Cloning and Sequence Analysis of HA and NA Genes of One Strain of H6N6 Subtype Avian Influenza Virus Isolated from Guizhou Province     

CHEN Jia-qi  JI Xin-qin  DUAN Zhi-qiang  WEN Ming  RUAN Yong  LEI Yun  HOU Ping 《中国畜牧兽医》2016,43(2):296-303

To investigate the epidemic situation of H6N6 subtype avian influenza virus (AIV) in Guizhou province,A/duck/Guizhou/013/2014 was isolated from Sansui duck in live poultry market of Guizhou in 2014,the hemagglutinin (HA) and neuraminidase (NA) genes of DK/GZ/14 were subjected to clone and sequence analysis.The results showed that HA gene had the highest nucleotide homologies (97.5%) with the duck-origin H6N6 subtype AIV isolated from Eastern China in 2009,and the strains of HA gene proteolytic cleavage sites was P-Q-I-E-T-R-G,which accordeol with the molecular characteristic of low pathogenic AIV (LPAIV).However,NA gene of A/duck/Guizhou/013/2014 had the highest nucleotide homologies (98.2%) with the duck-origin H6N6 subtype AIV isolated from Fujian in 2007.The phylogenetic tree showed that A/duck/Guizhou/013/2014 and Hunan strains located in the same branch,while three duck-origin H6N6 subtype AIV isolated from Guizhou in 2007 and A/duck/Guizhou/013/2014 located in the different branch for HA and NA genes in genetic evolution,which suggested that A/duck/Guizhou/013/2014 was far with the local H6N6 subtype.The results also clearly indicated that duck-origin H6N6 subtype AIV had genetic diversity in duck population in Guizhou.  相似文献   

HSN1亚型禽流感病毒NA基因在重组禽痘病毒中的表达及其产物的免疫原性     

王全英乔传玲  张洪波吴运谱田国彬  陈化兰 《中国兽医科技》2007,37(4):312-315

将禽流感病毒A／Goose／Guangdong／1／96（H5N1）株的NA基因及LacZ报告基因克隆到禽痘病毒载体pSY681中，构建重组转移载体pSY（NA＋LacZ），将其转染鸡胚成纤维细胞，经蓝白斑筛选，纯化表达NA基因的重组禽痘病毒rFPV-NA，用其免疫SPF鸡，检测该重组禽痘病毒的免疫原性。结果显示，该重组禽痘病毒能够在体外培养细胞内表达具有生物学活性的NA蛋白，表达产物的分子质量约为55ku；用该重组禽痘病毒免疫SPF鸡后，能够使免疫鸡获得对H5N1和H7N1两种亚型HPAIV攻击的部分保护。表明，重组禽痘病毒rFPV—NA具有良好的免疫原性。  相似文献   

H5N1亚型禽流感病毒神经氨酸酶基因的表达及纯化     

黎玉梅  邓国华熊蕊冉多良  陈化兰 《中国兽医科技》2007,37(9):783-786

用RT-PCR方法从H5N1亚型禽流感病毒（AIV）A／Duck／Zhejiang／12／00中获得NA基因，将目的基因定向克隆到原核表达载体pET-32a中，将序列测定和双酶切验证准确的阳性重组质粒转化大肠杆菌BL21，用IPTG诱导，经SDS-PAGE和Western-blot分析，结果显示，重组蛋白得到了可溶性表达，表达的蛋白质分子质量为33ku；该蛋白可以与禽流感H5N1亚型阳性血清反应，具有良好的免疫原性；ELISA检测结果表明，用此纯化蛋白作为包被抗原检测H5N1亚型AIV神经氨酸酶抗体具有良好的灵敏性。  相似文献   

H9N2亚型禽流感病毒传播途径特性的比较及其表面基因序列分析     

石火英  陈素娟  高崧  刘武杰  刘秀梵 《中国兽医学报》2007,27(1):26-30

选择中国大陆最早分离的H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)A/Chicken/Guangdong/SS/94(H9N2)(缩写为SS株)和1998年大流行时期分离的H9N2亚型AIVA/Chicken/Shanghai/F/98(H9N2)(缩写为F株)为研究对象,对其在SPF鸡体内的复制能力和传播途径特性比较后发现,F株在4周龄SPF鸡气管中的复制能力高于SS株,F株可以经气溶胶传播途径传播,SS株不能经气溶胶传播途径传播;利用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法获取F株和SS株的HA和NA基因的cDNA,序列分析得知,F株和SS株的HA和NA基因的同源性分别是96.6%和98.1%;HA基因的裂解位点氨基酸序列都是PARSSR↓GL,但有5个氨基酸的差异,即166位N(F)→D(SS)、198位A(F)→V(SS)、217位V(F)→I(SS)、335位G(F)→R(SS)、504位L(F)→S(SS);2株病毒的NA基因在63~65位都存在氨基酸缺失,但在NA基因红细胞吸附位点的氨基酸序列不同,分别是IKKDSRSG(F)和IKEDLRSG(SS)。F株和SS株的传播特性差异是否与其表面基因序列有关,有待进一步研究。  相似文献   

