共查询到20条相似文献，搜索用时 406 毫秒
1.
一株副猪嗜血杆菌的分离鉴定及其遗传进化分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为确认导致甘肃省平凉市一农场猪群死亡的原因,采集病死猪不同组织样品进行检测,从病死猪的脏器组织中分离到1株革兰阴性杆菌,并对其进行生化鉴定、16S rRNA鉴定及遗传进化分析,同时进行分离菌的致病性试验、耐药性分析、V因子需要试验、"卫星现象"观察。结果表明:分离菌生化特性均符合副猪嗜血杆菌;其16S rRNA基因序列与Genbank中副猪嗜血杆菌株的同源性均高达99%。因此,将该分离菌鉴定为副猪嗜血杆菌,将其命名为PL2016。动物试验及耐药性试验表明,该分离菌具有较强的致病性和多重耐药性。16S rRNA遗传进化分析表明,该分离菌与副猪嗜血杆菌其他菌株具有很高的同源性,其核酸序列相似性高达99%以上。遗传进化分析表明,该分离菌的ompP2、sodA基因与副猪嗜血杆菌其他菌株具有很高的同源性,其核酸序列相似性高达95%以上。 相似文献
2.
为了确定某獭兔养殖场獭兔发病的主要病原菌,分析该病原菌的耐药性,本试验对青岛市某獭兔养殖场送检的病死兔进行病理剖检,并从肺脏中分离得到1株细菌,随后进行分离菌形态观察、生化试验、细菌16S rRNA基因测序。该株分离菌为革兰阴性杆菌,博检革兰阴性细菌鉴定系统的生化鉴定结果为铜绿假单胞菌,细菌的16S rRNA基因序列经同源性比较,与铜绿假单胞菌同源性为100%。药敏试验结果表明该株分离菌对多种头孢类、喹诺酮类药物高度敏感。细菌分离鉴定和药敏试验结果为临床用药治疗该病提供参考依据。 相似文献
3.
4.
副猪嗜血杆菌的分离鉴定及16S rRNA序列分析 总被引：1，自引：1，他引：0
从云南某规模化养猪场病猪肺脏分离到1株革兰氏阴性小杆菌,经细菌生化鉴定、PCR鉴定和16S rRNA序列比对鉴定为副猪嗜血杆菌。抗生素药物敏感试验结果表明,分离菌株对四环素、红霉素、氯霉素、头孢噻吩高敏;对庆大霉素、氧氟沙星、诺氟沙星中敏;对磺胺甲唑耐药。16S rRNA分析结果表明,该分离株与GenBank中的Hps参考株AB078973(基因登录号)同源性为100%,将分离菌株鉴定为副猪嗜血杆菌。16S rRNA遗传进化关系表明,分离株与副猪嗜血杆菌3株血清5型参考株AB078972、AB078973、AB078974的16S rRNA序列位于一个分支上,遗传进化关系最近,它们之间的核苷酸同源性在99.0%~99.4%之间,初步鉴定为血清5型副猪嗜血杆菌,致病性试验结果表明,分离菌株对小白鼠有强致病性,命名为YN-1株。 相似文献
5.
副猪嗜血杆菌黑龙江株的分离与鉴定 总被引：1，自引：0，他引：1
为确定黑龙江某猪场发病猪群的病原,本研究从疑似浆膜炎的病料中分离到一株革兰氏阴性细小杆菌,通过对其进行细菌形态学、培养特征、生化特性和16S rRNA基因PCR鉴定,结果表明该分离菌株为副猪嗜血杆菌(HLJ-1分离株)。16S rRNA基因序列分析结果显示:该分离菌株与参考株的基因同源性达99%;药敏试验结果表明HLJ-1分离株对头孢曲松、头孢噻肟等β-内酰胺类抗生素高度敏感;小白鼠致病性试验结果显示,该分离株具有较强致病性。 相似文献
6.
