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旨在了解四川省集约化猪场腹泻仔猪粪便中病毒种群的变化。于2019年从四川省15个猪场采集腹泻仔猪粪便样本共156份，每个猪场挑取3份样本混合成1个pool样，提取其总RNA并进行高通量测序，利用SOAP denovo软件进行序列组装，并对病毒的种类和分子特征进行研究。分析结果显示，腹泻仔猪粪便样本中的病毒种群包括12个科的20种病毒，以冠状病毒科(Coronaviridae)成员为主，与腹泻相关的主要病原有猪流行性腹泻病毒(porcine pidemic diarrhea virus, PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(porcine infectious gastroenteritis virus, TGEV)和猪轮状病毒(porcine rotavirus, PoRV)。获得PEDV N基因的完整基因组和TGEV、猪星状病毒2型(porcine astrovirus, PAstV-2)、posavirus 1和猪细小病毒4型(porcine parvovirus, PPV-4)的部分基因组。系统发育结果显示，PEDV、TGEV、PAstV-2、posavirus 1和PPV-4均与参... 相似文献
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曲靖地区仔猪腹泻细菌性病原的分离鉴定与耐药性分析 总被引：4，自引：2，他引：2
为了解曲靖地区仔猪出现腹泻的细菌性病因,对5个养殖场148份出现仔猪腹泻症状的样品进行细菌分离培养及耐药性分析,结果显示,检出致病性大肠杆菌(E.coli)114份,阳性率为77.03%;沙门氏菌(Salmonella)26份,阳性率为17.57%,混合感染率为17.57%.致病性大肠杆菌和沙门氏菌对多种抗生素产生了耐药性,其中114株致病性大肠杆菌中97株呈多重耐药性,占总菌数的85.09%,26株沙门氏菌中20株呈多重耐药性,占总菌数的76.92%.结果表明,致病性大肠杆菌是导致当地哺乳仔猪腹泻的主要细菌性病原,部分仔猪继发感染沙门氏菌,两种细菌对多种抗生素产生了耐药性,多重耐药现象较严重. 相似文献
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《上海畜牧兽医通讯》2016,(2)
为了了解云南省蒙自市仔猪腹泻的细菌性病因,笔者对来自5个养殖场和12户散养户的111份出现腹泻症状的仔猪粪便样品进行了细菌分离培养、生化鉴定及耐药分析。结果显示,此次试验共检出86份致病性大肠杆菌,阳性率为77.47%;沙门氏菌6份,阳性率5.41%;混合感染率5.41%。检出的致病性大肠杆菌和沙门氏菌对多种抗生素均表现出耐药性。试验结果表明,当地哺乳仔猪腹泻的主要细菌性病原为大肠杆菌,部分猪场和散养户还存在沙门氏菌的混合感染;两种细菌对抗生素均产生了耐药性。本次检测从细菌性病原的角度对仔猪腹泻综合征的病因进行了初步的分析,为哺乳仔猪腹泻病的细菌性病因的控制和预防提供更合理、更切合实际情况的依据。 相似文献
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猪流行性腹泻是由猪流行性腹泻病毒引起的以水样腹泻、呕吐、脱水和对哺乳仔猪高致死率为主要特征的一种高度接触性肠道传染病。不同年龄、品种和性别的猪都能感染发病,哺乳仔猪、断乳仔猪和育肥猪的发病率通常为100%,母猪发病率为15%~20%,对哺乳仔猪侵害最严重。猪大肠杆菌病是由致病性大肠杆菌引起的主要危害幼畜的一种传染病,常以初生仔猪剧烈水样腹泻和迅速脱水死亡,7-300龄仔猪排黄白色粥样粪便、断奶仔猪水肿病体现。 相似文献
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《中国兽医学报》2020,(1):1-8
