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1.
Ahlawat SP Sunder J Kundu A Chatterjee RN Rai RB Kumar B Senani S Saha SK Yadav SP 《British poultry science》2004,45(2):194-200
1. The present study was conducted to estimate genetic relatedness among Nicobari fowls (Brown, Black and White) and an exotic bird (White Leghorn) using random amplified polymorphic DNA (RAPD) polymorphism. 2. A total of 25 decamer primers were screened among all the breeds of which 24 primers amplified the genomic DNA, generating 2000 to 200 bp bands. Ten primers generated reproducible and distinct RAPD profiles and were used for further analysis. 3. A total of 94 bands were amplified and 30 polymorphic bands (32%) were produced. The number of polymorphic loci ranged from 1 to 5 with an average of 3.0. 4. Among the native breeds Brown Nicobari showed higher genetic similarity (0.85) than Black Nicobari (0.80) and White Nicobari fowl (0.82). 5. Brown Nicobari showed high genetic similarity with Black Nicobari (0.87 +/- 0.029); least similarity was between White Nicobari and White Leghorn (0.77 +/- 0.028). 6. The RAPD profile of all Nicobari fowls on amplification with the primers PBG5 and PBA12 showed specific bands of molecular size 1050 and 785 bp, respectively. 7. The native breeds showed the least genetic distance with each other while White Leghorn appeared to be most distant from the native breeds. 相似文献
2.
利用SSR、ISSR和RAPD技术构建苜蓿基因组DNA指纹图谱 总被引：58，自引：13，他引：45
在建立可靠的苜蓿基因组DNA提取分离和PCR扩增技术体系的基础上,筛选具有稳定多态性位点的RAPD、SSR和ISSR引物,建立苜蓿基因组DNA的SSR、ISSR和RAPD分子标记技术体系,并利用分子标记检测苜蓿品种(系)的DNA分子标记多态性,构建苜蓿品种的DNA指纹图谱.筛选出36个RAPD引物,8个SSR引物和12个ISSR随机引物,通过PCR扩增在55个国内外苜蓿品种(系)中获得了182个RAPD多态性位点和丰富的SSR和ISSR多态性位点,构建了55个苜蓿品种(系)的SSR、ISSR和RAPD指纹图谱.结果表明,不同苜蓿品种(系)的SSR多态性有较大差异;苜蓿品种ISSR指纹图谱多态性丰富,稳定性比RAPD强;可以通过2～3个引物鉴别我国主要苜蓿品种和引进品种,SSR和ISSR指纹图谱可以更好地用于苜蓿品种鉴定和遗传多样性分析. 相似文献
3.
4个绵羊品种随机扩增多态DNA分析 总被引：10，自引：0，他引：10
本研究利用RAPD技术研究了小尾寒羊、大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊 4个绵羊品种的亲缘关系。从 10 0条引物中筛选出的 16条引物 ,共扩增出 14 6条带 ,其中 94条表现出多态性 ,占 6 4 .4 %。它们间遗传距离较小 ,小尾寒羊与大尾寒羊、洼地绵羊、滩羊的遗传距离分别为 0 .0 6 4 9、0 .0 6 73和 0 .10 2 8,用UPGMA法构建了树状聚类图。结果显示 ,小尾寒羊、大尾寒羊和洼地绵羊首先聚一起 ,说明它们亲缘关系较近 ,起源于共同的原始祖先。据推测滩羊也起源于蒙古羊 ,但它生活在陕西、宁夏等省 ,与山东环境条件差别较大 ,在自然选择的作用下发生了变异 ,这可能是滩羊与其它绵羊间遗传距离大的主要原因。在本研究过程中还发现了各品种的分子标记 相似文献
4.
以1份美国进口马蹄金(Dichondra repens)品种为对照,用RAPD和SRAP两种分子标记方法研究20份野生马蹄金种质资源的遗传多样性。结果发现,20条RAPD引物扩增出多态性条带130条,多态性比率为68.78％;22对SRAP引物扩增出175条多态性条带,多态性比率为72.31％,表明20份野生马蹄金之间具有较丰富的遗传多样性。聚类结果表明,RAPD标记将供试材料聚为两大类群,SRAP标记也将材料划分为两大类。两种标记下,供试材料呈现出较好的地域性分布规律,地理来源相近的材料能大致聚为一类,部分同聚为一类的材料在形态上也具有相似性。两种标记方法相关系数r0.01=0.910,二者存在极显著正相关,表明应用这两种技术对马蹄金遗传多样性与亲缘关系的分析具有较高的一致性和可信度。 相似文献
5.
