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1.
根据已发表的牛传染性鼻气管炎病毒( GenBank NC_001847) gD基因序列设计1对特异性引物,采用PCR方法扩增出内蒙古分离株gD基因的cDNA,重组到PMD19 -T载体中,并进行克隆及序列测定.经限制性内切酶谱分析和序列分析,证明所克隆的cDNA为gD基因.该基因片段长1 559bp,包含1个由1 251bp组成的完整开放阅读框(ORF),共编码417个氨基酸.序列比较和系统进化树分析结果显示:内蒙古分离株gD基因与GenBank上已发表的其它分离株相比,核苷酸同源性在99.1％～99.9％之间,其推导的氨基酸同源性在90..6％～99.8％之间,在系统进化树中内蒙分离株与AJ004801株亲缘关系较近,属于同1个分支.生物信息学分析表明,该基因编码的蛋白具有亲水性,有很强的抗原性,有3个潜在糖基化位点,可能存在2个蛋白激酶C磷酸化位点,存在4个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点. 相似文献
2.
应用PCR方法对采集的144份血清样品进行鸽圆环病毒(Pigeon circovirus,PiCV)检测,随机选择6份阳性样品进行Cap基因的扩增、纯化,并克隆至pMD18-T载体.测序结果与已知参考毒株进行序列比对和系统进化分析.结果显示:PiCV阳性检出率为75％(108/144),说明PiCV的感染比较严重.自测的6株Cap基因核苷酸的同源性为74.0％～100.0％,与GenBank上登录的国内外14株的Cap基因的核苷酸同源性为72.1％～100.0％.通过进化树分析6株阳性样品分成两大分支:5株位于一大分支,亲缘关系较近;但HBLF株单独位于另外一大分支,与其它5株亲缘关系远. 相似文献
3.
选取1998～2009年福建省不同地区番鸭中分离到番鸭呼肠孤病毒分离株中具有代表性的10株,用RT-PCR技术扩增其S1和S4基因的功能区片段,进行序列测定.序列分析表明所扩增的S1基因的目的片段为819bp,S4基因目的片段为992 bp.参照国内外已发表的部分毒株S1和S4基因序列,构建番鸭呼肠孤病毒的遗传进化树,分析遗传进化关系.国内各分离株S1基因同源性为92.2％～96.7％,与国外89026株同源性为88.5％～92.8％,与禽呼肠孤病毒S1133株同源性为76％～78％.国内各分离株S4基因同源性为95.2％～99.3％,与国外89026株同源性为92.3％～94.5％,与禽呼肠孤病毒S1133株同源性为21.2％～21.5％.通过遗传进化树可以看到MDRV与同属的ARV序列形成了2个大分支,而MDRV序列分为2个小分支:一支为10株分离株和国内分离株,说明国内分离株没有明显差异;一支为国外分离株89026株,这说明国内分离株与国外毒株存在地域差异. 相似文献
4.
为了解贵州猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)的变异情况,对分离PEDV的M基因进行了克隆测序和生物信息学分析.结果表明:分离的PEDV株(用N-GZ表示)与贵州省动物疫病研究室曾报道的PEDV株(用GZ表示)位于同一进化分支,与疫苗株CV777处于不同进化分支.N-GZ株与GZ株M基因的核苷酸序列相似性为98.5％,表明其亲缘关系较近,与CV777疫苗株的亲缘关系稍远.多重比较发现,N-GZ株与CV777株M蛋白的抗原表位区存在3个氨基酸的差异,与GZ株相比存在2个氨基酸的突变.M基因是PEDV的保守基因,但N-GZ株M基因在抗原表位区存在一定程度突变. 相似文献
5.
根据GenBank公布的猪传染性胃肠炎病毒S基因的序列,设计合成1对特异性引物,通过RT-PCR从用细胞增殖的TGEV病毒液中扩增编码S基因B、C抗原位点的基因片段,然后将获得的片段克隆至pMD18-T载体上,构建重组质粒。通过PCR、酶切和测序鉴定重组质粒,将测序结果与GenBank公布的21个相关序列进行多序列比较并绘制进化树。所克隆的TGEV陕西分离株S基因B、C抗原位点基因片段长度为765 bp,与参考毒株的核苷酸同源性为96.1%~99.9%。进化树分析表明,分离株与中国的H株、HN2002株、TS株,美国的Miller M60株、Miller M6株及英国的FS772株亲缘关系较近,与H株的亲缘关系最近。 相似文献
6.