为了解河南省引起仔猪腹泻的猪肠道冠状病毒的感染和流行情况,我们对2017年度发生仔猪腹泻的河南省25家养殖场送检的94份仔猪肠道或粪便样品开展了相关检测。结果显示猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhoea virus,PEDV)的样品检出率为68.1%(64/94),猪场阳性率为76.0%(19/25),但未检测到猪传染性胃肠炎病毒(porcine transmissible gastroenteritis virus,TGEV)、猪德尔塔冠状病毒(porcine deltacoronavirus,PDcoV)和猪急性腹泻综合征冠状病毒(swine acute diarrhoea syndrome coronavirus,SADS-CoV)。为进一步分析PEDV的遗传变异情况,利用RT-PCR和基因克隆测序技术,我们成功获得了8株PEDV的S1基因片段的核苷酸序列。分子进化树分析显示,我国流行毒株可以分为G1a(疫苗及其衍生株)、G1b(经典毒株)、G2a(2011-2013年变异株)、G2b(2016-2017年变异株)和G2c(重组毒株)5个进化分支,本研究获得的S1基因序列均处于G2b进化分支,且与2016-2017年间的流行毒株遗传距离更近。同源性分析显示,8株分离株彼此之间S1基因片段的核苷酸同源性为97.3%～99.5%,与变异毒株AJ1102的同源性为97.2%～98.0%,而与经典毒株CV777、CH/S的同源性仅为91.0%～92.3%。氨基酸序列比对分析显示,与CV777和CH/S等经典毒株相比,分离株S1基因片段除了多个氨基酸位点发生变异外,在~(58)NQGV~(61)、~(140)N、~(157)H这3个位置有氨基酸的插入,在~(163)NI~(164 )有2个氨基酸的缺失,这与之前关于PEDV变异株的研究报道相一致。此外,与其他变异株相比,本研究发现分离株HeNPDS/2017在491位有1个新的丝氨酸(Ser)缺失位点,其生物学意义有待进一步研究。本研究丰富了PEDV的分子流行病学数据,有助于了解河南省PEDV流行和遗传变异的最新情况,为该地区猪流行性腹泻病的防控提供一定的参考。 相似文献
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为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3及M基因的遗传变异情况,试验于2014年4月－2015年3月从贵州省5个地区采集105份腹泻仔猪的粪便,应用RT-PCR方法进行PEDV检测,从中选择8份PEDV阳性样本,扩增其ORF3及M基因,测序并进行序列比对分析.结果显示,从采集的105份粪便样本中可检出75份PEDV阳性样本,阳性率为71.43%;8株PEDV贵州株ORF3及M基因序列均无碱基缺失或插入;ORF3基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在95.1%~100.0%与95.1%~99.6%之间,M基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在98.4%~100.0%与98.7%~100.0%之间;氨基酸系统进化树分析结果显示,2014~2015年贵州流行株与近年来中国毒株、韩国毒株及泰国毒株亲缘关系较近,与疫苗株Attenuated DR13及CV777株亲缘关系较远.提示目前贵州省仔猪腹泻病原主要是PEDV,且为PEDV强毒株. 相似文献
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为了调查某规模化奶牛场犊牛腹泻的发病原因,试验采用血清抗体检测、细菌分离培养、寄生虫卵镜检和病毒核酸检测方法对腹泻犊牛的血样和粪便进行了检查。结果表明,该奶牛场牛病毒性腹泻/黏膜病病毒抗体阳性率为65.00%,牛轮状病毒抗体阳性率25.00%,牛冠状病毒抗体阳性率15.00%;分离到1 株结肠弯曲杆菌和1 株空肠弯曲杆菌;所检腹泻犊牛粪便和血液样品中,4 份粪便样品和1 份血液样品检出牛冠状病毒,2 份粪便样品检出轮状病毒,1 份粪便样品和1 份血液样品检出牛病毒性腹泻/黏膜病病毒,同一份粪便样品中同时检出牛病毒性腹泻/黏膜病病毒和牛冠状病毒;通过镜检,球虫卵囊检出率77.78%,在1 份粪样中发现蛔虫卵,2 份粪样中发现其他线虫卵。该牛场流行性腹泻的原因可能为夏季高温潮湿引起犊牛免疫力下降导致的多病原体感染。 相似文献
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ZHENG Long-long ZHU Ling-yun CHEN Guan-xiong LIU Ping-dan TANG Ning ZHAO De-yu LIU Jia YANG Gui-shu BAI Wei-bing 《中国畜牧兽医》2015,42(10):2772-2778
