番鸭细小病毒强毒株（MDPV—Q）VP2基因的序列分析   总被引：1，自引：0，他引：1  

娄华  杨德威等 《中国预防兽医学报》2001,23(5):324-328

应用PCR技术扩增了MDPV－Q株的VP2蛋白基因片段。将扩增后的VP2基因重组到pMD18－T质粒载体上，并对插入片段进行序列测定。将测序结果及由该结果推的氨基酸序列分别与MDPV、GPV进行了同源性比较及分析。结果表明，我国分离的MDPV－株其VP2基因序列外分离株具有很高的同源性。而与GPV的同源性较低。  相似文献   

番鸭细小病毒安徽分离株结构蛋白基因的克隆及序列分析     

戴银  张丹俊  赵瑞宏  沈学怀  胡晓苗  侯宏艳  潘孝成  周学利 《动物医学进展》2017,38(4)

为研究番鸭细小病毒(MDPV)安徽分离株的遗传变异特征,通过PCR扩增获得了MDPV结构蛋白(VP)基因全长序列AH-MDPV-VP,并将该序列与GenBank中登录的12条MDPV和鹅细小病毒(GPV)VP基因序列进行比对。结果显示,AH-MDPV-VP基因全长2 199bp,包括完整的VP1、VP2和VP3蛋白编码区。MDPV与GPV的VP基因部分序列一致,但具有明显的差异。进化分析显示,MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH为同一分支,亲缘关系较近。同源性分析显示二者核苷酸序列同源性最高,为99.9%,且AH-MDPV-VP与GPV毒株SHFX1201的序列同源性也有89.5%。此外安徽分离株与其他MDPV的VP1、VP2和VP3基因同源性有逐步下降的趋势,而与GPV则相反呈上升趋势。进一步显示MDPV安徽分离株与基因重组型MDPV上海分离株SAAS-SHNH相似,可能为MDPV和GPV基因重组型水禽细小病毒。  相似文献   

鹅细小病毒VP1基因的克隆及序列分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

马波王君伟  李洪涛刘宝全 《中国兽医科技》2003,33(12):7-10

参照GenBank中收录的鹅细小病毒(GPV)B株基因序列设计并合成了扩增GPV H1株VP1的1对引物，利用PCR技术扩增出长约2．2kb的目的片段，将其克隆到pMD 18-T载体上，进行了序列测定及分析。测序结果表明，GPV H1株VP1基因由2199个核苷酸组成，编码732个氨基酸。经与B株、YG株进行同源性比较，核苷酸的同源性分别为98．50％和93．18％；推导的氨基酸同源性分别为98．09%和95．77％。  相似文献   

番鸭细小病毒弱毒株VP2基因的序列分析     

娄华  贺东升等 《中国兽医科技》2002,32(6):6-10

将番鸭细小病毒强毒株MDPV－Q经番鸭胚传代，获得致弱株MDPV－26，应用PCR技术扩增MDPV－26株的VP2基因片段，将扩增后的VP2基因重组到pMD 18-T质粒载体上，并对插入片段进行序列测定，将测定结果及由该结果推导的氨基酸序列分别与MDPV－Q株及国外已发表的MDPV相应序列进行同源性比较及分析，结果表明，MDPV－26与强毒株MDPV－Q的VP2基因序列及与国外分离株均具有很高的同源性。  相似文献   

番鸭源鹅细小病毒ZQ株VP2基因的克隆和序列分析     

宋永峰  周丽  周全  高恒  宋延华  温纳相 《动物医学进展》2009,30(7):42-45

根据国内外已发表的鹅细小病毒(GPV)B株和GD株基因序列,应用DNA Star分子生物学软件设计一对引物,应用PCR技术扩增GPV ZQ株的结构蛋白基因VP2全基因片段。将扩增得到的VP2全基因克隆到pMD18-T载体上,获得的重组质粒经PCR鉴定后进行序列测定。结果表明ZQ株基因大小为1 764 bp,编码587个氨基酸,其基因序列与GPV参考毒株推导的氨基酸序列同源性在89.1%~99.3%之间,差异较大;与番鸭细小病毒(MDPV)参考毒株相比同源性在92.0%~92.5%之间,超过与部分GPV毒株的同源性,推测可能与该毒株来源于番鸭而不是鹅有关,另外也在基因水平上解释了GPV与MDPV在血清学上存在交叉反应的部分原因。  相似文献   