H1N1亚型猪流感病毒M基因、NS基因克隆与序列分析 总被引：1，自引：0，他引：1
根据GeneBank 中流感病毒 H1N1亚型M基因和NS基因序列,分别设计扩增M基因和NS基因的特异性引物,采用RT-PCR方法扩增猪流感病毒天津株M基因和NS基因,分别将RT-PCR产物克隆至pMD18-T载体,进行序列测定和分析.结果显示M基因全长1027 bp,其核苷酸序列与参考毒株间的同源性在85.8 %～99.7 %,NS基因全长890 bp,与参考毒株之间的核苷酸序列同源性在80.7 %～99.2 %.M和NS基因的系统发育树显示:TJ2、TJ4株与我国香港、上海和广东H1N1亚型猪流感病毒属同一分支,但与上海、广东分离株的亲缘关系更近;与2009年全球流行的人甲型H1N1流感病毒变异株和部分国外猪流感疫苗株的亲缘关系相对较远. 相似文献
7.
[目的]了解引起仔猪腹泻的猪流行性腹泻病毒是否为变异株.[方法]从疑似猪流行性腹泻病毒感染的猪场采集死亡仔猪的肠黏膜及其内容物,将病料常规处理后接种VERO细胞,采用维持培养液加10 μg/mL的胰酶的方法分离培养.用RT-PCR、间接免疫荧光、动物回归实验以及部分序列分析等方法对分离株进行鉴定.[结果]病料在接入细胞第一代即出现病变,细胞肿胀变圆,形成合胞体,逐渐脱落,细胞病变明显.随着病毒传代次数的增加,细胞病变逐渐稳定,进行RT-PCR检测、间接免疫荧光检测以及动物回归实验,最终确定分离株符合PEDV特征,并命名为BJ2015,测定毒株的TCID50为10-6.4/0.1 mL.基因测序结果显示,N基因长1 329 bp,编码442个氨基酸.与参考株N基因核苷酸序列比对及遗传进化分析表明,BJ2015与传统株CV777亲缘关系较远;与流行变异株BJ-2011-1N基因在进化树的同一个分支上,二者的核苷酸和氨基酸同源性分别为99.6％、99.5％,表明BJ2015与BJ-2011-1亲缘关系较近.[结论]结果表明BJ2015为PEDV流行性变异毒株. 相似文献
8.
从患病缢蛏（Sinvnovacula constricta）中分离到一株病原菌,命名为1#菌株。采用传统方法提取菌株DNA,PCR扩增其16SrDNA基因片段、测序,得到该菌基因片段序列长度为1438bp。用MegAlign软件进行比对5种不同种细菌基因序列,构建进化树。16SrDNA产物序列分析结果表明：该菌株的16SrDNA的核苷酸序列与多株假单胞菌（Pseudomonas sp）的同源性为99％,在系统发育树上构成一个分支。在细菌系统发育分类学上,该菌株属于假单胞属,但与已定名的假单胞菌有一定的差异,与几种未定名的假单胞菌的亲缘关系最接近。对其分类地位的最后确定还需进一步的系统发育学分析。 相似文献
9.
传染性支气管炎病毒广西分离株S1基因高变区Ⅰ的序列分析 总被引：3，自引：0，他引：3
对7个传染性支气管炎病毒广西分离株的S1基因高变区Ⅰ(HVRⅠ)进行RT-PCR扩增和序列分析,并用DNA star软件将这7个分离毒株与我国常用疫苗毒株、国际上其他血清型的代表参考毒株分别进行核苷酸和氨基酸系统发生进化关系分析。核苷酸与氨基酸序列分析结果表明:7个广西分离毒株可形成2个分支,第1分支与疫苗株H 120、H 52、M a5和参考株M 41、B eaudette的亲缘关系较近,第2分支则与疫苗株H 120、H 52、M a5的亲缘关系较远,但与欧洲分离株4/91的亲缘关系较近。结果提示广西的流行毒株变异较大,实际免疫中要根据流行毒株的特性来生产和选择合适的疫苗株。 相似文献
10.
对猪伪狂犬病病毒闽A株(Fa株)gB、gC、gD基因进行了克隆和序列测定,结果表明:gB、gC、gD基因序列全长分别为2 745 bp、1464 bp、1 215 bp,编码914、487、404个氨基酸残基组成的多肽。序列分析结果显示:Fa株与其他毒株gB、gC、gD基因核苷酸序列的同源性为94.9%~99.9%,氨基酸序列的同源性为91.4%~99.9%。不同PRV毒株gB、gC、gD基因在核苷酸和氨基酸水平上高度保守。基于gB、gC、gD基因的进化树分析表明,中国分离毒株与韩国分离毒株可归为一个进化分支,而日本分离株与欧美分离株归为另一个分支。在前一个分支里,闽A株与鄂A株的亲缘关系特别近,3个基因的同源率均在99.5%以上。在gB蛋白氨基酸序列全长上中国分离株(Ea株、Fa株)比欧美分离株多了1个氨基酸,氨基酸残基的突变主要集中在第50~100氨基酸。在gC基因序列第186~211 bp,Ea株、Fa株比欧美分离株多插入了21个碱基。在gD蛋白氨基酸序列全长上,Ea株、Fa株比其他分离株多了2~6个氨基酸。在gD基因序列第803~837 bp,Fa株核苷酸AGGCCC串联重复最多,达到7个。 相似文献
11.
