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为了研究钦州市猪链球菌2型(SS2)的毒力因子分布特征,采用多重PCR方法对从我市健康猪扁桃体分离的11株SS2相关毒力基因——荚膜多糖(Cps2J),溶菌酶释放蛋白(Mrp),胞外蛋白因子(EF),溶血素(Sly),进行毒力基因检测。检测结果显示:毒力基因型为Mrp+epf+Sly+共有8株,毒力基因型为Mrp+epf+Sly-共有1株,这两种毒力基因型可归为强毒力基因型,占此次健康猪源毒株的81.8%;另外Mrp-epf-Sly-共有2株,属于弱毒和无毒基因型,占健康猪源毒株的18.2%。通过结果分析,预示我市目前SS2的主要流行菌株是同时具有4种毒力因子的高致病性菌株。 相似文献
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《上海畜牧兽医通讯》2016,(5)
根据链球菌保守基因EF-Tu设计引物,从120份30~60日龄健康仔猪鼻拭子分离到11株链球菌,分离率为9.2%(11/120);从72份发生关节病的病猪关节液,分离到6株链球菌,分离率为8.3%(6/72)。为了解分离的链球菌毒力基因分布情况,根据猪链球菌(streptococcus suis,SS)保守基因(GDH)、猪链球菌2型(Streptococcus suis type 2,SS2)特异性基因(CPS2J)以及猪链球菌主要毒力基因溶菌酶释放蛋白(MRP)、毒力相关基因ORF2、甘油醛-3-磷酸脱氢酶基因(GAPDH),设计并合成5对引物进行毒力基因检测,提取扩增产物测序,并对序列进行比对分析。毒力基因检测结果显示,11株鼻拭子分离株有1株毒力因子分布为CPS2J+,鉴定为SS2,不包含其它毒力基因;猪关节液分离的链球菌,有2株SS2和1株SS,2株SS2的毒力基因分布为GDH+/CPS2J+/MRP+/ORF2+/GAPDH+,属于强毒株,1株SS毒力基因为GDH+。2株SS2毒力基因测序结果显示,CPS2J、MRP基因未见变异,提示其高度保守,ORF2、GDH、GAPDH基因存在碱基点突变,但突变对结构无影响,与参考菌株同源性较高。 相似文献
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为了解辽宁省猪链球菌流行菌株主要血清型毒力因子分布特征及致病性,依据猪链球菌属保守基因及血清型特异性基因,从辽宁地区采集猪链球菌疑似病例肺脏、肝脾、脑、关节液等样品进行猪链球菌及其血清类型鉴定;应用猪链球菌6种主要毒力因子特异性基因扩增检测方法,检测所分离到的不同血清类型猪链球菌的毒力因子分布情况,并应用小鼠攻毒试验和病理学技术对其致病性进行观察研究。结果显示:从辽宁地区采集的72个样品中共分离到23株猪链球菌,主要血清型有1,2,7型,其中SS1型4株,SS2型2株,SS7型5株。其余12株未确定血清型。SS1、SS2、SS7型阳性率分别为17.39%,8.69%,30.43%。毒力因子检测结果显示,上述6种毒力因子检出率分别为100%,66.6%,25%,16.7%,75.0%,58.3%,其中SS2均具备6种毒力因子,SS1、SS7和血清型阴性株猪链球菌均具有部分毒力因子,与SS2的差异毒力因子为epf。SS2可引起小鼠的急性败血症以及脑膜炎,SS1、SS7均可引起小鼠发病,但各器官的损伤则较轻。SS1、SS2、SS7脑内接种均可引起小鼠脑膜炎,炎症反应SS2最重,SS1次之,SS7最轻。 相似文献
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为分析猪链球菌4型(Streptococcus suis type 4,SS4)分离株的病原生物学特性,试验对来自中国不同地区的10株猪链球菌4型进行了多位点序列分型,通过PCR方法对猪链球菌7个保守管家基因aroA、gki、dpr、mutS、recA、thrA、cpn60进行扩增,测序后将结果上传至MLST数据库查找序列型,然后制作聚类分析图来阐明菌株之间的亲缘关系;采用PCR方法对7种主要的毒力基因gdh、mrp、epf、sly、fbps、gapdh与orf2进行鉴定,通过毒力因子谱来分析猪链球菌4型毒力因子的分布;以纯化的10株细菌对BALB/c小鼠进行动物致病性试验,根据小鼠致死数量筛选出最强毒株,并进行新西兰兔致病性试验。结果显示,10株猪链球菌4型经多位点序列分型,6株为ST850型,3株为ST1006型,1株为ST94型;结合菌株分离地区分析发现,广东和江苏地区菌株有较高的同源性,江沪地区菌株出现分化现象,表现为遗传多样性;10株菌株均检测到了gdh、gapdh和orf2毒力基因,7株检测到sly基因,4株检测到fbps基因,根据毒力因子谱发现共有3个毒力基因型,gdh+sly+gapdh+orf2+型有6株,gdh+fbps+gapdh+orf2+型有3株,gdh+sly+fbps+gapdh+orf2+型仅有1株。动物致病性试验表明,10株细菌均能使BALB/c小鼠死亡,其中SH1510的半数致死量低至1×108 CFU,对小鼠的致病性最强,将纯化的SH1510菌液接种新西兰兔,可使新西兰兔出现典型的神经症状并死亡。以上结果为猪链球菌的遗传进化、毒力研究提供了新的数据,丰富了猪链球菌病的研究。 相似文献
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为分析猪链球菌4型(Streptococcus suis type 4,SS4)分离株的病原生物学特性,试验对来自中国不同地区的10株猪链球菌4型进行了多位点序列分型,通过PCR方法对猪链球菌7个保守管家基因aroA、gki、dpr、mutS、recA、thrA、cpn60进行扩增,测序后将结果上传至MLST数据库查找序列型,然后制作聚类分析图来阐明菌株之间的亲缘关系;采用PCR方法对7种主要的毒力基因gdh、mrp、epf、sly、fbps、gapdh与orf2进行鉴定,通过毒力因子谱来分析猪链球菌4型毒力因子的分布;以纯化的10株细菌对BALB/c小鼠进行动物致病性试验,根据小鼠致死数量筛选出最强毒株,并进行新西兰兔致病性试验。结果显示,10株猪链球菌4型经多位点序列分型,6株为ST850型,3株为ST1006型,1株为ST94型;结合菌株分离地区分析发现,广东和江苏地区菌株有较高的同源性,江沪地区菌株出现分化现象,表现为遗传多样性;10株菌株均检测到了gdh、gapdh和orf2毒力基因,7株检测到sly基因,4株检测到fbps基因,根据毒力因子谱发现共有3个毒力基因型,gdh+sly+gapdh+orf2+型有6株,gdh+fbps+gapdh+orf2+型有3株,gdh+sly+fbps+gapdh+orf2+型仅有1株。动物致病性试验表明,10株细菌均能使BALB/c小鼠死亡,其中SH1510的半数致死量低至1×108 CFU,对小鼠的致病性最强,将纯化的SH1510菌液接种新西兰兔,可使新西兰兔出现典型的神经症状并死亡。以上结果为猪链球菌的遗传进化、毒力研究提供了新的数据,丰富了猪链球菌病的研究。 相似文献