《中国动物传染病学报》2018,(6)
从流产奶牛胎儿组织中分离到1株革兰氏阴性短杆菌,采用细菌分离纯化、生化试验、16S rRNA和16S～23S rRNA测序、药敏试验和小鼠致死性试验对其进行了鉴定。结果显示,该分离菌与GenBank中肺炎克雷伯氏菌16S rRNA和16S～23S rRNA基因序列一致性分别高达99%和96%,16S～23S rRNA基因被扩增出3条不同长度条带;该菌生化特性均符合肺炎克雷伯氏菌的生化反应特性;对头孢曲松、阿米卡星、多粘菌素等敏感,对多西环素、四环素、卡拉霉素等中度敏感,对青霉素、红霉素、米诺环素等耐药;对小鼠有很强的致病性。以上结果表明,该分离细菌为肺炎克雷伯氏菌。 相似文献
7.
本试验在1例患有呼吸系统疾病病牛鼻液中分离出1株革兰阳性杆菌。对其进行分离纯化、16S rRNA的PCR鉴定、动物致病性试验、细菌生化试验、药物敏感性试验、最小抑菌浓度（MIC）试验、系统进化树分析及毒力基因鉴定。结果表明：16S rRNA测序分离菌株基因序列与幼驹肺脏分离所得马红球菌（OM060449.1）基因相似度为98%;对苯唑西林、环丙沙星等具有高度敏感性;毒力基因检测可以检出该分离菌株含有VapA、VapC、VapD、VapE、VapF、VapG及VapH 7种高毒性毒力基因,具有强致病性。由此可见,该分离菌株是导致本次呼吸系统疾病发生的致病菌。 相似文献
8.
9.
为了寻找能够拮抗犬小孢子菌的细菌,本试验从健康犬、猫和貉粪便中筛选了抗犬小孢子菌的芽胞杆菌,经培养、染色特性和16S rDNA序列分析对其中抑菌谱最广的芽胞杆菌进行鉴定,采用平板对峙法测定所筛选芽胞杆菌对犬小孢子菌的抑制效果,用碘化丙啶对芽胞杆菌发酵上清处理的犬小孢子菌菌丝进行染色以初步分析抑菌机理。结果显示,共筛选到12株拮抗犬小孢子菌的芽胞杆菌,其中F-15株对犬小孢子菌的抑制率为64.28%,也可抑制金黄色葡萄球菌和沙门菌;F-15株的16S rDNA序列与HSB1株贝莱斯芽胞杆菌的16S rDNA序列相似度为100%;F-15株发酵上清处理的犬小孢子菌菌丝染色后,在荧光显微镜下可见红色荧光,表明其损伤了犬小孢子菌菌丝的细胞膜。本试验为贝莱斯芽胞杆菌及其代谢产物在防控犬小孢子菌等真菌危害中的应用提供了参考。 相似文献
10.
为鉴定临床疑似鸭多杀性巴氏杆菌感染肉鸭的病原菌，本试验通过细菌分离培养、菌体形态观察、细菌生化鉴定、16S rRNA基因测序分析、细菌种特异性鉴定、荚膜分型鉴定和动物回归试验进行鉴定，并通过药敏试验和耐药基因检测进行耐药性分析。结果显示，从患病鸭肝脏组织分离到的细菌在鲜血琼脂培养基中呈现表面光滑凸起、灰白色菌落，为革兰氏阴性短小杆菌，瑞氏染色呈两极浓染；生化鉴定结果显示，分离菌能发酵葡萄糖、蔗糖和甘露醇，硫化氢、氧化酶和吲哚等试验阳性；16S rRNA基因序列系统进化树分析显示，该分离菌与多杀性巴氏杆菌聚为一支，同源性 > 99%；细菌种特异性鉴定结果与多杀性巴氏杆菌相符；荚膜分型鉴定结果仅扩增到约为1 050 bp的目的基因片段，与荚膜血清A型相符；动物回归试验显示，该分离菌有较强的致病性；药敏试验结果显示，该分离菌对羧苄西林、氨苄西林、复方新诺明和四环素等12种药物耐药；经耐药基因PCR检测显示，该分离菌携带Sul1、Sul3、tet（X）和Intl1 4种耐药基因，与药敏表型相符。本试验成功分离到1株鸭源荚膜血清A型多杀性巴氏杆菌，为鸭多杀性巴氏杆菌病的防治提供参考依据。 相似文献
11.
12.
