上难以及时鉴别诊断,延误防治时机,从而给养禽业造成巨大的经济损失.因此,禽呼吸道疾病已经成为生产和研究中的一类重要疾病.目前,禽呼吸系统疾病的诊断方法主要有病毒分离、血凝（HA）、血凝抑制（HI）、琼脂扩散、ELISA、PCR等,但是传统的检测方法灵敏度较低,而且当病原发生变异或感染禽处在潜伏期时会造成误诊.PCR方法每次只能检测一种病毒,费时费力.采用基因芯片的方法可以快速、准确地同步检测多种病原体,且需要样品量少、灵敏、特异、快速、费用低廉,将生物芯片技术用于禽呼吸道疾病诊断意义重大.  相似文献   

利用基因芯片分析比较Giza75和SG747纤维发育差异表达基因     

宋吉坤  辛玥  李龙云  刘国元  裴文锋  马建江  曲延英  于霁雯  吴嫚 《新疆农业科学》2022,59(6):1312-1330

【目的】 利用适应性广、产量高的陆地棉和纤维品质优异的海岛棉进行高通量基因芯片比较分析,筛选和鉴定棉纤维发育相关的关键基因。【方法】 以SG747(Gossypium hirsutum L.)和Giza75(Gossypium barbadense L.)为材料,利用Affymetrix公司的棉花寡聚核苷酸基因芯片对其开花后10 d(10 days after anthesis, 10 DPA)的棉纤维进行表达谱分析。【结果】 材料Giza75和SG747共筛选到3 905个差异表达基因,其中功能预测基因占比17.80%,翻译、核糖体结构相关基因占比16.82%,翻译后修饰占比14.32%。Gra.2198.1.A1_at正向调控棉纤维发育过程,Gra.85.1.S1_at、Ghi.249.1.A1_at和Ghi.8448.1.S1_x_at负向调控棉纤维发育过程,可能参与了棉纤维发育过程。【结论】 利用陆地棉和海岛棉基因芯片并结合qRT-PCR筛选和鉴定到4个纤维发育相关的关键候选基因。  相似文献   

转基因植物非预期效应检测评价技术的发展     

赵洁  刘峙  彭于发  齐放军 《中国农业科技导报》2013,15(2):64-69

检测和评价转基因植物非预期效应是转基因植物安全评价不可或缺的重要内容之一。介绍了转基因植物非预期效应的定义、成因及其检测评价技术的发展,指出了转基因植物非预期效应检测评价技术的难点和存在的问题。阐述了基因芯片分析技术在检测和评价转基因植物非预期效应中的应用前景,特别介绍了转基因植物在不同发育阶段和生长条件下差异表达基因的分布模型,并提出了利用基因芯片分析技术,从差异基因到代谢途径,再到非预期效应的转基因植物安全评价模式。这一评价模式可为今后创建高效、全面、客观、公正的转基因植物非预期效应检测和评价技术提供可能的实验模型和理论依据。  相似文献   

基于阵列芯片现场高灵敏同步快速检测粮油中氨基甲酸酯类农药残留混合污染     

周丹  闵亚杰  戚欣  宁佳囡  吴文琴  张兆威  李培武 《中国油料作物学报》2021,42(3):341

The quality and safety of agricultural products is the technique focus of the strategy of rural vitaliza⁃tion. Carbamate pesticide residues are seriously threatening the safety of agricultural product and human life and health. Nowadays, the common detection methods are instrument-based for carbamate pesticide residue, which dis⁃ satisfy the request of an on-site rapid, sensitive and simultaneous detection for multiple carbamate pesticide resi⁃ dues. Based on the home-made monoclonal antibodies against carbofuran and carbaryl respectivity, a microarray for rapid and simultaneous detection of multiple carbamate pesticide residues was developed within 30 min. Under the optimized conditions, the limits of detection（LODs）were found to be 0.11 and 0.09 ng/g, while the linear ranges were 0.33-3000 and 0.18-1500 ng/g for carbofuran and carbaryl respectively. By using spiked peanut samples, it recorded recoveries of 88.4%-98.3%, 90.1%-118.8% for carbofuran and carbaryl respectively. The RSD of intraarray were found at 9.0%, 3.5%, while the RSD of inter-array were recorded at 12.3%, 16.3% respectively. The de⁃ tection results of the microarray were highly consistent with that of HPLC-MS/MS. This proposed microarray provid⁃ ed an on-site high-sensitivity, simultaneous and rapid detection of carbofuran and carbaryl, and could be widely used in the fields of agricultural product quality safety, food safety and environmental monitoring.  相似文献   

水稻稻瘟病菌胁迫应答cDNA片段的表达及定位   总被引：3，自引：2，他引：3  

饶志明  董海涛  庄杰云  柴荣耀  樊叶杨  李德葆  郑康乐 《中国水稻科学》2003,17(2):105-108

以抗稻瘟病品系G205为材料,应用cDNA微阵列分别获得了一个受稻瘟病菌诱导的含NBS LRR的cDNA克隆（暂命名为RIM1, rice induced by Magnaporthe grisea）和一个受稻瘟病菌抑制的编码腈水解酶（Nitrilase）的cDNA克隆（暂命名为NIT）,并通过Northern得到证实。RFLP分析将RIM1和NIT分别定位于水稻第2和第3染色体上,它们均位于控制水稻稻瘟病部分抗性QTL区间。  相似文献   