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猪链球菌(Streptococcus suis,SS)是一种重要的人畜共患病原菌,在33个血清型中,2型(SS2)毒力最强、分布最广,但其具体的致病机理尚不完全清楚。前期的比较基因组学研究表明,RTX family exoprotein A gene(rfe A)只存在于强毒菌株中,基因生物信息学分析发现rfe A与epf-like位于同一操纵子上,且与传统毒力因子ef邻近,PCR方法检测表明rfe A在猪链球菌2型中分布广泛。为了研究rfe A的致病机制,利用同源重组构建了rfe A的基因缺失株Δrfe A和互补株CΔrfe A,并通过斑马鱼模型对缺失株、互补株和野生株的毒力进行评估,发现缺失株毒力增强,表明rfe A可能是SS2的一个新调控因子,或者可能影响其他调控因子。 相似文献
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抑制性消减杂交技术分析猪链球菌2型毒力相关基因 总被引：3，自引：1，他引：2
以猪链球菌2型四川分离强毒株458#为检测子,国际参考无毒菌株1330#为驱动子,用抑制性消减杂交方法寻找其基因组水平的差异.采用3种不同的限制性内切酶分别酶切458#与1330#基因组获得3套酶切片段,经消减杂交后构建猪链球菌2型强毒株458#特异DNA的差异文库,并对差异序列进行比较分析.结果表明,试验获得了3套差异文库共计42个特异性差异片段,所有差异片段均与已发表的猪链球菌2型05ZYH33株全基因组序列高度同源.构建了具有代表性的猪链球菌2型强毒株与国际无毒参考菌株基因组差异DNA文库,差异片段通过Blast比对,部分差异片段与已知功能基因如转座子,耐药基因、1型限制酶修饰系统、表面蛋白和毒力相关蛋白等有同源性,尚有许多差异片段属于未知功能蛋白或假定蛋白,其中可能包括与猪链球菌2型毒力相关的基因,为进一步分析猪链球菌2型可能的毒力相关基因奠定了基础. 相似文献
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从罹患肺炎型猪链球菌病的仔猪气管中分离出1株猪链球菌强毒株,命名为SS2011GZ,经PCR鉴定为血清1型。斑马鱼攻毒试验测得该菌株的半数致死量(LD50)为4.09×104 CFU/mL,有较强毒力;全基因组测序分析显示,毒力基因型为mrp+gdh+epf+sly+fbps-sao-,存在19个基因岛,24种耐药基因,共线性分析发现该菌株基因有大量重排、倒位、插入、缺失,基因发生树中处于独立的分支。结果表明本研究分离的猪链球菌1型为强毒力株,基因共线性较差,存在大量特殊基因和耐药基因,有重要的公共卫生学意义,需引起足够重视。 相似文献
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猪链球菌2型溶血素基因缺失菌株的构建及生物学特性的研究 总被引：2，自引：1，他引：1
溶血素(SLY)在猪链球菌2型(SS2)侵入和裂解细胞的过程中发挥重要作用,被认为是SS2的一种重要的毒力相关因子。为了探讨SLY在2005年中国四川资阳分离强毒株SS205ZY致病过程中的作用,作者利用同源重组基因敲除法成功构建了SS205ZY的sly基因敲除突变菌株(Δsly)。并比较了菌株的溶血能力以及对小鼠的致病力。结果表明sly基因敲除后可导致猪链球菌裂解红细胞的能力显著下降,对小鼠的致病力也有一定程度的减弱,但仍表现较高的致病力。本研究结果提示SLY是猪链球菌裂解细胞的重要毒力相关因子,但造成SS205ZY的高致病性很显然与多种毒力相关因子的协同作用有关。 相似文献
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Finding cardiovascular disease genes in the dog 总被引：2，自引：0，他引：2
Heidi G. Parker PhD Kathryn M. Meurs DVM PhD Elaine A. Ostrander PhD 《Journal of Veterinary Cardiology》2006,8(2):115-127
Recent advances in canine genomics are changing the landscape of veterinary biology, and by default, veterinary medicine. No longer are clinicians locked into traditional methods of diagnoses and therapy. Rather, major advances in canine genetics and genomics from the past five years are now changing the way the veterinarian of the 21st century practices medicine. First, the availability of a dense genome map gives canine genetics a much-needed foothold in comparative medicine, allowing advances made in human and mouse genetics to be applied to companion animals. Second, the recently released 7.5× whole genome sequence of the dog is facilitating the identification of hereditary disease