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猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌复合PCR检测方法的建立 总被引：2，自引：0，他引：2
目的建立可以同时检测猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的快速而可靠的PCR检测方法。方法和结果根据胸膜肺炎放线杆菌的Apx-VIA基因序列、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的16SrRNA基因序列设计5条引物。猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌模板的PCR扩增产物大小分别为342bp,485bp和1258bp。复合PCR对1～12型猪胸膜肺炎放线杆菌标准株,6株多杀性巴氏杆菌标准株,1～15型副猪嗜血杆菌以及25株经生化鉴定确认为上述三种细菌的分离株的基因组DNA作为模板进行检测,均获得预期大小的扩增产物。以猪放线杆菌、吲哚放线杆菌等14种常见细菌作为阴性对照进行PCR检测,结果仅有支气管败血波氏杆菌产生了可以和上述三个特异性条带明显区分的PCR产物。复合PCR针对胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的敏感性分别为14pg、34pg和37pg。结论本研究建立的复合PCR特异性好,敏感性高,可以用于猪胸膜肺炎放线杆菌、多杀性巴氏杆菌和副猪嗜血杆菌的快速检测。 相似文献
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猪胸膜肺炎放线杆菌PCR诊断方法的建立与应用 总被引：5，自引：3，他引：5
根据胸膜肺炎放线杆菌ApxⅣ基因设计1对引物，扩增特异的650bp棱酸片段，建立了应用PCR检测猪胸膜肺炎放线杆菌的方法。特异性试验结果表明，12个血清型的放线杆菌参考菌株均能扩增出650bp特异性的核酸片段，而大肠杆菌、多杀性巴氏杆菌、猪肺炎支原体、伤寒沙门氏菌和支气管败血性波氏杆菌的扩增结果均为阴性。敏感性试验结果表明，PCR的最低检出限量为500个放线杆菌。利用建立的PCR检测方法对22株从山东省不同地区分离的疑似胸膜肺炎放线杆菌菌株进行检测．结果14株为阳性。对感染猪病变组织的检测结果表明，病变部位不同，胸膜肺炎放线杆菌的检出率不同，其中以扁桃体的检出率最高。 相似文献
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地高辛标记探针检测猪胸膜肺炎放线杆菌的研究与应用 总被引：5，自引：1，他引：4
利用PCR反应扩增出胸膜肺炎放线杆菌ApxⅣ基因650 bp的DNA,回收并纯化PCR产物,用地高辛标记,制备出地高辛标记的核酸探针。该探针与不同血清型的胸膜肺炎放线杆菌均能发生特异性杂交,而与大肠杆菌、多杀性巴氏杆菌、沙门氏菌、葡萄球菌、猪肺炎支原体、支气管败血波氏杆菌等细菌的核酸杂交均为阴性。对胸膜肺炎放线杆菌的最低检出限量为10×102 个放线杆菌。对疑似胸膜肺炎放线杆菌感染病变组织检测结果表明,在扁桃体、鼻腔、气管、肺脏均可检测出胸膜肺炎放线杆菌,以扁桃体的检出率最高。为猪胸膜肺炎放线杆菌的诊断和流行病学调查提供了良好的方法。 相似文献
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胸膜肺炎放线杆菌研究进展 总被引：9，自引：0，他引：9
胸膜肺炎放线杆菌 (Actinobacillus pleuropneumoniae,APP,也有简写为 Ap) ,原称胸膜肺炎嗜血杆菌(H aemophiluspleuropneumoniae,Hp) ,属于巴氏杆菌科嗜血杆菌属 ,后又根据其表型 (phenotype)和 DNA杂交水平均与放线杆菌属模式种密切相关 ,归属为巴氏杆菌科放线杆菌属 ,命名为猪胸膜肺炎放线杆菌 [1 ] 。由本菌引起的猪接触传染性胸膜肺炎是猪的呼吸道传染病 ,各种年龄的猪均易感染 ;常与巴氏杆菌等混合感染 [1 ]。病猪发热 (可达 4 2℃ ) ,呼吸困难 ,食欲不振 ;剖检可见纤维素性胸膜肺炎 ,多感染两侧 ,6 5 %的肺叶病变严重 ;发病率 8.… 相似文献
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猪肺炎支原体、多杀性巴氏杆菌和猪胸膜肺炎放线杆菌三重PCR检测方法的建立 总被引：1，自引：0，他引：1