番鸭细小病毒和鹅细小病毒广东株VP1基因的克隆与序列分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

季芳  张毓金  杨增岐  宋长绪 《中国预防兽医学报》2004,26(4):245-247,251

参考GenBank中的MDPV FM株和GPV B株全基因序列,设计并合成一对引物,分别对MDPV GD株和GPV GD株的结构蛋白基因(VP1)进行PCR扩增,并克隆到pMD18-T载体,筛选到重组质粒并测序.通过对MDPV GD株和GPVGD株的VP1基因的核苷酸序列分析,这两种病毒VP1基因大小均为2 199 bp,核苷酸序列同源性为87%,而位于VP1基因上的VP2至VP3基因起始密码子之间的核苷酸序列的差异较大,同源性仅为64%.另外对MDPV GD株和GPV GD株与各地方毒株的VP1和VP3基因核苷酸序列的同源性比较,显示它们之间差异较小.  相似文献   

鹅细小病毒国内分离株主要结构蛋白（VP2—VP3）基因的克隆和序列分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

李雪梅  章金刚等 《动物科学与动物医学》2001,18(3):31-34

根据国外已发表的鹅细小病毒（GPV）A株基因组核苷酸序列设计了一对引物，对国内两株鹅细小病毒毒株（GPV CC株）和（GPV FS株）主要结构蛋白（VP2－VP3）基因进行PCR扩增，并克隆到pCR3.1T载体,分别获得正向，反向连接重组持粒PVPC1，PVPC2和PVPF1，PVPF2，经酶切鉴定选出阳性克隆质粒并进行核苷酸序列分析比较，序列分析结果表明：GPV CC株和GPV FS株VP2－VP3的核苷酸大小分别为1764bp和1763bp，其中GPV CC株与A株同源性达到98．9％，GPV FS株缺失一个碱基，与A株同源性为93．5％，与GPV CC株同源性为93％。  相似文献   

三株鹅细小病毒VP3基因的克隆和序列研究     

曹宗喜  叶保国  林哲敏  张桂红 《中国家禽》2013,35(13)

为深入研究鹅细小病毒VP3基因的功能,利用PCR方法克隆了3株GPV分离株的VP3基因,并将其与pMD18-T载体连接,转化到感受态大肠秆菌Top10中,经PCR鉴定后,对插入片段进行序列测定及分析.结果表明:3株GPV VP3基因全长均为1 605 bp,编码534个氨基酸.不同毒株主要结构蛋白VP3基因与鹅细小病毒B株核苷酸序列同源性为93.8％～98.5％,但强弱毒株间也存在一定差异.  相似文献   

鹅细小病毒NS2基因的克隆和序列分析   总被引：5，自引：0，他引：5  

邢明伟  王君伟  贺云霞  布日额 《中国预防兽医学报》2003,25(3):195-197

本研究参考CerBank发表的GPV B株全基因序列，设计并合成一对引物，通过PCR技术扩增出GPV H1株NS2基因，目的片段长约1．4kb，将目的片段克隆到pMD18-T载体后进行序列测定和分析，结果表明：GPV H1株NS2基因全长1356bP，编码451个氨基酸，与国外已发表的GPV B株相比核苷酸序列同源性为98．75％，推导氨基酸序列同源性为98．67％。  相似文献   

番鸭细小病毒MDPV YZ株VP2和VP3蛋白基因的克隆和序列测定     

陈晓月  李雪梅 《中国兽医科技》2001,31(10):3-5

根据国外已发表的番鸭细小病毒（MDPV）FM株基因组核苷酸序列设计了1对引物，应用PCR技术扩增了MDPV YZ株的VP2和VP3蛋白基因片段。将扩增后的VP2和VP3蛋白基因克隆到pCR3.1T载体上，MDPV YZ株基因大小为1764bp，编码528个氨基酸，并对播入片段进行序列测定。测定结果表明，我国分离的MDPV YZ株蛋白基因序列与国外发表的序列的同源性为98.5%。  相似文献   