genes. Finally, development of genetic tools for rapid screening of families and populations at risk for inherited disease means that the cost of identifying and testing for disease loci will significantly decrease in coming years. Out of these advances will come major changes in companion animal diagnostics and therapy. Clinicians will be able to offer their clients genetic testing and counseling for a myriad of disorders. In this review we summarize recent findings in canine genomics and discuss their application to the study of canine cardiac health. 相似文献
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IL-12是一个70 kD的异二聚体细胞因子。由40 kD(P40)和35 kD(P35)两条多肽链组成,编码这两条链的基因位于两条不同的染色体上,各自有不同的调节机制[1]。P35、P40亚单位必须在同一细胞表达才能产生具有生物活性的异二聚体P70单体,P40单体无生物活性[2]。IL-12的主要功能是在一系列病理、生理变化中促进TH1细胞增殖、分化、活化,还可以促进NK细胞增殖、分化。在体内IL-12可以增强机体抵抗细菌和寄生虫感染的能力,促进抗肿瘤免疫,影响抗病毒效应包括HIV;同时,它的过度表达可导致自身免疫性疾病和致死性炎症反应[3]。P40仅限于在一些… 相似文献
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为了了解抗生素耐药基因传播研究的整体状况和前沿动态,以WebofScience核心合集数据库集为基础,对20082017年间全球范围内有关该研究领域的文献报道开展计量学分析,从总体情况、研究力量、研究热点等方面进行系统评价。结果表明,10年间有关该领域的研究报道增加显著,自2008年的341篇增加到2017年的1011篇,增加196%。国内学者发文量自2008年的15篇增加到2017年的210篇,文献增长趋势显著高于国外。通过对作者分析表明,主要研究力量持续增加,主要高产作者(第一作者和通讯作者)后5年比前5年发文量增加。通过对论文关键词计量分析表明,四环素是目前关于抗生素耐药基因传播研究热点抗生素,废水则是热点研究基质。研究较多的耐药菌包括鲍曼不动杆菌、肺炎克雷伯菌、大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、沙门菌、铜绿假单胞菌等,其耐药机制主要涉及β-内酰胺酶、超广谱β-内酰胺酶以及碳青霉烯酶类耐药基因。具体研究内容主要有多重耐药、致病性、流行病学、整合子、共转移、质粒、生物膜、演化、基因水平转移、可移动基因元件等。综合文献计量分析结果,抗生素耐药基因传播仍然是抗生素耐药研究领域的研究热点,在未来的研究发展趋势方面,质粒在抗生素耐药基因传播中所扮演的角色、抗生素耐药性的起源与演化等方向将具有特定的研究价值和发展空间。 相似文献
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C Y Chu M J Pan J T Cheng 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2001,63(11):1165-1170
Duck parvovirus (DPV) and Goose parvovirus (GPV) isolated from infected waterfowls with Derzsy's disease in the year 1999 were identified by polymerase chain reaction and sequencing. The nucleotide sequences of their viral capsid proteins (VPs) show that they share 77% similarity at the DNA, and 84.6% at the protein level. The most variable region between DPV and GPV resides in the N-terminal of VP2 before the initiation codon of VP3 with 35% (19/54) amino acids divergence. Viral capsid protein sequences diverge 4.1 to 4.4% among 1990-99 isolated strains. Variant amino acids cluster in the common regions of VP3 at residues 203-266 and 482-534 which overlaps with the regions proposed to expose on the outer surfaces of parvoviral particles, implying that selective pressure from host immune system might play a part. These data provide useful information for antigenic epitope prediction. This study also reveal the presence of conserved strain-specific residues in VPs and these residues seldom vary among different viral isolates, suggesting that they might be functionally important and worth further investigation. 相似文献