2010年8月一批进口入境的裸鼠在隔离期间发生了疑似国外文献报道的过度角化性皮炎,为了确诊该病及鉴定该病的病原,本研究从患病裸鼠皮肤组织分离到一株革兰氏阳性杆菌。细菌纯化后经Biolog自动生物鉴定仪系统初步鉴定为牛棒状杆菌(C.bovis);提取细菌基因组,PCR扩增16S rRNA基因,测序结果经比对与GenBank中的C.bovis同源性在99%以上;培养物感染裸鼠没有出现临床症状,但组织学检查显示,感染裸鼠表皮棘皮层增厚,表现出轻微的C.bovis感染特有的棘皮症。由此可以确认这次入境裸鼠暴发的疫病为过度角化症,病原为C.bovis。本研究首次报道了在我国实验动物设施暴发的裸鼠过度角化症,提示裸鼠感染C.bovis导致的过度角化症是实验动物质量监测中不可忽视的传染病。 相似文献
13.
本研究从疑似感染肺炎克雷伯菌(Kpn)的病死水貂病料中分离得到5株革兰氏阴性杆菌,通过对其进行细菌形态学、培养特征、生化特性和分子生物学鉴定,确认分离得到的菌株为Kpn。16S rRNA基因序列分析结果显示:该分离菌株与已知的Kpn相应序列的同源性为100%;药敏试验显示分离株对头孢曲松和舒巴坦高度敏感。动物致病性试验显示该分离株对小鼠具有较强的致病性。 相似文献
14.
Hugh Cai Marie Archambault John F Prescott 《Journal of veterinary diagnostic investigation》2003,15(5):465-469
This study evaluated 16S rRNA gene sequence analysis methods as tools for identification of 22 phenotypically difficult to identify veterinary clinical bacterial isolates in a veterinary diagnostic laboratory. The study compared 16S rRNA gene sequencing and conventional phenotypic identification methods. Using 16S rRNA full-gene sequencing, 95% (21/22) of the isolates were identified to the genus level and 86% (19/22) to the species level. The conventional or commercially available manual identification phenotypic characterization methods presumptively identified 91% (20/22) of the isolates to the genus level and 1 isolate to the species level. However, only 55% (12/22) or 4.5% (1/22) of the phenotypic identifications were correct at the genus or species level when they were compared with the 16S rRNA full-gene sequencing. This study also compared 16S rRNA full-gene and partial-gene sequencing. The results demonstrated that the best 16S rRNA gene-sequencing approach is full-gene sequencing because it gives the most precise species identification. Sequencing of the variable regions 1, 2, and 3 of the 16S rRNA gene could be used for tentative identification because the ability of this sequencing to identify bacteria to the genus level is similar to that of the 16S rRNA full-gene sequencing. This method identified only 14% (3/22) isolates differently to the species level compared with the 16S rRNA full gene sequence. Sequencing of the variable regions 7, 8, and 9 is not recommended because it gives more ambiguous identifications. The cost of a 16S RNA full-gene-sequencing analysis was Can 160 dollars and Can 60 dollars for a partial 16S rRNA gene sequence, i.e., sequencing of variable regions 1, 2, and 3 or variable regions 7, 8 and 9. 相似文献
15.
This study examined the prevalence of Helicobacter infection in the pyloric mucosa of pigs and its histopathological and molecular characteristics. Forty porcine pyloric samples were examined for Helicobacter infection by silver staining and PCR assay. The PCR product (376 bp) was digested with NdeII to differentiate between Helicobacter heilmannii and Helicobacter pylori. Another PCR assay run to produce an 1157 bp fragment was performed using a primer set designed from the 16S rRNA gene of Candidatus H. suis, and its product was cloned and sequenced. Infection rates were 62.5% (25/40) and 95.0% (38/40) as determined by silver staining and the PCR assay, respectively. On histopathological examination, lymphoid follicle aggregation in the pyloric mucosa and granulocytic migration into the lumen of pyloric glands were observed in 24 (60.0%) and 33 (82.5%) gastric samples, respectively. All PCR products, except that of H. pylori, were cut into two fragments of 147 and 229 bp by enzymatic digestion with NdeII. Sequencing of the 16S rRNA gene showed that the bacterium had 99.57% (1152 bp/1157 bp) homology to the 16S rRNA gene of Candidatus H. suis. 相似文献
16.