To understand the pathogenic causes of weaning diarrhea in Yunnan province,we collected 210 feces and 60 drinking water,a total of 270 samples in 30 farms with weaning diarrhea and analyzed the virus and pathogenic bacteria.The results of the study showed that drinking water was sever polluted by pathogenic Escherichia coli,40 strains of pathogenic Escherichia coli were detected in drinking water,the positive rate was 66.7%,and 100 strains in feces with positive rate of 47.6%;10 strains of pathogenic Salmonella were detected in drinking water,the positive rate was 16.7%,and 24 strains in feces with positive rate of 11.4%,and were sensitive to imipenem.PCR amplified positive rates of porcine epidemic diarrhea virus (PEDV),porcine circovirous type 2 (PCV2),pseudorabies virus (PRV),classical swine fever virus (CSFV),porcine reproductive and respiratory syndrome virus (PRRSV) and porcine rotavirus (PoRV) in feces were 5.2% to 13.0%,and they were not detected in drinking water.By analyzing the causes of diarrhea in Yunnan province in weaned piglets analysis,understanding the specific causes of diarrhea in weaned piglets,the results provided a more reasonable and more realistic theoretical basis and experimental reference for prevention and control of the disease from the cause. 相似文献
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为研究不同病例发病动物的发病原因,并对不同病例病料分离出的细菌进行16S rDNA同源性分析,本试验对10种不同病例发病动物病料进行细菌分离培养并对分离获得的细菌进行微生物学鉴定,设计1对16S rDNA基因引物,对分离出的10株细菌进行PCR扩增、测序及16S rDNA同源性分析。结果显示,分离获得的10株细菌经微生物学鉴定均为大肠杆菌,10株大肠杆菌中哺乳类动物病例犬乳房炎、犬子宫蓄脓、犬肺炎、犬皮肤化脓疮、奶牛乳房炎、犊牛腹泻6株大肠杆菌之间16S rDNA同源性为100.0%,家禽类动物病例肉鸽腹泻、肉鸡腹泻、野鸡腹泻和白孔雀腹泻4株大肠杆菌之间16S rDNA同源性也为100.0%,10株不同病例动物来源大肠杆菌之间16S rDNA同源性为97.5%~100.0%。本试验探明了10种不同病例发病动物的发病原因均为大肠杆菌感染引起,且10株大肠杆菌16S rDNA之间具有高度同源性。 相似文献
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旨在了解新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的系统进化分群、血清型及耐药性。本研究对154份腹泻仔猪粪便样品进行大肠杆菌的分离鉴定,采用多重PCR方法对分离株进行系统进化分群和O血清型鉴定,通过K-B纸片法对其进行药物敏感性检测并通过PCR方法进行耐药基因检测。结果显示：共分离到154株大肠杆菌,包括ETEC(n=24)、STEC(n=21)、EPEC(n=1)、EPEC/STEC(n=2)、ETEC/STEC(n=1)和ETEC/EPEC(n=1),其他104株。系统进化分群显示,多数菌株属于B1(37%)和A群(31%)。定型菌株44株,分别属于10种血清型,以O154、O12、O8、O141和O175为主要流行血清型。151株(98%)为多重耐药菌,对复方新诺明、四环素、氨苄西林、链霉素和氯霉素的耐药率为81%～100%,对阿莫西林/克拉维酸、头孢噻肟、庆大霉素、头孢曲松、环丙沙星和阿米卡星的耐药率为31%～66%,对左氧氟沙星、多黏菌素B、头孢他啶、头孢吡肟、氨苄西林-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦和亚胺培南的耐药率为1%～19%。耐药基因tetA(88%)、tetG(60%)和cmlA(4... 相似文献