为建立简便、快速及灵敏度高的同时对猪肺炎支原体(Mh)、多杀性巴氏杆菌(PM)和猪传染性胸膜肺炎放线杆菌(App)三重PCR的检测方法,本研究针对这3种病原的基因分别设计3对特异性引物,通过PCR方法分别扩增出116bp(Mh)、253bp(PM)和473bp(App)的目的片段,其最低检出量为4个拷贝;而对肺炎双球菌、支气管败血波氏杆菌、副猪嗜血杆菌和链球菌的PCR扩增则结果均呈阴性。表明该方法具有很好的敏感性和特异性。利用该检测方法对某屠宰场472头猪肺组织病料进行检测,其结果显示:Mh、PM和App的阳性检出率分别为19.27%、5.5%和2.75%;而ELISA检测的阳性检出率分别为18%、5.08%和1.9%。这两种方法对阳性的样品检测的平均符合率为90%;此外,多重PCR与病原分离培养方法的符合率为100%。 相似文献
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猪传染性胸膜肺炎放线杆菌PCR检测方法的建立及应用 总被引：1，自引：0，他引：1
猪传染性胸膜肺炎是由胸膜肺炎放线杆菌引起猪的一种高度接触性呼吸道传染病,该病可给养猪业造成巨大的经济损失。为有效控制和确诊该病,根据报道的猪胸膜肺炎放线杆菌APXIV毒株的基因序列,合成了2对可扩增长度分别为442 bp和378 bp的特异引物,建立检测胸膜肺炎放线杆菌的巢式PCR方法。利用合成的引物在扩增猪肺疫巴氏杆菌、猪链球菌、副猪嗜血杆菌和大肠杆菌等细菌DNA时,结果均为阴性。用引物检测猪胸膜肺炎放线杆菌的标准菌株可扩增出442 bp和378 bp的特异性条带。表明运用PCR法检测猪胸膜肺炎放线杆菌的特异性和灵敏性均较高,可作为猪传染性胸膜肺炎的快速诊断和流行病学调查的手段。 相似文献
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猪传染性胸膜肺炎PCR诊断方法的建立 总被引：12，自引：2，他引：10
根据已发表的猪胸膜肺炎放线杆菌APXIV毒素的基因序列，自行设计和合成了二对可扩增448bp和365bp目的片段的引物，成功的建立了检测APP的套式PCR方法。通过对猪肺疫巴氏杆菌、猪链球菌、大肠杆菌、猪嗜血杆菌、猪肺炎支原体和猪丹毒杆菌的DNA进行了PCR检测，结果均为阴性；对猪胸膜肺炎放线杆菌的1、2、5、6、7、9国际标准血清型均扩增出448bp和365bp的特异性条带；检测的敏感度一步PCR可达到5OO个细菌，最低检出DNA浓度可达到0．585ng／mL；套式PCR可达到50个细菌，最低检出DNA浓度可达到58．5pg／mL。另外，对5株从病猪体内分离的猪胸膜肺炎放线杆菌进行了检测，5株均成阳性反应；对10只屠宰猪的肺脏分离物进行了检测，结果1份为阳性。结果表明此法特异性和敏感性均很高，可做为猪传染性胸膜肺炎的快速诊断和流行病学调查的手段。 相似文献
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猪传染性胸膜肺炎放线杆菌PCR检测试剂盒的研制 总被引：1，自引：1，他引：0
根据GenBank中猪传染性胸膜肺炎放线杆菌apxⅣA基因序列,设计了1对引物,通过对PCR反应条件进行优化,研制了检测猪传染性胸膜肺炎放线杆菌的PCR试剂盒。该试剂盒扩增的阳性条带为600 bp,特异性与敏感性结果显示,该PCR检测试剂盒的最低核酸检测量为50 CFU/mL,而对金黄色葡萄球菌、链球菌、多杀性巴氏杆菌、鼠伤寒沙门氏菌、副猪嗜血杆菌、大肠杆菌的扩增结果均为阴性。-20℃至少可保存12个月,且重复性良好。应用该PCR试剂盒对41份临床样本进行了检测,其PCR检测结果与细菌学检测结果相一致。结果表明,猪传染性胸膜肺炎放线杆菌PCR检测试剂盒能够对APP临床样品进行快捷、灵敏、准确的检测。 相似文献
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猪肺炎支原体PCR诊断方法的建立 总被引：2，自引：0，他引：2
建立了一个PCR检测猪肺炎支原体(Mhp)的方法。根据国外发表Mhp 16sr RNA基因设计了一对特异性引物，扩增出一个大小为653bp的特异性片段。将PCR产物克隆并测序表明，与GenBank的Mhp的序列的同源性为89．2％。而对于常见的猪呼吸道疾病有关的病原胸膜肺炎放线杆菌、支气管败血波氏杆菌、多杀性巴氏杆菌以及牛支原体、羊支原体不能扩增出特异性片段；PCR的敏感性实验显示这对引物能够检测到1ng的DNA，结果表明此方法特异、敏感。 相似文献
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Detection of antimicrobial resistance genes of pathogenic Salmonella from swine with DNA microarray.