云南4个马品种的随机扩增多态DNA（RAPD）分析 总被引：6，自引：0，他引：6
本文利用随机扩增多态ＤＮＡ技术研究了云南４个马品种４８个个体的遗传变异和系统发育关系。在所使用的２５个引种中，有２２个引物扩增出多态谱带。 相似文献
6.
The purposes of this study were to assess the genetic variability between Taoyuan (T) and Duroc (D) pigs using randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) fingerprints and to evaluate the genetic relationship to a commercial synthetic line-Taiwan Black (TB) pig (75% D, 25% T). To assess the genetic variability between T and D, 71 random primers (Operon) were used for RAPD fingerprinting by polymerase chain reaction (PCR). The evaluation of the genetic relationship was based on band sharing frequency and band frequency. Thirty-five of the 71 primers (49%) could generate polymorphisms in RAPD fingerprints of T or D pigs. Twenty-two primers produced polymorphic bands from only T genomic DNA, and 14 primers could produce polymorphic bands from only D genomic DNA. These results indicated that there was some genetic difference between T and D pigs. The within-population genetic similarity (WGS) for T, D, and TB populations were 0.742, 0.747, and 0.745, respectively, the between-population genetic similarity (BGS) was 0.946 between T and TB; 0.953 between D and TB; and 0.934 between D and T. The parameters of genetic distance between T and TB; D and TB, T and D were 0.080, 0.064, and 0.096, respectively. When the values of genetic similarity and genetic distance between populations estimated as frequency of occurrence of bands showed lower genetic similarities between pig populations, but indicted similar relationship. TB was genetically more related to D than to T. It provided evidence of the usefulness of the RAPD technique to determine genetic relatedness among T, D, and TB. 相似文献
7.
早熟禾属植物种间关系的RAPD分析 总被引：19，自引：7，他引：12
利用随机扩增多态性DNA（RAPD）技术对10种早熟禾植物进行了基因组DNA多态性分析，对30个OPRON公司十聚体随机引物进行多态性筛选，28个可产生多态性，18个引物产生的250个DNA片段，用于计算种间的欧氏遗传相似性系数分析，在Statistic统计软件按非加权算术平均数（UPGMA）进行聚类并构建系统发育树状图，结果，10种早熟禾植物种间的亲缘关系，其变幅主要在6．7－8．5之间；其中P.botryoides与P.psilolepis之间的遗传距离最小，为6．7，其次是P.sinattenuata与P.sphondylodes遗传距离较近，为6．8，而P．sikkimensis与P.pratensis,P.sikkimensis与P.psilolepis之间的距离最远，均为10．5，这与形态学分类结果基本一致，说明RAPD分析方法可从分子生物学角度为早熟禾属植物的系统学分类提供更为有利和可靠的证据。 相似文献
8.
RAPD技术对地方鸡种群体遗传结构的分析 总被引：16，自引：1，他引：15
利用ＲＡＰＤ技术对４个地方鸡种和１个引进鸡种的群体遗传结构进行分析，通过筛选的５个随机引物ＯＰＨ－０２、ＯＰＨ－０５、ＯＰＨ－１３、ＯＰＨ－１６、ＯＰＧ－０７对５个鸡种的池ＤＮＡ进行多态性研究，结果表明：５个引物共产生条带６１个，扩增产物片段的长度一般从１５０ｂｐ－４ｋｂ。 相似文献
9.
为保护和开发地方品种猪的遗传资源,采用随机扩增多态DNA(RAPD)法分析皖北猪个体之间的遗传多样性。试验方案采用L(35)正交法,优化RAPD反应条件;筛选7条特异引物对皖北猪进行RAPD分析,计算带谱相似率、平均杂合度和遗传相似度,UPGMA法进行聚类分析。试验结果表明,优化的皖北猪RAPD反应体系为Mg2+浓度3 mmol/L,Taq酶1.50 U,dNTPs浓度0.40 mmol/L,引物浓度0.50μmol/L,模板浓度1 mg/L。皖北猪群处于亲缘关系不清的遗传非均衡状态。 相似文献
10.
应用随机扩增多态性DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD) 技术分析河南省4个地方鸡的品系,固始鸡快羽GK系、固始鸡慢羽GM系、矮小型绿壳蛋鸡、黄麻羽丝毛乌骨鸡的遗传变异。用186个随机引物对4个鸡种基因组DNA池扩增筛选,40个引物产生多态性。此40个引物经重新优化反应体系后,对120个个体的基因组DNA 进行RAPD分析。40个引物共产生387种扩增片段,扩增产物片段的长度大小在100～2220 bp范围内。利用电泳分析数据分别计算4个品系群体之间的遗传相似系数和遗传距离指数,结果4个鸡种的亲缘关系与它们的引种情况基本一致。同时也证明了RAPD技术可以作为分子标记,很好地检测鸡种群内的遗传变异及区分不同鸡品系。 相似文献
11.