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Luis Varona 《Zeitschrift für Tierzüchtung und Züchtungsbiologie》2010,127(1):16-25
After quantitative trait loci (QTL) detection, one of the main objectives of research is to identify the causal mutation explaining phenotypic differences. Candidate genes are usually selected according to the physiological mechanism of the trait and their location within the same region of the QTL. After detection of any polymorphism at the candidate gene sequence, it is important to determine whether the detected mutation is the one that causes the phenotypic variation. This is not, however, an easy task, because of the linkage disequilibrium between the genes located in the same region. Several methods have been proposed that consider the neutral marker information in validating the involvement of candidate genes. However, some statistical information may be lost because of the presence of both the QTL and candidate gene effects in the model of analysis. Here, the Bayes factor is suggested as an alternative and a procedure for its calculation between candidate gene and QTL models is presented. The procedure is illustrated with a simulation study and with an example consisting of three SNPs detected at the leptin receptor (LEPR) in an experimental intercross between Iberian and Landrace pigs. The results indicate that the Bayes factor procedure is more powerful than the classical approach. 相似文献
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Intense selection for speed, endurance or pulling power in the domestic horse (Equus caballus) has resulted in a number of adaptive changes in the phenotype required for elite athletic performance. To date, studies in humans have revealed a large number of genes involved in elite athletic performance, but studies in horses are rare. The horse genome assembly and bioinformation tools for genome analyses have been used to compare human performance genes with their equine orthologues, both to retrieve pathways for these genes and to investigate their chromosomal distribution. In this review, 28 candidate genes for equine performance are presented that have polymorphisms associated with human elite athletic performance and may have impact on athletic performance in horses. A significant accumulation of candidate genes was found on horse chromosomes 4 and 12. Genes involved in pathways for focal adhesion, regulation of actin cytoskeleton, neuroactive ligand-receptor interaction, and calcium signalling were over-represented. Genome-wide association studies for athletic performance in horses may benefit from the strong conserved synteny of the chromosomal arrangement of genes in humans and horses. 相似文献
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