Menggen Ma Hongning Wang Yong Yu Dong Zhang Shigui Liu 《Journal of veterinary diagnostic investigation》2007,19(2):161-167
A glass-based microarray was developed to detect 11 antimicrobial resistance genes that confer resistance to aminoglycosides, tetracyclines, sulfonamides, and chloramphenicols. The target genes for microarray were generated from Salmonella isolates by PCR and confirmed by sequencing. The specificity of the microarray was tested using 11 positive DNA probes. The sensitivity was tested with tetA gene and Salmonella isolates. Using detection threshold of signal-to-noise ratio (S/N) > or = 1.5 or median pixel intensity > or =1000, antimicrobial resistance genes carried by 30 Salmonella isolates were detected. Common genes included sul I(76.7%, 23/30), aph(3')-IIa (60%, 18/30), tetC (60%, 18/30), cat] (43.3%, 13/30), tetA (40%, 12/30) and aadA1 (36.7%, 11/30), and the results were confirmed to be correct by PCR. 相似文献
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GuoSheng Xiao SanJie Cao XiaoBo Huang XinTian Wen 《Canadian journal of veterinary research》2009,73(3):190-199
A DNA microarray system was prepared and shown to facilitate identification and typing of Actinobacillus pleuropneumoniae. The DNA microarray, composed of 18 DNA polymerase chain reaction (PCR) amplicons printed on glass slides and arranged in 3 subarrays, was developed. These target DNA included 1 or multiple fragments of the outer membrane lipoprotein, apx toxin, capsular polysaccharide, and disulfide bound formation protein E (dsbE)-like genes of A. pleuropneumoniae. These arrayed target DNA retained their expceted hybridization properties. The hybridization signal intensities ranged from the least-intense to the most-intense, 4626 to 9789 arbitrary fluorescence units, respectively. Cy3-probes of A. pleuropneumoniae strains labeled with multiplex PCR were hybridized to the DNA microarray. A total of 51 different A. pleuropneumoniae strains representing serotype 1 to 12 reference strains and clinical isolates were detected and typed by the DNA microarray. Twelve reference serotypes produced 11 distinct target DNA hybridization patterns, and hybridization patterns of serotypes 1 (n = 7), 3 (n = 5), and 7 (n = 6) field isolates were identical to hybridization patterns of reference serotypes 1, 3, and 7, respectively. Non-serotyped isolates 4, 6, and 11 (out of 21) from diseased pigs had identical hybridization patterns to reference serotypes 3, 7, and 1, respectively. The results show that the DNA microarray system described in the present study is a valuable tool for identifying and typing reference strains and isolates of A. pleuropneumoniae, and enables relatively rapid identification of non-serotyped isolates. 相似文献
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应用PCR检测隐孢子虫卵囊的研究 总被引：2，自引：0，他引：2
隐孢子虫病是一种重要的人畜共患原虫病。为了在临床样品中更准确、快速地检测隐孢子虫卵囊，从初步纯化的含有不同数量隐孢子虫卵囊的样品中和含有不同数量隐孢子虫卵囊的奶牛粪便中，直接提取DNA或用DNA纯化试剂盒对提取的奶牛粪便中卵囊DNA进行纯化之后用作PCR模板，用1对人工合成寡核苷酸作为PCR引物，扩增片段大小为452bp。优化了Mg^2 浓度、引物浓度和dNTP浓度，并进行了特异性检验。建立的PCR具有隐孢子虫属特异性，不仅扩增出新鲜样品DNA提取物中的目的片段，而且扩增出放置6年之久的DNA提取物中的目的片段。样品经过初步纯化之后，最低检测值100个卵囊／ml；从含有隐孢子虫卵囊的奶牛粪便中提取DNA，尔后经过DNA纯化试剂盒纯化，PCR最低检测值为10^5个卵囊/g粪便。 相似文献
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根据GenBank中收录的基孔肯亚病毒和辛德毕斯病毒基因的保守序列,合成2种病毒E基因序列及引物,设计针对2种病毒的寡核苷酸探针,制备基孔肯亚病毒与辛德毕斯病毒特异性检测基因芯片,并对该芯片的灵敏性、特异性和重复性进行了验证。结果显示,所建立基因芯片检测方法的灵敏度是普通PCR方法的100倍。利用所制备的基因芯片,能检测到基孔肯亚病毒和辛德毕斯病毒特异性杂交信号,阴性对照病毒（基因Ⅰ型流行性乙型脑炎病毒,基因Ⅲ型流行性乙型脑炎病毒,猪繁殖与呼吸综合征病毒及流感病毒）均无杂交信号。本试验初步建立了基孔肯亚病毒与辛德毕斯病毒特异性基因芯片检测方法,该方法灵敏度高、特异性强,适用于基孔肯亚病毒与辛德毕斯病毒的流行病学调查和种特异性鉴定。 相似文献