Rincón G D'Angelo M Gagliardi R Kelly L Llambí S Postiglioni A 《Research in veterinary science》2000,69(2):171-174
Uruguayan Creole cattle inhabit areas that cannot sustain conventional farming. They have adapted to fragile environments and are influenced only by natural selection. In this study, random amplified polymorphic DNA (RAPD) and microsatellite (MS) markers were used to analyse Creole cattle genome polymorphism. A comparative analysis using the RAPD technique was performed in pooled DNA of three cattle breeds (Holstein Friesian, Creole and Hereford) in order to evaluate their amplification patterns. A primary screening of RAPD primers allowed us to select and use those with higher percentage of GC base composition. A total of 215 loci ranging between 300 and 2500 bp were amplified. Bandsharing frequency (BSF) among breeds showed that less related fingerprints were observed between Creole and Hereford cattle (0.77), while the highest similarity frequency corresponded to Holstein Friesian compared to Hereford (0.81). Specific RAPD bands were identified in the three DNA pools and they were tested in every individual of each breed. It may be possible to isolate and sequence these bands to create breed-specific molecular markers. The identification of multiple alleles of the MSCYP 21 in Creole cattle with an heterozygosity of He = 0.846 supported the variability of this genetic resource. The use of molecular markers such as RAPD s and microsatellites is proposed to establish genetic distance among American Creole cattle and possibly related ancestral Iberian breeds. 相似文献
12.
13.
14.
玉蜀黍属物种间遗传关系的RAPD分析 总被引：4，自引：0，他引：4
用136个RAPD引物对玉蜀黍属大刍草和玉米种质基因组DNA的多态性进行检测,共得到5 303条条带,其中多态性带4 500条。遗传相似系数分析结果表明,玉米与大刍草种质遗传相似性系数变幅为0.585～0.809,相同种遗传相似性系数为0.767～0.809,而种间或亚种间的相似性系数为0.585～0.745,表明利用RAPD技术能准确地揭示出玉米与大刍草种间的遗传关系。聚类结果表明,玉蜀黍属内所有大刍草和玉米可分类为繁茂亚属和玉蜀黍亚属,繁茂亚属包括四倍体多年生类玉米种、二倍体多年生类玉米种、繁茂类玉米种和尼加拉瓜类玉米种;玉蜀黍亚属包括小颖类玉米亚种、墨西哥类玉米亚种、委委特南戈类玉米亚种和玉米。运用RAPD技术证实在玉蜀黍属中尼加拉瓜类玉米种与繁茂类玉米种亲缘关系最近。 相似文献
15.
用RAPD标记分析草地早熟禾遗传多样性 总被引：13，自引：5，他引：8
采用RAPD分子标记技术对从美国引进的12份草地早熟禾(Poapra tensis L.)品种的遗传多样性进行分析。结果表明,从60个随机引物中筛选的17个有效引物共扩增出104条带,其中多态性带65条,占总带数的62.5%,平均每个引物扩增出多态性带3.82条;利用NTSY S-PC软件计算品种间Jaccard遗传相似系数(GS),变化范围为0.362~0.971;用非加权组法(UPGMA)聚类分析,建立供试品种的分子系统树状图,以相似系数0.7为标准分为5类,其中新哥来德(NuGlade)、解放者(Liberator)、浪潮(Impact)、午夜(Midnight)、自由Ⅱ(Freedom Ⅱ)、超级伊克利(Total eclipse)和纳苏(Nassau)共7个品种聚为一类,兰神(Nublue)和美洲王(America)聚为一类,其余品种各自为一类;该结果对引进草地早熟禾品种资源评价与利用具有一定的参考价值。 相似文献
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12个无芒雀麦种群遗传多样性的RAPD分析 总被引：1，自引：0，他引：1
用RAPD分子标记对12个无芒雀麦种群进行遗传多样性分析,结果表明:选用的9条多态性引物共扩增出87个条带,平均每个引物扩增9.67条,其中多态性条带45个,多态性条带百分率为51.72%.无芒雀麦物种水平上的多态性条带数为76个,多态性条带百分率为87.36%,Shannon信息指数为0.2933,Nei s基因多样性指数为0.1843.种群间遗传分化系数为0.2735,说明无芒雀麦的遗传分化主要发生在种群内.聚类结果显示,部分种群间的遗传距离与地理距离有一定的相关性,但也有例外,这可能与人类的广泛栽培加大了种群间的基因交流有关. 相似文献
17.