四川某商品猪场仔猪出现以体温升高,背、腹和腿部皮肤发绀,淋巴结出血肿大,肺、脾脏出血、化脓为主要特征的疾病。通过对分离细菌的纯化培养、形态学观察、生化试验、致病性试验和药物敏感性试验,鉴定出一株致病菌。应用通用引物对其16S rRNA基因进行克隆和序列分析,序列在NCBI上进行BLAST比对,选择同源性较高的棒状杆菌属中25株不同种的菌株16S rRNA序列进行比对分析,构建遗传进化树。分离纯化的细菌在鲜血琼脂平板厌氧条件下生长良好,为革兰氏染色阳性杆状菌,能发酵部分糖类,能致死小白鼠,对头孢类抗生素敏感,16S rRNA序列与棒状杆菌属细菌的同源性最高,在78.2%~98.0%之间,遗传进化树分析结果表明,该菌株与棒状杆菌属细菌属于同一分类群,分离菌鉴定为棒状杆菌。 相似文献
17.
为筛选出检测猪支原体更为特异、敏感的PCR检测方法,本试验分别以16S rRNA、50S rRNA和膜蛋白OxaA为靶基因进行PCR检测,并从其敏感性、特异性和临床样本检出率等方面进行了比较。结果显示,以膜蛋白OxaA和16S rRNA为靶基因的PCR方法敏感性最高,最小检测DNA量为1.86 fg/μL,而以50S rRNA为靶基因的PCR方法最小检测DNA量为18.6 fg/μL;3种靶基因引物均扩增不出大肠杆菌、猪链球菌、猪肺炎支原体、牛附红细胞体等基因片段,具有较好的特异性;通过对临床60份血液样本的检测结果表明,以膜蛋白OxaA基因设计的引物检出率最高,为25%(15/60),明显高于16S rRNA基因的21.6%(13/60)和50S rRNA基因的18.3%(11/60)。本试验为猪支原体病的诊断及流行病学调查提供了更为敏感、特异的检测技术。 相似文献
18.
禽大肠杆菌的分离与16S rRNA的鉴定 总被引：9，自引：4，他引：5
从疑似患有大肠杆菌病的病死鸡群中采取粪便样品,分离病原进行生化鉴定,从8份样品中分离鉴定出6株大肠杆菌。根据细菌16S rRNA 基因的高度保守性,设计合成大肠杆菌的共同引物,对随机选取的1株细菌进行PCR扩增,并与GenBank中的E.coli 16S rRNA进行序列比对,确定这株细菌与大肠杆菌的同源性达99%以上。本方法特异性好,为实验室鉴定大肠杆菌提供了一种简单、容易操作的手段。 相似文献
19.
为确定云南省不同地区3个猪场仔猪发生四肢运动障碍的病原因素,无菌采集病死仔猪内部组织样品,采用血琼脂分离培养病原菌,随后对分离菌株做形态观察、生化试验、药敏试验及16S rRNA基因测序分析。结果：从3个猪场病料中均分离到菌落及个体形态一致的细菌,其16S rRNA基因序列与NCBI中7株绿色气球菌参考菌株的同源性均在99%以上,据此判定为绿色气球菌(Aerococcus viridans);3个分离菌株均对克拉霉素、头孢曲松和青霉素敏感,对复方新诺明、庆大霉素和卡那霉素耐药。鉴于病死猪有检出其他病原体感染的情况和未见该菌单独有强致病力的报道,研究结果提示绿色气球菌是危害猪健康养殖的重要机会致病菌。 相似文献
20.
从3日龄健康小鸡肠道中分离到1株乳杆菌,用PCR方法从分离菌株扩增16S rRNA基因,获得大小为1340 bp的DNA片段,该片段的核酸序列已提交GenBank,登录号为EU290749。将分离株的16S rRNA基因核苷酸序列与GenBank上其它乳杆菌进行同源性分析并建立进化树。结果表明,分离株的16S rRNA基因核苷酸序列与NCBI公布的鼠约氏乳杆菌分离株(AB295648)的同源性为99.6%,因此该分离菌株被鉴定为鸡约氏乳杆菌(chicken Lactobacillus johnsonii),命名为HN/0711。 相似文献