猪钙蛋白酶抑制蛋白基因的多态性分析   总被引：4，自引：0，他引：4  

杨晓慧  刘源  武英  樊新忠  姜运良 《中国畜牧杂志》2006,42(19):8-9

钙蛋白酶抑制蛋白的638位氨基酸由丝氨酸(Ser)突变为精氨酸(Arg)可改善猪的肉质,是一个有重要育种应用前景的分子标记。本研究采用PCR-RFLP技术对47头莱芜猪,53头大白猪,45头杜洛克和60头商品杂交猪共205个个体钙蛋白酶抑制蛋白Ser638Arg突变的多态性进行了分析。结果表明:4个猪群均检测到AA、CA和CC3种基因型。其中莱芜猪突变等位基因A频率最低,为0.415;大白猪、杜洛克和商品杂交猪A的频率分别为0.632、0.800和0.750。莱芜猪A的基因频率极显著低于其他4个猪种(P<0.01)。所检测的4个猪群在该突变位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。  相似文献   

Phenotypic and genetic characterization of Erwinia carotovora from mulberry (Morus spp.)     

S. T. Seo  N. Furuya  C. K. Lim  Y. Takanami  K. Tsuchiya † 《Plant pathology》2003,52(2):140-146

Phenotypic and genetic characteristics of nine bacterial strains isolated from mulberry ( Morus spp.), which were originally described as Erwinia carotovora ssp. carotovora (Ecc), were investigated. Based on the results of biochemical tests, these bacterial strains were divided into two different types, type 1 and type 2. Two strains of type 1 were similar to Ecc, whereas seven strains of type 2 were distinct from Ecc. A polyphasic study that included serological assay, specific PCR assay for E. carotovora ssp. atroseptica (Eca), PCR-RFLP of a pectate lyase ( pel ) gene and RAPD-PCR was performed on the type 2 strains, and the data were compared with those of related E. carotovora subspecies. The results of serological and specific PCR assays for Eca showed that the type 2 strains were distinct from Eca. In RFLP analysis of the pel gene using Sau 3AI, the type 2 strains showed a unique RFLP pattern. On the basis of RAPD analysis, similarity of RAPD patterns within the type 2 strains was very high. A unique RAPD fragment was isolated from the type 2 strains and used as a probe for Southern hybridization. This probe hybridized only with PCR products from the type 2 strains. Based on phenotypic, serological and genetic characteristics, the type 2 strains isolated from mulberry may belong to a distinct E. carotovora subspecies other than Eca or Ecc.  相似文献   

昆虫病原线虫rDNA多态性分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

丘雪红韩日畴  许再福 《昆虫天敌》2003,25(3):130-144

本文对国内外昆虫病原线虫斯氏属和异小杆属的47个品系进行rDNA—ITS PCR—RFLP分析，研究其DNA多态性，并构建了分子系统发育树状图。各品系的ITS区无明显的长度差异，PCR—RFLP分析将47个品系分为斯氏属和异小杆属两大类，两属线虫又分别分为11组和4组。所得结果丰富了ITS PCR—RFLP图谱库，为弄清我国的昆虫病原线虫与国外种类的分子系统发育关系及未定名线虫的鉴定提供重要依据，同时为筛选适合的线虫种类防治害虫奠定基础。  相似文献   

对鳞翅目害虫有活性的cry1C基因的克隆和表达   总被引：2，自引：0，他引：2       下载免费PDF全文

宋福平  张杰  韩岚岚  高继国  黄大昉 《植物保护学报》2003,30(2):161-165

在鉴定苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis，简称Bt)Btc001菌株cry基因型的基础上，构建了Btc001菌株质粒DNA HindⅢ片段的文库，并利用聚合酶链式反应-限制性酶切片段多态性(PCIR-RFIP)方法筛选出含有crylC6全长基因的13．5kb大片段，酶切分析得到该片段的物理图谱，BamHI和EcoRI切完成了6．5kb含全长基因的亚克隆，并对这条6．5kb片段亚克隆、测序，序列在国际核酸序列数据库(GenBank)登记(AY007686)，并由Bt杀虫晶体蛋白基因国际命名委员会命名为cry1Cb2基因。根据序列设计了一对用于扩增全长基因的引物S581CB和S381CB，扩增产物插入表达载体pET-21b中，诱导后在大肠杆菌BL21(DE3)中获得高效表达。表达产物对小菜蛾(Plutella xylostella)表现出较高活性，LC50达到7．9μg/ml。  相似文献   

新扬州鸡IGF-1基因多态性与早期生长速度关系的研究   总被引：9，自引：2，他引：9  

王志跃  范刚  杨海明  汪张贵  盛东风  刘桂琼 《中国家禽》2004,26(24):9-12

以150只非同胞新扬州鸡为材料，采用PCR—RFLP法检测了该基因5’调控区DNA序列多态性，并运用线性模型统计方法分析了多态性与初生重和12周龄体重的关系。结果显示：新扬州鸡IGF-1基因5、调控区自然存在两种不同DNA序列，经。PstⅠ酶切后出现3种基因型(“-／-”、“-／ ”、“ ／ ”)，基因型分布符合哈代一温伯格定律。各基因型个体的初生重、12周龄体重的最小二乘均数存在“-／-”＞“ ／-”＞“ ／ ”的趋势，且“-／-”型个体的12周龄体重显著高于“ ／ ”型个体(P＜0．05)。  相似文献   