西藏牦牛的RAPD遗传多样性及其分类研究 总被引：1，自引：1，他引：0
为了解西藏地区牦牛品种或类群的遗传多样性和亲缘关系,本研究从33个RAPD多态性引物中筛选出8个条带清晰且多态性丰富的引物对西藏地区的巴青牦牛、类乌齐牦牛、丁青牦牛、桑日牦牛、工布江达牦牛、江达牦牛、康布牦牛、桑桑牦牛、嘉黎牦牛、帕里牦牛、斯布牦牛等11个类群的核基因组DNA进行了RAPD分析,并用Nei氏标准距离和UPGMA聚类法分析了类群间的亲缘关系.结果表明:(1)西藏牦牛类群的遗传多样性指数变异范围在0,185 7～0.405 3之间,其中帕里牦牛最小(0.185 7),说明相对较纯,群体较整齐;而工布江达牦牛最大(0.405 3),显示该群体内部具有较多的遗传变异.(2)在11个类群中,其遗传多样性指数大小分别为:工布江达牦牛(0.405 3)＞江达牦牛(0.353 6)＞斯布牦牛(0.344 8)＞康布牦牛(0.342 8)＞嘉黎牦牛(0.332 3)＞桑日牦牛(0.282 3)＞巴青牦牛(0.279 3)＞桑桑牦牛(0.269 8)＞丁青牦牛(0.259 7)＞类乌齐牦牛(0.224 1)＞帕里牦牛(0.185 7),具有西藏东部牦牛类群遗传多样性相对较高,而西部牦牛类群遗传多样性相对较低的趋势,预示着西藏东部可能是牦牛的起源地之一.(3)遗传距离构建的分子聚类关系图表明:西藏11个牦牛类群可分为2大类,帕里牦牛(PL)为一类,其余10个牦牛类群为另一类.综上所述,西藏牦牛具有较丰富的遗传多样性,品种或种群内的遗传分化显著,这是西藏牦牛业持续发展和牦牛适应外界环境的遗传基础,是将来培养牦牛新品种或品系的重要基因资源;西藏牦牛品种可分为2大类群. 相似文献
18.
为了解山羊致病性大肠杆菌广西分离株的分子多态性,应用随机扩增多态性方法(RAPD)对山羊致病性大肠杆菌进行分型研究.从8条随机引物中筛选出4条能在10株大肠杆菌中具有较好多态性扩增的随机引物,4条随机引物共扩增出18条DNA片段,10个菌株无共有带谱,显示出良好的扩增多态性.菌株Nx31与Nx32曾被认为是同一菌株的两次分离,但是在RAPD分析中,两株细菌的带谱存在明显的差别,表明RAPD比传统的血清学分型具有更高的分辨性. 相似文献
19.
血清1、2、4、5型鸭疫里默氏杆菌的RAPD 总被引：2，自引：0，他引：2
以37℃摇震培养舜口烛缸厌氧培养，从12种培养基中选择出鸭疫里默氏杆茼的最优培养基和培养条件。以血清1、2、4、5型的鸭疫里默氏杆菌代表株A1、A2、A3、A4为研究对象，培养增殖后分别提取基因组DNA，利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术，对其基因组进行了DNA分析。从20条随机引物中筛选出8条随机引物，这8条引物对4种血清型的鸭疫里默氏杆菌的扩增图谱有较好的多态性，可作为分子标记鉴别4种不同血清型的鸭疫里默氏杆菌，同时还筛选出能在4个血清型的鸭疫里默氏杆菌代表株均出现相同的特征条带，而对照茼大肠杆菌、沙门氏茼无该条带的随机引物，从而为鸭疫里默氏杆菌病的分子诊断打下了一定基础。 相似文献
20.
本研究利用序列特异性扩增(SCAR)技术对健康和食毛水貂进行遗传分析,旨在从分子水平探讨水貂食毛症的发病原因.首先从126个随机引物中筛选出4个重复性好的标记引物,通过引物A20和S139的扩增在两群体中找到差异标记(A20-1000,S139-400),对其进行克隆、测序,并根据测序结果设计2对SCAR引物,回到原样本群体中扩增验证.结果,SA20-757在食毛和健康水貂群体的分布频率分别为86.88％和27.41％,差异极显著(P＜0.001);MS139-230在食毛和健康水貂群体的分布频率分别为94.21％和39.38％,差异极显著(P＜0.001).SA20-757与MS139-230联合分析表明,特异性条带在患病水貂群体的分布频率高达95.36％,均比单个SCAR特异引物的扩增比例要高.结果提示,SA20-757与MS139-230联合诊断分析,可以很好的区分健康与食毛水貂群体,可初步作为水貂食毛症早期诊断的分子生物学手段,为进一步研究水貂食毛症奠定基础. 相似文献