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本研究旨在明确犊牛腹泻源性大肠杆菌的耐药情况、强毒力岛（HPI）标志基因及相关基因的携带情况，以及大肠杆菌分离株与HPI携带的关系。采集犊牛病理性腹泻样本158份，采用麦康凯培养基和伊红美蓝培养基进行筛选，镜检符合大肠杆菌形态的进行VITEK 2 Compact生化鉴定和PCR鉴定，采用K-B纸片法对大肠杆菌分离株进行药敏试验，应用PCR方法进行分离株HPI相关基因携带情况的检测。结果显示，共分离得到75株大肠杆菌，分离株对阿莫西林、哌拉西林、氨苄西林、头孢唑啉、氟苯尼考、恩诺沙星、四环素的耐药率均>90%，对头孢氨苄、头孢拉定、头孢曲松、环丙沙星、诺氟沙星和氧氟沙星的耐药率均≥ 60.00%，对阿米卡星较敏感，耐药率为9.33%；75株大肠杆菌全部耐3种以上药物，多重耐药（≥ 10）的菌株占85.33%，耐药谱集中在耐14~17种药物，5株对19种药物全部耐药。HPI标志基因irp2的阳性率为100%，其他相关基因fyuA、irp3、irp5、irp8和ytbA的检出率在66.00%以上。综上所述，宁夏地区犊牛腹泻源性大肠杆菌耐药普遍，多重耐药现象严重。 相似文献
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D Ciosek M Truszczy&#x;ski M Jagodzi&#x;ski 《Comparative immunology, microbiology and infectious diseases》1983,6(4):313-319
Different vaccines against Escherichia coli diarrhea of piglets were applied parenterally in pregnant sows at an industrial fattening farm. The following vaccines were used: vaccine No. 1 with non-complete Freund's adjuvant. Tween 80 and Arlacel A, comprising O149:K91,K88; O139:K82; O8:K87,K88; O141:K85,K88; and O64:K? E. coli serotypes; vaccine No. 2 with paraffin oil instead of Freund's adjuvant, comprising the same E. coli serotypes as the vaccine No. 1; stable specific vaccine with 10% aluminium hydroxide, based on E. coli serotypes most frequently isolated from piglets which died at the farm (O149:K91,K88; O8:K87,K88; O20:K17; O64:K?); Gletvax K88 (Wellcome) and NOBI-VAC LT-K88 (Intervet International). The number of piglets which died up to the moment of weaning in comparison to the number of born ones was considered as an indicator of acquired protection. It was found that the most effective in conferring protection against E. coli diarrhea were: vaccine No. 1 and NOBI-VAC. The differences in the mortality rate between piglets originating from sows vaccinated with these vaccines and those from unvaccinated ones were statistically significant (P < 0.05). No significant differences were noted between controls and animals vaccinated with the remaining vaccines. 相似文献
