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1.
为了解山东地区水貂犬瘟热病毒(CDV)遗传变异特征,采集水貂养殖场的发病水貂病料,通过RT-PCR鉴定为CDV阳性,将阳性病料接种Vero/Dog SLAM细胞进行病毒分离,通过间接免疫荧光、电镜负染、测序等方法鉴定,得到4株犬瘟热病毒,分别命名为WD1株、WD2株、WX1株和WX2株。分离株H基因测序结果显示,WD1株、WD2株、WX1株均为Asia-Ⅰ型,其中WD1和WD2与近几年仅在水貂和狐狸养殖场流行的新犬瘟热毒株核苷酸和氨基酸序列同源性分别为97.5%~99.2%和97%~99%;WX-1型与国内犬源HL001株的同源性最高,核苷酸和氨基酸序列同源性分别为99.6%和99.5%;WX2与疫苗株同属于一个分支,与疫苗毒Lederle株核苷酸和氨基酸序列同源性高达99.5%和98.8%。结果表明,水貂养殖场存在多株犬瘟热病毒混合感染的情况,提醒养殖场应注意防控,该结果也为犬瘟热病毒分子流行病学积累了资料。 相似文献
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《中国兽医杂志》2016,(12)
应用RT-PCR的方法从2013-2015年来自我国部分地区20份犬、貂、狐和貉源犬瘟热阳性病料中克隆得到犬瘟热病毒(CDV)H基因。序列分析结果表明,20株CDV的H基因核苷酸与推导氨基酸序列的同源性分别为:90.6%~100%和90.5%~100%;相应地,与CDV3、Onderstepoort等传统疫苗株相比,其同源性分为90.4%~99.9%和89.0%~99.8%。基于CDV H基因推导氨基酸序列构建系统进化树的结果显示,除TS1510属于Amecica-1型外,其余全部为Asia-1型。表明Asia-1型犬瘟热病毒仍为目前一些地区流行基因型,弱毒感染动物也可使之产生典型犬瘟热症状。 相似文献
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对2017年山东省威海市和青岛市16份表现为间质性肺炎、出血性肺炎、肝脏黄疸及肾脏肿大等症状的病死水貂、狐狸、貉子病料,进行犬瘟热病毒(CDV)检测及混合感染细菌的分离鉴定,对分离菌进行小白鼠致病性试验,对CDV阳性样品进行H基因测序及序列分析。检测结果显示,CDV与细菌的混合感染率达68.75%;细菌分离鉴定结果显示,绿脓杆菌和致病性大肠杆菌是毛皮动物的主要致病菌;CDV序列分析显示,H基因编码区的核苷酸同源性在99.0%～100%之间,与传统疫苗株的同源性在90.1%～91.1%之间;基于H基因构建的系统进化发生树显示,9株CDV属于野毒株谱系,在基因型上与国内绝大多数分离株同属于Asia-1型,2株属于疫苗株谱系,属于America-1(Vaccine)基因型。检测结果表明,CDV与细菌的混合感染在这些地区的毛皮动物中较为普遍,是造成毛皮动物大规模死亡的重要原因,这为规模化毛皮动物养殖场有效控制疫病提供了依据。 相似文献
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《中国兽医学报》2020,(3)
通过比对GenBank中已发表的21株犬瘟热病毒全基因组序列,利用Primer Premier5.0设计了首尾重叠的11对特异性引物,对1株适应Vero-dSlam细胞的犬瘟热病毒强毒HBF-1的全基因组进行RT-PCR扩增。将扩增获得的11个特异性目的片段分别连接到pEASY-Blunt载体,筛选出阳性克隆子。经过反复测序后,对11个片段的序列进行拼接最终获得了HBF-1株全基因组序列。利用DNAstar和MEGA6.0软件,分析HBF-1株与其他已公布CDV序列遗传进化关系。结果显示,适应Vero-dSlam细胞的犬瘟热病毒强毒HBF-1基因组全长为15 690 bp,与最初分离株Hebei株的同源性高达为99.8%,与国内黑龙江分离株HLJ-06的亲缘关系较近,同源性为98.5%,同经典疫苗株的亲缘关系相对较远,同源率为92.7%。HBF-1是分离株Hebei的Vero-dSlam细胞适应株,对二者基因编码区的序列比对,共出现13处氨基酸突变。其中,P蛋白突变率为0.39%,H蛋白突变率为0.33%,是2个变异率最高的结构蛋白。这些变异很有可能是病毒在适应Vero-dSlam细胞过程中形成的,但它们对HBF-1的致病性和毒力强弱是否存在影响,后续我们将深入研究。因此,开展细胞适应株HBF-1的全基因组序列测定及序列分析,对未来研究强毒株与Slam受体互作关系,及强毒株的致弱机制提供基础。 相似文献
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小熊猫等四种动物犬瘟热病毒的分离与鉴定 总被引：8，自引：0，他引：8
对犬,貂,貉,狐,熊,小熊猫,大熊猫,狼,狮,虎,金猫和猞狮共６５只动物的病料进行了犬瘟热病毒分离,结果从小熊猫,犬膜梭菌抗毒素对小熊猫,犬,貉和狐四种动物的病料中分离出９株ＣＤＶ,其中小熊猫ＣＤＶ具有较强诱导产生中和抗体的能力。该毒株有可能成为疫苗后备株。 相似文献
8.