H1N1亚型猪流感病毒HA和NA基因双重RT-PCR定型检测方法的建立与应用     

温肖会  蔡春梅  魏文康  翟少伦  吕殿红  贾春玲  袁洁  黄忠  周秀蓉 《中国动物传染病学报》2014,(4):29-34

为了建立适用于临床诊断的H1N1亚型猪流感病毒快速检测方法,本研究根据GenBank已登录的H1N1亚型猪流感病毒HA和NA基因序列设计RT-PCR扩增引物,以H1N1亚型猪流感病毒、H3N2亚型猪流感病毒、猪瘟病毒和猪繁殖与呼吸综合征病毒为试验对照,通过优化RT-PCR反应条件和反应体系,建立了H1N1亚型猪流感病毒HA和NA基因双重RT-PCR定型检测方法。同时,运用H1N1亚型猪流感病毒血凝和血凝抑制试验方法和本研究建立的方法对165份猪病料样品进行了对比验证。结果表明,本研究建立的H1N1亚型猪流感病毒双重RT-PCR具有良好的特异性、敏感性、重复性,所扩增的目的基因片段大小分别为428 bp和678 bp左右,可检出最小基因组RNA浓度为2.9×10-5μg/μL。本研究建立的方法和H1N1亚型猪流感病毒血凝和血凝抑制试验方法均从同一份猪肺脏样品中检测出H1N1亚型猪流感病毒,其余样品中均未检出H1N1亚型猪流感病毒,两种方法符合率为100%。本研究建立的方法适用于H1N1亚型猪流感病毒双基因定型检测,可在H1N1亚型猪流感病毒流行病学调查和临床诊断中应用。  相似文献   

萘二甲酐减轻咪唑乙烟酸对油菜药害的效果和解毒机理初报     

黄春艳  王宇  李静  黄元炬  丛林  朴德万  叶非 《中国油料作物学报》2014,36(3):398

采用模拟咪唑乙烟酸土壤残留,以油菜盆栽试验研究萘二甲酐对咪唑乙烟酸土壤残留的解毒效果和解毒机理。结果表明,咪唑乙烟酸25g ai/hm2用量下对油菜有较重药害,可使油菜苗的株高、鲜重等生长指标和谷胱甘肽（GSH）含量、谷胱甘肽-S-转移酶（GST）活力、氨基酸含量等生理指标明显降低。用种子重量0.5%萘二甲酐（NA）湿润拌种处理油菜种子能减轻咪唑乙烟酸对油菜苗的药害。萘二甲酐+咪唑乙烟酸处理的油菜苗株高和鲜重明显高于咪唑乙烟酸处理。萘二甲酐和咪唑乙烟酸都能导致油菜苗的氨基酸含量发生变化,并对GSH含量和GST活力有不同程度的影响。与咪唑乙烟酸25g ai/hm2处理相比,萘二甲酐加入咪唑乙烟酸后,使16种氨基酸含量升高,只有脯氨酸含量降低,氨基酸总量升高;GSH含量略有增加,但GST活力有显著提高。可以认为提高油菜苗氨基酸含量和GST的活力是萘二甲酐对咪唑乙烟酸解毒的重要途径。  相似文献   

广西猪源H9N2亚型流感病毒的分离与鉴定     

韦达有  伍和明  蒋家霞  付薇  孙翔翔  何奇松  马琳  徐贤坤 《动物医学进展》2011,32(7):113-117

用SPF鸡胚从广西地区猪群中分离到1株H9N2型猪流感病毒(SIV),经鸡胚接种3代后出现稳定的鸡血红细胞凝集效价为27,且凝集性能被H9亚型阳性血清抑制,而不被其他亚型流感病毒阳性血清所抑制.分离株的HA基因及NA基因扩增结果显示,该毒株HA基因与流感病毒H9亚型同源性最高,NA基因与流感病毒N2亚型同源性最高,说明...  相似文献   

中科院北京植物园壳斗科植物鉴定     

刘牧  周世良  王玲 《林业科技》2012,37(2):57-59

利用DNA条形码技术对中科院北京植物园壳斗科专类园的23份植物材料进行鉴定,从Genebank中获得相关数据,选择matK、rbcL、trnH-psbA序列引物对样本材料进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增效率、有效片段获得率,用PAUP4.0 b10建物种关系树评价不同序列的鉴定能力。本研究认为,matK序列物种鉴别能力最高,种间变异差异最大的为trnH-psbA序列,rbcL相对保守。  相似文献   

新城疫病毒HN蛋白结构及其生物学活性研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

王三虎  李杰  王选年  杭柏林  王丽荣  姚四新 《安徽农业科学》2006,34(23):6213-6214,6219

新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)HN糖蛋白位于病毒囊膜表面,与病毒的毒力及致病性密切相关,因此在NDV的研究中具有重要的意义。从HN蛋白的1级结构、空间结构分析了与其相应的受体结合能力、神经氨酸酶活性和促膜融合活性等生物学活性。  相似文献   

Photosynthesis,growth and yield of soybean and maize in a tree-based agroforestry intercropping system on the Loess Plateau     

Xiaobang Peng  Yuanying Zhang  Jing Cai  Zaimin Jiang  Shuoxin Zhang 《Agroforestry Systems》2009,76(3):569-577

Agroforestry is the most effective way to restore the disturbed lands on the Loess Plateau and to develop the poor local economy. In order to maximize the potential benefits of tree-based intercropping systems, photosynthesis, growth and yield of soybean and corn were studied by measuring photosynthetic active radiation (PAR), plant water deficit and soil moisture in a 4-year-old plantation of walnut (Juglans regia L.) and plum (Prunus salicina) grown at a spacing of 5 m × 3 m on the Loess Plateau. The effects of tree competition significantly reduced PAR, net assimilation (NA), growth and yield of individual soybean or corn plants growing nearer (1 m near tree row) to tree rows. NA was highly correlated with growth and yield of the both crops. These correlations were higher for corn than soybeans, with corn, rather than soybeans being more adversely impacted by tree shading. Plum, rather than walnut had the greatest competitive effect on PAR and NA. Daily plant water deficits were non-significantly and poorly correlated with NA and growth and yield of the both crops. However, soil moisture (20 cm depth) was significantly correlated with biomass and yield of both crops. Possible remediation strategies are discussed to reduce tree competitive interactions on agricultural crops.  相似文献