番鸭细小病毒ＭＤＰＶ—Ｑ株ＶＰ２蛋白基因的克隆与序列测定   总被引：3，自引：0，他引：3  

娄华  白挨泉  顾万军  杨德威  贺东升  刘福安 《中国预防兽医学报》2001,23(1):4-7

根据genebank中番鸭细小病毒（ＭＤＰＶ）的基因序列，设计了一种引物ＬＨＭＰ７／ＬＨＭＰ８，同时在这２条引物中分别加入２种限制性核酸内切酶SacⅡ和KpnⅠ的酶切位点，使扩增后的ＤＮＡ片段的两端，分别含有这２种酶的酶切位点。应用ＰＣＲ技术扩增了ＭＤＰＶ－株的ＶＰ２蛋白基因片段。将扩增后的ＶＰ２蛋白基因重组到pMD18-T质粒载体上，并插入片段进行序列测定，测定结果表明，我国分离的ＭＤＰＶ－Ｑ株基ＶＰ２蛋白基因序列与国外分离株的同源性达９７．９％。  相似文献   

1株重组型番鸭细小病毒的分子特征解析     

鲍芳  秘清灵  徐静雯  王昱  吴剑梅  王志仙  王建业  朱国强 《中国兽医学报》2021,(1):33-37

为了对1株番鸭细小病毒(MDPV)分离株NY18株的分子特征予以准确揭示,通过设计重叠PCR引物,扩增NY18株的完整基因组并进行了测序。结果显示,NY18株基因组由5071个碱基组成,5′和3′端末端倒置重复序列(inverted terminal repeats,ITR)均由424个碱基组成,其外侧385个碱基形成回文发夹结构。Simplot 3.5.1和RDP4软件分析表明,NY18株经历了2次重组事件,第1次重组产生在VP3基因的1.1 kb区域,第2次重组事件产生在P9启动子至Rep基因上游约100 bp区域内。2次重组均以经典型MDPV YY株作为主要亲本,而经典型鹅细小病毒(GPV)强毒株DY16和鹅胚化的弱毒疫苗株SYG61v作为次要亲本参与了重组。NY18株的ITR与经典型MDPV FM和YY株的同源性为97.9%和99.1%,而与GPV强毒株YZ99-6的同源性仅有86.0%,表明NY18株ITR仍来自于经典型MDPV。以VP1基因1.1 kb重组区片段构建遗传进化树,NY18株与经典型GPV处于同一分支,而以非重组区的Rep1基因1774 bp和VP1基因氨基端694 bp、羧基端405 bp片段分别构建遗传进化树,NY18株则与经典型MDPV处于同一分支。结果表明,NY18株既不同于经典型MDPV也不同于GPV,其本质是1株重组型的MDPV。  相似文献   

禽细小病毒分子生物学研究进展     

何长生  魏建忠 《动物医学进展》2003,24(3):12-14

鹅细小病毒 (GPV)和鸭细小病毒 (MD-PV)是两种感染禽类的自主性细小病毒 ,由它们引起的鹅细小病毒病和雏番鸭细小病毒病是目前严重危害养鹅业和养鸭业的主要疫病。 GPV和 MDPV在形态结构、理化特性、免疫学特性甚至基因组结构等方面十分接近 ,但是二者在致病性上却有较大差异。对于这种差异 ,国内外学者从分子生物学角度进行了大量研究。文章主要从这两类病毒的基因组核苷酸序列、非结构蛋白基因、核衣壳蛋白基因、非结构蛋白和核衣壳蛋白的分子生物学上的同源性和差异性进行了综述 ,同时 ,对于禽细小病毒有待研究的方面也进行了探讨  相似文献   

番鸭细小病毒国内分离株主要结构蛋白基因的克隆和序列分析     

陈晓月  赵承辉  章金刚  李雪梅  金宁一  向华  赵玉军 《中国家禽》2006,28(24):9-12

根据国外已发表的番鸭细小病毒(MDPV)FM株基因组核苷酸序列设计1对引物,应用PCR技术扩增MDPV FS株的VP2-VP3蛋白基因片段。将扩增后的VP2-VP3结构蛋白基因克隆到T载体上,MDPV FS株基因大小为1764bp,编码528个氨基酸,对插入片段进行序列测定。结果表明,我国分离的MDPV FS株基因序列与国外发表序列的同源性为98.6%,与已发表的YZ株同源性为99.5%,可见番鸭细小病毒结构蛋白基因较保守。  相似文献   