《中国兽医学报》2019,(9):1710-1714
分析比对了GenBank中已公布的23株犬瘟热病毒全基因组序列,针对保守区设计了11对特异性通用引物,用于扩增犬瘟热病毒野毒株和疫苗株全基因组。通过优化11对引物的工作浓度及退火温度等条件,对保存的3株疫苗毒CDV3株、OR12株、CDV/R-20/8株和2株野毒HBF-1株和SD(14)07株进行了全基因组扩增。取5μL扩增产物进行1%琼脂糖凝胶电泳,结果显示11对通用引物对以上5株犬瘟热病毒扩增后,均获得11个特异性目的片段,条带大小与预期相符。选取疫苗毒OR12株和野毒HBF-1株的进行全基因组序列测定,与GenBank中已公布的序列进行比对,同源性均大于99.0%,证实这11对特异性通用引物能够实现对犬瘟热病毒野毒和弱毒全基因组的准确扩增,并获得准确的全基因组序列。 相似文献
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犬瘟热病毒上海分离株M蛋白编码基因的克隆与序列分析 总被引：1，自引：1，他引：0
本研究以犬瘟热病毒(canine distemper virus,CDV)上海分离株的总RNA为模板,根据GenBank中已报道的CDV M蛋白基因序列,设计合成1对特异性引物,RT PCR扩增M蛋白基因,并进行克隆与序列分析。结果显示,CDV上海分离株M蛋白基因序列与CDV A75/17 株、Onderstepoort疫苗株等其它7株的同源性在95%以上;编码氨基酸的同源性也高于97%。推测M蛋白是一个保守性非常强的结构蛋白。 相似文献
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Martella V Cirone F Elia G Lorusso E Decaro N Campolo M Desario C Lucente MS Bellacicco AL Blixenkrone-Møller M Carmichael LE Buonavoglia C 《Veterinary microbiology》2006,116(4):301-309
Canine distemper virus (CDV) is a highly contagious viral pathogen causing lethal disease in dogs and other mammalians. A high degree of genetic variation is found between recent CDV strains and the old CDV isolates used in the vaccines and such genetic variation is regarded as a possible cause of the increasing number of CDV-related diseases in dogs. The H gene shows the greatest extent of genetic variation that allows for distinction of various lineages, according to a geographical pattern of distribution and irrespective of the species of identification. In the present study, hemagglutinin (H) genes obtained from field strains detected from clinical specimens of Italian dogs were analyzed genetically. Phylogenetic analysis revealed that a homogeneous group of CDV strains is widespread in Italian dogs, all which are included into the European lineage. Unexpectedly, strains 179/04 and 48/05 clustered along with CDVs of the Arctic lineage, the highest identity being to strain GR88 (98.0 and 98.4%aa, respectively). The full-length sequence of a red fox CDV strain, 207/00 was also determined and analyzed. The H protein of the fox CDV strain was unrelated to strains within the major European lineage. These results suggest that at least three different CDV lineages are present in Italy. 相似文献
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以临床疑似犬瘟热病犬外周血总RNA为模板,采用RT-PCR方法扩增犬瘟热病毒(CDV)血凝素(H)基因。序列测定和分析表明该病料犬瘟热病毒H基因序列与国内其他地区分离到的毒株同源性较高(94.6%~99.2%),而与Onderstepoort株、Convac株等疫苗毒株的同源性较低(90.4%~91.2%)。分子遗传进化分析显示所有毒株可分为7个大的分支,且各分支间具有一定的地域性,其中待检病料中CDV与大多数中国分离株一样处于Ⅰ型。进一步以H全基因为模板,截短表达其3′端816 bp、459 bp两个片段,并克隆入原核表达载体pET30 a进行表达。结果显示它们分别能表达大小约为36.4 ku和22.2 ku的融合蛋白。免疫转印表明该纯化蛋白均可与犬瘟热病毒抗血清发生阳性反应,说明重组蛋白具备抗原性,可用于进一步的血清学研究。 相似文献