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本试验旨在评价穿心莲内酯干混悬剂对大肠杆菌感染致肉鸡腹泻的治疗效果,为其临床应用提供试验依据。选取12日龄健康试验鸡300只,随机分为5个组,每组4个重复,每个重复15只。包括空白对照组、大肠杆菌ETECO101攻毒组、大肠杆菌攻毒加100和200 mg·L-1穿心莲内酯干混悬剂及60 mg·L-1粘菌素组。肉鸡15日龄通过腹腔注射0.2 mL含5×108 cfu·mL-1 ETECO101的生理盐水感染细菌,空白对照组腹腔注射0.2 mL生理盐水。细菌感染前3 d开始通过饮水给药,早、晚各给药1次,每次每个重复700 mL,连续给药至攻菌后第3天停止给药。每组随机选取1个重复,于攻菌后24 h和第5天分别选取6只鸡采血、剖检和取组织样,用于肝组织病理学观察、小肠微结构分析、免疫器官指数测定和血液生化指标分析。每组剩余3个重复（45只）试验至攻菌后第7天,计算存活率、粪便评分、平均日增重（ADG）和平均日采食量（ADFI）,以评价药物的药效。结果显示,相对于ETECO101组,药物含量为100和200 mg·L-1的穿心莲内酯干混悬剂组肉鸡存活率分别提高13.3和17.8个百分点（P<0.05）,减轻大肠杆菌感染导致的腹泻,显著提高肉鸡ADG （P<0.01）和ADFI（P<0.01）;200 mg·L-1穿心莲内酯干混悬剂组显著地增加了攻菌后24 h肉鸡脾脏和法氏囊指数（P<0.01）,降低了攻菌后第5天肉鸡血清中球蛋白（GLB）和白蛋白（ALB）含量（P<0.05）,有效地抑制肉鸡血清中丙二醛（MDA）含量的增加,提高肉鸡血清超氧化物歧化酶（SOD）活力（P<0.01）和谷胱甘肽过氧化物酶（GSH-Px）活力（P<0.01）。同时,200 mg·L-1穿心莲内酯干混悬剂组可显著改善肉鸡空肠绒毛高度（P<0.05）,以及绒毛高度与隐窝深度的比值。综上所述,饮水中添加穿心莲内酯干混悬剂可减少大肠杆菌感染导致的鸡死亡,改善肉鸡生长性能、血清氧化应激状态和空肠肠道形态,提高法氏囊指数,对大肠杆菌感染而导致的肉鸡腹泻具有显著疗效。 相似文献
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为研究云南撒坝猪致病性大肠杆菌高致病性毒力岛（HPI）致猪源巨噬细胞焦亡的分子机制,本试验以云南撒坝猪致病性大肠杆菌HPI阳性株感染猪源巨噬细胞为切入点,从云南楚雄州某规模养殖场采集撒坝猪仔猪黄白痢的粪便,对大肠杆菌进行分离纯化,并通过PCR技术对HPI irp2基因进行检测,分别以HPI阳性株（HPI+）和阴性株（HPI-）感染巨噬细胞,并设立LPS+ATP组和空白对照组,于0.5和6 h收集各组细胞及其上清。应用实时荧光定量PCR法检测不同组Caspase-1、IL-1β和IL-18 mRNA表达水平的变化;应用ELISA检测细胞上清pro-IL-1β、pro-IL-18、IL-1β和IL-18含量的变化。结果显示,试验成功分离得到致病性大肠杆菌,经PCR检测成功获得HPI irp2基因阳性株,经实时荧光定量PCR法检测后发现HPI+组、HPI-组与空白对照组相比,Caspase-1、IL-1β和IL-18 mRNA表达水平均呈上调趋势,且HPI+组高于HPI-组。ELISA检测结果显示,与空白对照组相比,HPI+组和HPI-组pro-IL-1β、pro-IL-18、IL-1β和IL-18的蛋白表达量普遍呈上调趋势,且HPI+组均高于HPI-组。结果表明,云南撒坝猪致病性大肠杆菌HPI可通过上调猪源巨噬细胞中Caspase-1、IL-1β和IL-18 mRNA的表达量促进猪源巨噬细胞炎性因子IL-1β和IL-18的释放,诱发炎症,最终促进猪源巨噬细胞发生细胞焦亡。 相似文献
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Occurrence of fimbriae and enterotoxins in Escherichia coli strains isolated from piglets in Poland.