西安荷斯坦奶牛群5个基因座位遗传多态性的PCR-RFLP分析   总被引：6，自引：0，他引：6  

张润锋  陈宏  蓝贤勇  田燚  潘传英  胡沈荣  苏利红 《畜牧兽医学报》2005,36(6):545-549

应用PCR-RFLP方法对西安荷斯坦牛的κ-en、β-lg、β-lg5′侧翼区、CSN1S2、IGFBP-3共5个基因座位进行了多态性分析。结果表明，在西安荷斯坦牛群中，没有发现携带CSN1S2^P等位基因的个体，其多态信息含量为0。κ-en基因座位呈现低度多态(PIC=0．2366)，β-lg、β-lg5′侧翼区、IGFBP-3基因座位的多态信息含量分别为0．3168、0．3689、0．4439，均呈现中度多态。κ-en、β-lg、β-lg5′侧翼区、IGFBP-3、CSNIS2基因座位的杂合度和DNA多态度分别为0．2742、0．3947、0．4879、0．4891、0和0．0255、0．0116、0．0333、0．0112、0。而且，在西安荷斯坦牛群中，κ-en、β-lg、β-lg5′侧翼区、IGFBP-3共4个基因座位均处于Hardy-Weinberg平衡状态，CSN1S2基因座位处于纯合状态。  相似文献   

猪ECH1基因部分序列的遗传变异分析     

张冬杰  刘娣  汪亮  王文涛  杨国伟 《黑龙江畜牧兽医》2011,(19)

为了进一步研究烯脂酰辅酶A水解酶1(enoyl CoA hydratase,ECH1)基因的生物学功能,研究采用克隆测序结合PCR-RFLP的方法分析了民猪ECH1基因的部分DNA序列,并对其中的1个点突变进行了3个猪种内的基因型频率和基因频率计算。结果表明:研究所检测的ECH1基因序列与网上已有序列相比存在8个单核苷酸多态性(SNPs)位点,其中有2个造成酶切位点的改变;民猪和大白猪在PCR-RFLP-BamHⅠ位点的A、B基因频率均接近0.5,而长白猪B为优势等位基因。  相似文献   

钙蛋白酶3(CAPN3)基因多态性与牛胴体性状的关联分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

侯冠彧  曾鸿普  王东劲  管松  黄显洲  许尚忠 《畜牧兽医学报》2010,41(4)

为了探讨钙蛋白酶3(Calpain3,CAPN3)基因作为影响牛肉质性状候选基因的可能性,寻找与牛肉质性状相关的分子标记,对CAPN3基因的5′端区域进行SNPs检测,分析不同基因型在不同品种或者组合群体间的分布规律。利用测序和PCR-RFLP的方法进行SNPs检测和基因型分析,计算等位基因频率、各位点多态信息含量。结果发现,2546位处发生点突变C→T。各位点的3种基因型与牛生产性状的最小二乘分析结果表明,AB与BB基因型个体在胴体质量指标上存在显著差异(P0.05)。初步推断CAPN3基因可能是影响牛肉质性状潜在的主效基因或与主效基因连锁,并且这个位点具有成为分子标记的潜在可能。  相似文献   

滇南小耳猪与巴马小型猪SLA-DQA基因多态分析   总被引：8，自引：2，他引：8  

李华  于辉  蒋岸岸  李学伟  田允波  赵海全  陈云 《畜牧兽医学报》2006,37(5):430-435

对滇南小耳猪和巴马小型猪的SLA-DQA基因的部分内含子1、完整的外显子2和部分内含子2共341bp片段进行了PCR-RFLP酶切分型,结果表明：2品种经EcoR Ⅰ酶切后BB基因型频率（0.468 8）高于AB型（0.375 0）,AA型最低（0.156 3）,B为优势基因（0.656 3）,A为劣势基因（0.343 7）.经AluⅠ酶切后,滇南小耳猪MM基因型频率（0.500 0）高于MN型（0.321 4）和NN型（0.178 6）;而巴马猪则以MN基因型频率（0.485 3）高于MM型（0.338 2）和NN型（0.176 5）;2个品种中M等位基因（0.604 2）频率高于N等位基因（0.395 8）.经分析表明,2猪种在两酶切位点上各分型已达Hardy-Weinberg平衡.巴马小型猪和滇南小耳猪中分别存在9种和7种PCR-RFLP组合基因型,其中BBMN为优势组合基因型,AAMN为劣势组合基因型;AAMM组合基因型在2品种间差异显著（P＜0.05）.遗传多态参数分析表明：SLA-DQA基因外显子2的两酶切位点在2猪种间均表现为中度多态,AluⅠ的基因多样性略高于EcoRⅠ,巴马小型猪杂合性略高于滇南小耳猪,2品种间遗传距离为0.000 4.  相似文献   

A-FABP 在不同鸡种中遗传多态性分析   总被引：6，自引：0，他引：6  

陈宽维  章双杰  屠云洁  汤青萍  高玉时  李慧芳 《畜牧兽医学报》2006,37(11):1114-1117

利用PCR—RFLP技术和DNA测序检测了尤溪麻鸡、鹿苑鸡、隐性白羽鸡3个鸡种共计96只鸡的脂肪细胞型脂肪酸结合蛋白（A—FABP）第85位点和第1805位点的遗传变异。结果表明：1）在这2个位点上，3个鸡种均存在变异，外来品种隐性白羽鸡以杂合子Cc居多；地方鸡种以cc居多，3个鸡种均含有较高频率的等位基因c，其中以尤溪麻鸡最高，而以隐性白羽鸡最低。2）A—FABP第85位点不影响A—FABP的氨基酸序列；而第1805位点的遗传多态性影响氨基酸序列的变化：由脯氨酸变为丝氨酸，说明该多态性可能通过A-FABP基因的表达水平从而影响鸡的肉质。本试验为进一步分析A-FABP基因的遗传变异与肌内脂肪含量的关系及该分子标记在育种计划中的应用奠定基础。  相似文献