周秋霞 《农业图书情报学刊》2007,19(11):163-165,168
运用文献计量学方法，对2006年《西安邮电学院擘报》所载的学术论文、作者及引文情况进行统计分析，从中归纳出该刊一些特点。该刊通信、计算机科学载文较高，这体现了本校科研方向和专业特色。而所载文章作者地区分布很不平衡，主要集中在本省。篇均引文量偏低。 相似文献
12.
王火红 《农业图书情报学刊》2010,22(6):74-78
运用文献计量学方法,对人大《复印报刊资料》G9分册《图书馆学、信息科学、资料工作》2008年所载论文的载文、作者情况进行文献计量分析,揭示该刊载文的特点及规律。 相似文献
13.
逐步回归及通径分析在主成分分析中的应用 总被引：5，自引：0，他引：5
[目的]探讨多指标体系中对测定指标的评价、排序及简约,实现对多指标体系的降维.[方法]举例将逐步回归分析和通径分析引入主成分分析中.[结果]测定指标对主成分逐步回归分析保留了对主成分影响显著的指标,剔除了对主成分作用较小或存在共线性的指标;通径分析揭示了测定指标对主成分的直接影响和间接影响体现了指标间的相互作用.通径分析中测定指标对主成分决定系数的分解结合主成分特征值的百分贡献率可对测定指标进行评价,提取反映总体主要信息,真正实现测定指标的简约.[结论]主成分分析结合逐步回归分析和通径分析可对多指标体系中的指标进行评价,实现测定指标的真正降维. 相似文献
14.
利用CNKI引文数据库,选取新闻学与传播学类19种期刊作为研究对象,采用社会网络分析工具对这些期刊的引文网络进行分析。结果表明：期刊的连续性和稳定性较好;19种期刊可分为3个族类,即出版编辑类、广播电视类和新闻传播类期刊;不同期刊在新闻学与传播学期刊群中占有不同的地位;引文网络图谱的可视化直观地揭示了期刊间的引用关系。 相似文献
15.
近年来,食品和水质安全已成为社会经济生活中最重要的安全问题,同时也是最脆弱的体系。本论文综述了近年来纳米传感器科学在食品和水质安全检测方面的应用情况,分析其在应用中面临的挑战和问题,并对其应用前景作出展望。 相似文献
16.
以8份树莓品种为试验材料,对农艺性状和小区有效产量进行相关性分析、回归分析和通径分析。结果表明,各农艺性状与单株产量的相关程度依次为:平均果重>侧根数>多年基生枝长度>侧根粗>主根粗>结果枝数>多年基生枝粗度>平均每枝结果数>平均单株基生枝数>平均单株产量;多元回归方程为:y=1.29+1.63x3-1.02x4-2.35x6-2.63x7+2.31x8+2.15x10。通径分析表明:侧根数、平均果重和平均单株产量对小区有效产量有直接的正向作用,主根粗、多年基生枝长度和平均单株基生枝数对小区有效产量的直接的负向作用。主根粗、多年基生枝长度和平均单株基生枝数可以通过协调其它性状对小区有效产量发挥作用。 相似文献
17.
杨林娜 《农业图书情报学刊》2007,19(9):141-143
运用文献计量学的方法,对《图书馆学刊》(2006年)载文、作者进行统计分析,从中总结一些规律,为图书馆学情报学学科的研究与发展提供参考依据。 相似文献
18.
《图书与情报》2000-2002年载文、作者及引文统计分析 总被引：4，自引：1，他引：4
殷黎 《农业图书情报学刊》2004,15(7):80-82,88
本文采用文献计量学的方法，对2000—2002年出版的《图书与情报》载文、作者及引文情况进行统计和分析，归纳该刊的载文、作者及引文特点。 相似文献
19.
杨林娜 《农业图书情报学刊》2007,19(5):153-155
以《图书馆工作与研究》（2004-2006年）为研究对象，从载文来源分布、栽文选题分布、引文教量分布、引文类型分布及作者合作情况多方面进行统计和分析，从中总结一些规律，为图书馆学情报学学科发展提供依据。 相似文献
20.
蛙病毒属是一群大型的胞浆型DNA 病毒属虹彩病毒科能导致包括鱼类、两栖类和爬行类等冷血动
物产生严重疾病,蛙病毒分子生物学研究是阐明病毒复制,疾病产生各种相关因子作用机制的基础,微阵列分析技
术,蛋白和DNA 复制抑制下的转录产物分析,质谱蛋白质组学等分子生物学技术已被广泛应用于分析蛙病毒的基
因转录和蛋白表达多种蛙病毒转录组和蛋白质组分析使人们能够了解这一类病毒基因的转录产物转录时相病
毒蛋白表达的整体状态功能结构和可能的调控方式. 相似文献