J Osek M Truszczyński 《Comparative immunology, microbiology and infectious diseases》1992,15(4):285-292
1125 and 1146 E. coli strains isolated from suckling and weaned piglets with diarrhea, respectively, and 724 strains from healthy piglets were tested for the presence of fibriae and production of enterotoxins. The fimbriae were determined by hemagglutination and slide agglutination tests, enterotoxins—by the use of ileal loop test in piglets (LT and STb enterotoxins) and suckling mouse assay (STa enterotoxin). It was found that 72.8 and 53.0% strains, isolated from diseased suckling and weaned piglets, respectively, possessed specific fimbrial hemagglutinins, in most cases with K88 antigen. Additionally, 987P fimbriae were detected in 14.0 and 0.7% strains isolated from piglets with diarrhea. Only 5 strains (0.7%) recovered from healthy piglets had specific fimbriae, usually with undetermined antigenic structure. F1 fimbriae (called common or unspecific) were found in strains isolated both from diseased (15.2 and 16.3% strains, respectively) and healthy piglets (27.1% strains). It was noted that the strains isolated from suckling and weaned piglets with diarrhea in most cases were enterotoxigenic (90.5 and 69.1% strains, respectively) and most frequently produced heat-labile toxin LT alone or with STb. 18.5% of enterotoxigenic strains isolated from healthy piglets produced STa toxin. 相似文献
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六十二株水貂源大肠杆菌分离株耐药表型与耐药基因及克隆菌群分析 总被引：2，自引：2，他引：0
为了调查诸城地区某水貂养殖场粪便源大肠杆菌的表观及其分子特征,采集某个水貂养殖场的水貂粪便进行大肠杆菌分离鉴定,对分离鉴定的大肠杆菌进行血清型鉴定和对14种常见抗菌药物的耐药表型鉴定;使用PCR检测耐药基因以及Ⅰ整合子基因盒的携带情况,利用多位点序列分型（MLST）来分析菌株的克隆关系并构建系统发育树来分析相同克隆群菌株的遗传相似性。结果显示,自82份水貂粪便样品分离到62株大肠杆菌,分离率75.61%;大肠杆菌分离株对AMP和TET的耐药率超过90%,多重耐药菌株（MDR）占比为85.48%。PCR检测到5类耐药基因的存在,qnrS检出率最高,为61.29%（38/62）;aaC2、aaC4、sul1和aac（6'）-Ib-cr耐药基因与菌株产生相应的耐药抗性存在一致性（P<0.01）。分离菌株中Ⅰ类整合子可变区域的优势结构为dfrA27-aadA2-qnrA。鉴定出致病性血清型的存在,且对应菌株都具有多重耐药性,优势血清型为O104：H4。分离株中存在33个STs,ST46为优势STs（16.13%）,具有3个主要克隆群,依次为CC10、CC46和CC176;与致病性相关菌株的STs和人源大肠杆菌具有共同的遗传背景。本研究表明,养殖场的水貂受到致病性和多重耐药性大肠杆菌的污染,相同克隆群菌株的耐药基因分布具有多态性,表观特征差异明显。 相似文献
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旨在了解陕西省部分地区腹泻羊源致病性大肠杆菌(E. coli)耐药性及毒力基因携带情况,本研究从10个养殖场采集54份腹泻羊拭子样品,经分离纯化、生化鉴定及16S rRNA基因序列分析,共分离得到50株E. coli,对分离菌进行药敏试验、耐药基因及毒力基因检测。结果显示,分离菌对氨苄西林、氟苯尼考和磺胺异噁唑耐药率达90%以上,且98%(49/50)为多重耐药菌,对8~11种抗生素耐药的菌株占68%(34/50),仅对美罗培南敏感。所有菌株均携带1~6种不同的耐药基因,其中,Sul1(64%)、TetA(34%)、blaCTX-M(32%)携带率较高,未检测到blaSHV。有5株产ESBLs的E. coli携带mcr-1耐药基因。毒力基因检测结果显示,98%(49/50)的菌株携带毒力基因,其中,etrA检出率最高,为80%(40/50)。综上表明,陕西省羊源E. coli多重耐药情况严峻,β-内酰胺类耐药基因与耐药表型不符,提示可能存在其他耐药机制,同时,分离菌具有复杂的毒力谱。本研究为陕西省羊源致病性E. coli感染的防控提供科学依据。 相似文献