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为建立口蹄疫病毒(Foot-and-mouth disease virus,FMDV)不同血清型与基因型的基因芯片检测方法,设计针对O型8个基因型、A型3个基因型和亚洲1型的特异性探针。从美国GenBank与英国世界口蹄疫参考实验室基因库下载了O型、A型和亚洲1型FMDV的VP1基因序列547条。对每一血清型序列用DNA Star软件ClastalW程序进行多重比对,做系统发育分析并进行基因分型。用生物学软件BioSun 2.0建立基因型数据库,设计每一基因型的特异性探针。共设计出104条候选探针,通过芯片试验筛选出12条特异性探针。以各型特异性探针所对应的靶序列模板做10倍系列稀释进行PCR扩增,扩增产物与探针杂交,验证各探针的灵敏度。对O型SEA、Euro-SA、ME-SA、WA 4个基因型的各条探针的灵敏度进行了检验,结果这些探针能够检测到102数量级拷贝数的阳性靶标。 相似文献
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从GenBank上调取猴痘病毒的基因序列,经过分析,找出了猴痘病毒的特异性靶基因序列F3L片段,人工合成猴痘病毒MPV(AF380138)F3L基因片段(48048-48509bp)并插入质粒,作为病毒检测的模拟阳性模板。根据该序列设计并合成PCR引物,对模拟的阳性模板进行扩增,结果能扩增出与目的片段大小一致的条带。建立了PCR检测方法,经条件优化后,对鸡痘、禽痘、羊痘等14种相似病毒核酸进行PCR扩增,发现具有良好的特异性。PCR方法能扩增出0.3pg的阳性模板,显示建立的PCR方法具有高效、快速、特异、灵敏的特点,可用于口岸猴痘病毒的检疫。 相似文献
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F.I. Lewis F. Brülisauer C. Cousens I.J. McKendrick G.J. Gunn 《Veterinary journal (London, England : 1997)》2011,187(1):104-108
Using a representative sample of Scottish sheep comprising 125 flocks, the sensitivity and specificity of PCR for Jaagsiekte sheep retrovirus (JSRV) was estimated. By combining and adapting existing methods, the characteristics of the diagnostic test were estimated (in the absence of a gold standard reference) using repeated laboratory replicates. As the results of replicates within the same animal cannot be considered to be independent, the performance of the PCR was calculated at individual replicate level.The median diagnostic specificity of the PCR when applied to individual animals drawn from the Scottish flock was estimated to be 0.997 (95% confidence interval [CI] 0.996–0.999), whereas the median sensitivity was 0.107 (95% CI 0.077–0.152). Considering the diagnostic test as three replicates where a positive result on any one or more replicates results in a positive test, the median sensitivity increased to 0.279. Reasons for the low observed sensitivity were explored by comparing the performance of the test as a function of the concentration of target DNA using spiked positive controls with known concentrations of target DNA. The median sensitivity of the test when used with positive samples with a mean concentration of 1.0 target DNA sequence per 25 μL was estimated to be 0.160, which suggests that the PCR had a high true (analytical) sensitivity and that the low observed (diagnostic) sensitivity in individual samples was due to low concentrations of target DNA in the blood of clinically healthy animals. 相似文献
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Jung JW Park JS Hwang JW Kang KS Lee YS Song BS Lee GJ Yeo CD Kang JS Lee WS Jeon KS Um CH Kim YS Oh MJ Youn JP Li P Park JE Hwang SY 《The Journal of veterinary medical science / the Japanese Society of Veterinary Science》2004,66(11):1329-1333
The recent DNA microarray technology enables us to understand a large number of gene expression profiling. The technology has potential possibility to comprehend mechanism of multiple genes were related to compounds which have toxicity in biological system. So, the toxicogenomics through this technology may be very powerful for understanding the effect of unknown toxic mechanisms in biological system. We have studied that the effect of compounds related to hepatotoxin in vivo system using DNA microarray and classified chemicals which have been well characterized. We have studied three compounds; 2 peroxisome proliferators: Clofibrate (ethyl-p-chlorophenoxyisobutyrate), gemfibrozil (5-2[2,5-dimethyl-phenoxy]2-2-dimethyl-pentanonic), and an antiepileptic drug: phenytoin (5,5-diphenylhydantoin). Male Sprague-Dawely VAF(+) albino rats of 5-6 weeks old were treated with each compound for 24 hr and 2 weeks. 4.8 K cDNA microarray in house has been used for gene expression profiling. We found that the clustering of gene expression had similarity like as the toxic phenotype of compounds. 相似文献