应用cDNA微阵列芯片技术筛选猪蛔虫性别差异表达基因的研究   总被引：6，自引：0，他引：6  

邹丰才  吴绍强  廖申权  林瑞庆  李明伟  宋慧群  黄翠琴  朱兴全 《畜牧兽医学报》2006,37(2):163-167

采用cDNA微阵列芯片技术，从所构建的猪蛔虫雌、雄成虫cDNA消减文库分别挑取1044和1119个克隆，PCR扩增其插入片段，经纯化后点样于预先处理好的基片上（双点杂交），制备成cDNA微阵列芯片。将分别标记荧光素Cy3-dUTP和Cy5-dUTP的雌虫和雄虫cDNA探针，与制备好的cDNA芯片杂交（平行进行反标杂交试验）。根据每个点杂交后的Ratio值，筛选出双点杂交和正反标中都同时具有表达差异的基因克隆共1559个。将表达差异最明显的前831个克隆进行测序，获得720个有效序列，经生物信息学分析发现，雄虫特异表达的主要精于蛋白和雌虫特异表达的卵巢信息蛋白的基因序列多数与新杆属线虫存在同源性，有31个可能是新的ESTs。性别差异表达基因及其相关生物信息的获得为下一步研究基因功能奠定了基础。  相似文献   

猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒基因芯片检测技术的建立与优化   总被引：2，自引：0，他引：2  

杨林  潘全会  曹巧玲  张桂红  陈苏红  廖明 《中国动物检疫》2007,24(5):25-28

根据猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）的核衣壳蛋白编码基因序列设计了一对特异性引物P1／P2。扩增出大小为294bp的目的片段；再针对这个基因片段。设计合成4条寡核苷酸探针。其中反向引物的5’端用荧光素Cy3标记。以荧光标记不对称PCR技术为基础。通过将单链PCR产物与芯片杂交实现对PRRSV的检测。建立PRRSV的基因芯片检测方法。利用该方法对39份猪组织样品进行检测。与RT—PCR检测方法相比。本方法具有良好的特异性和敏感性。试验结果表明用该方法快速检测病料组织中PRRSV是可行的，对该病的进行快速诊断和分子流行病学调查具有重要意义。  相似文献   

Construction and preliminary application of oligonucleotide microarray specialized for pancreatic adenocarcinoma     

SHI Xin  WEI Wen-jun  GAO Nai-rong  CHENG Zhang-jun  TANG Shui-hui 《园艺学报》2007,23(10):2012-2017

  相似文献   

Gene expression in pyriproxyfen-resistant Bemisia tabaci Q biotype     

Ghanim M  Kontsedalov S 《Pest management science》2007,63(8):776-783

Pyriproxyfen is a biorational insecticide that acts as a juvenile hormone (JH) analogue and disrupts insect development with an unknown molecular mode of action. Pyriproxyfen is one of the major insecticides used to control the whitefly Bemisia tabaci (Gennadius) and comply with integrated pest management (IPM) programmes, resulting in minimal effects on the environment, humans and beneficial organisms. During the last few years, resistance to pyriproxyfen has been observed in several locations in Israel, sometimes reaching a thousandfold or more. No information exists about the molecular basis underlying this resistance that may lead to understanding the mode of action of pyriproxyfen and developing molecular markers for rapid monitoring of resistance outbreaks. In this communication, a cDNA microarray from B. tabaci was used to monitor changes in gene expression in a resistant B. tabaci population. Based on statistical analysis, 111 expressed sequence tags (ESTs) were identified that were differentially upregulated in the resistant strain after pyriproxyfen treatment. Many of the upregulated ESTs observed in the present study belong to families usually associated with resistance and xenobiotic detoxification such as mitochondrial genes, P450s and oxidative stress, genes associated with protein, lipid and carbohydrate metabolism and others related to JH-associated processes in insects such as oocyte and egg development.  相似文献   

利用基因芯片技术筛选棉纤维伸长相关基因   总被引：6，自引：1，他引：5  

李龙云  于霁雯  翟红红  黄双领  李兴丽  张红卫  张金发  喻树迅 《作物学报》2011,37(1):95-104

从回交近交系(backcross inbred lines, BIL)群体中选取纤维长度差异较大的两个系NMGA-062 (33.03 mm)和 NMGA-140 (25.87 mm),利用Affymetrix棉花基因芯片,分析其开花后10 d (DPA, days post anthesis)棉纤维伸长相关基因表达谱。在24 029条转录本中,两材料间差异表达的转录本有7 282条,占总数的30.31%;其中差异表达倍数在2倍或2倍以上的转录本有3 993条,占筛选转录本总数的16.62%,功能分类表明这些转录本主要包括功能预测基因(15.57%)、翻译、核糖体结构相关基因(13.54%)和翻译后修饰、蛋白质转换相关基因(9.29%)3大类。为了验证芯片数据的可信性,8个差异表达显著的基因(Ghi.10655.1.S1_s_at, ACO1, ARF1, SAHH, TUA6, TUA7, β-tub1, β-tub10)被用于实时荧光定量PCR。两种检测手段表现出一致性。随后,利用实时荧光定量PCR对3个与棉纤维相关基因(ARF1, β-tub1, β-tub10)在纤维发育不同时期(5、10、15、20和25 DPA)的表达模式进行了研究,结果表明,3个基因在纤维伸长发育时期(10和15 DPA)大量表达,推测这3个基因可能与棉纤维伸长有重要关系。  相似文献