2008年-2009年广东番鸭细小病毒分子流行病学研究     

宋永峰  吴发兴  宋延华  黎敏  周全  周丽  温纳相 《中国动物检疫》2010,27(1):39-40,46

VP2基因是番鸭细小病毒(MDPV)的主要免疫原性基因,其编码的VP2蛋白能够诱导机体产生中和抗体。本文对2008年～2009年从广东各县市分离、鉴定的11个MDPV野毒株VP2基因进行克隆测序,并对获得的VP2基因序列进行比较和分析。结果表明:11个不同分离株之间核苷酸序列同源性为98.7%-100%;与6个国内外参考毒株同源性为97.7%-99.6%;所有毒株都含有4个完全相同的潜在糖基化位点;说明该病毒保守度高,仅有个别的点突变。将分离株SL2连续传70代获得致弱毒株SL-70,动物实验结果表明SL70株对雏鸭无致病力;经测序发现SL-70与其祖代分离株SL2的VP2基因序列同源性高达99.9%,仅发生了18个碱基的点突变。  相似文献   

鹅细小病毒和番鸭细小病毒双重PCR检测方法的建立   总被引：1，自引：0，他引：1  

鲜思美  文心田  曹三杰  黄小波 《畜牧与兽医》2010,42(4)

根据GenBank上登录的鹅细小病毒(GPV)和番鸭细小病毒(MDPV)基因序列,分别设计合成针对GPV非结构蛋白(NS)和MDPV NS2-VP1基因片段的2对引物GPV U/L和MDPV U/L,将GPV和MDPV提取核酸混合后作为模板,优化PCR反应条件,建立了能同时检测这2种病毒的双重PCR。特异性试验结果显示,引物GPV U/L仅特异性扩增出GPV-GZ1和GPV-GZ2株730bp核酸片段,引物MDPVU/L仅特异性扩增出MDPV的624bp核酸片段,双重PCR扩增出长度分别为730bp和624bp的2条特异性片段,而扩增鸭瘟病毒(DPV)和鹅副黏病毒(GPMV)的核酸扩增结果均为阴性。敏感性试验结果显示,双重PCR能同时检测到14.4pg的GPV核酸和28.8pg的MDPV核酸。结果表明,建立的双重PCR可用于GPV和MDPV的鉴别诊断和联合检测。  相似文献   

重组型番鸭细小病毒JH10株的分子特征解析     

王志仙  秘清灵  凌珏怡  贾婧宇  鲍芳  王昱  王钜华  王建业  朱国强 《中国动物传染病学报》2020,(2):66-71

为了解析番鸭细小病毒(MDPV)分离株JH10的分子特征,本研究对该毒株全基因组进行了扩增、测序、重组分析及遗传进化树的构建。结果显示:JH10株基因组由5071个核苷酸组成,P9启动子区和VP3基因内部约1.1 kb区域经历了重组,GPV鹅胚化弱毒株SYG61v参与了P9启动子区的重组,而GPV强毒株LH、B和SYG61v不同程度地参与了VP3基因内部的重组;以VP3基因重组片段构建遗传进化树,JH10株与8个经典型GPV株处于同一个进化分支中,而以毗邻的上下游非重组区片段分别构建的遗传进化树中,JH10株则与4个经典型MDPV株处于同一分支。本研究结果表明,JH10株为经典型MDPV和GPV之间的重组产物,该研究结果为进一步阐明重组型MDPV的致病机理奠定了基础。  相似文献   

鹅细小病毒基因组结构特征研究进展   总被引：1，自引：0，他引：1  

朱海侠  万春和  黄瑜 《中国兽医寄生虫病》2011,19(1):82-86

鹅细小病毒（Goose parvovirus,GPV）属细小病毒科,细小病毒属,由我国学者方定一1956年首次分离报道。GPV基因组约5 Kb,由左右2个完整的开放阅读框（open reading frame,ORF）组成：LORF（left ORF）和RORF（right ORF）。LORF编码非结构蛋白（nonstructural protein,NS）NS1和NS2,RORF编码VP1、VP2和VP3三种结构蛋白。本文针对近年来鹅细小病毒基因组结构特征的研究进展进行了综述。  相似文献