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本试验采用Vero细胞从临床疑似患犬瘟热的犬组织病料中分离出一株病毒,通过观察细胞病变,提取细胞培养物RNA并扩增克隆分析N蛋白基因部分序列进行了鉴定。结果表明,该毒株接种于Vero细胞后,出现了典型的细胞病变;对接种病料后的Vero细胞培养物提取总RNA进行RT-PCR扩增,得到了287 bp的目的片段;序列分析表明该分离株与犬瘟热病毒弱毒(Onderstepoort和Snyder Hill)的同源性为95.5%~96.9%,与标准强毒株(A75/17和2544/Han95)及野毒株(XJ-4、ZJ7、98-2646等)的同源性较高,为97.2%~99.0%,证明该毒株为犬瘟热病毒野毒株,命名为QD10。 相似文献
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为了对1例貉源犬瘟热(CD)进行病毒检测并分析其血凝素H基因变异情况,本研究从1只疑似犬瘟热病死的貉采病料进行研磨,利用RT-PCR方法扩增犬瘟热病毒H基因,对扩增出的H基因片段进行克隆测序,并对得到的H基因序列进行分析。结果表明,该貉感染犬瘟热病毒,得到的H基因核苷酸和氨基酸序列与CDV野毒株同源性较高,分别为89.1%~98.0%和85.4%~97.5%。遗传进化分析表明其属于Asia-1型野毒株,N连接糖基化位点分析结果表明,该毒株在542aa处比参考野毒株多了1个潜在的N糖基化位点,在525aa-550aa间多出了1个抗原表位。 相似文献
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应用MDCK细胞从吉林某地犬瘟热(Canine distemper,CD)疑似发病犬肺脏组织中分离出1株病毒,该分离毒株经MDCK细胞传至第6代时出现典型的合胞体细胞病变(CPE)。经病毒形态观察、理化特性鉴定、RT-PCR和直接免疫荧光鉴定可知该分离毒株为犬瘟热病毒(CDV),命名为CDV-JT1;动物试验表明,试验犬接种CDV-JT1后21 d内都出现典型的犬瘟热症状;H基因序列分析表明,CDV-JT1株的H基因与中国分离株CDTaiChung株、TN株、SHLJ(07)1株、日本Hamamatsu株、Ueno株、Yanaka株和KDK-1株在基因型上同属于Asia-1型。CDV-JT1株含有包括CDV野毒株特有的309~311位在内的8个潜在的N-连接天冬酰氨糖基化位点。CDV-JT1强毒株的分离成功,对进一步开展疫苗研发、流行病学调查以及致病机理等方面的研究具有重要意义。 相似文献
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Using the complete haemagglutinin (HA) gene and partial phosphoprotein (P) gene we investigated the genotype of canine distemper virus (CDV) strains recovered from two wildlife species in Mecklenburg-Vorpommern, Germany. Phylogenetic analyses demonstrated significant differences between the strains from raccoons Procyon lotor (family Procyonidae) obtained in 2007 and strains from red foxes Vulpes vulpes (family Canidae) obtained in 2008. The raccoon strains belonged to the CDV European wildlife lineage whereas the red fox strains belonged to the CDV Europe lineage. We combined our genetic sequence data with published data from 138 CDV stains worldwide to investigate the proposed importance of amino acid substitutions in the SLAM binding region of the CDV HA protein at position 530 (G/E to R/D/N) and 549 (Y to H) to the spread of domestic dog-adapted CDV strains to other carnivores. We found no evidence that amino acid 530 was strongly affected by host species. Rather, site 530 was conserved within CDV lineages, regardless of host species. Contrary to expectation, strains from non-dog hosts did not exhibit a bias towards the predicted substitution Y549H. Wild canid hosts were more frequently infected by strains with 549Y, a pattern similar to domestic dogs. Non-canid strains showed no significant bias towards either H or Y at site 549, although there was a trend towards 549H. Significant differences between the prevalence of 549Y and 549H in wild canid strains and non-canid strains suggests a degree of virus adaptation to these categories of host. 相似文献
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