正交设计优化青蒿SRAP-PCR反应体系及引物筛选     

石紫薇  梁妍  姜婷婷  梁剑平  贾宁  辛志君  陆锡宏  周翔  李雪虎 《分子植物育种》2020,(10):3303-3310

为了建立青蒿的SRAP最佳扩增体系,并筛选出SRAP多态性引物,本研究以青蒿叶片DNA为模板,采用正交试验设计,以Mg^2+、dNTP Mix、Taq DNA聚合酶、引物和DNA模板5种因素5个水平,对青蒿SRAP反应体系进行研究。结果表明,青蒿SRAP-PCR最佳反应体系为:引物0.6μmol/L、Mg^2+2.0 mmol/L、模板DNA 5.1 ng、Taq DNA聚合酶2.0 U、dNTPs 0.25 mmol/L,总体积为25μL。各因素对扩增反应均有不同影响,其中引物浓度的影响最大,dNTPs的影响最小。运用该体系对不同种质资源的青蒿进行验证,证明该体系稳定可靠,并在30个引物组合中筛选出了25对扩增条带清晰,多态性丰富的引物组合。这一结论为今后利用SRAP标记技术进行青蒿分子遗传学研究提供了科学依据。  相似文献   

广东果树上17种拟茎点霉的RAPD分析   总被引：3，自引：0，他引：3  

姜子德  梅曼彤  戚佩坤 《植物病理学报》2003,33(1):35-39

 自320个随机引物中筛选出适于拟茎点霉属真菌种间亲缘关系分析的15个随机引物,并优化了RAPD分析的扩增体系,在此基础上,对广东果树上17种拟茎点霉进行了RAPD分析。各菌株间的Nei相似系数UPGMA法聚类结果表明:来源于不同地区的2个Phomopsis mangiferae Ahmad菌株和2个P.macadami Z.D.Jiang et P.K.Chi菌株都分别以0.636和0.589的相似系数两两首先聚在一起,而不同的种则只在小于0.54的相似系数范围内聚类,体现了种间及种内的亲缘关系差异程度;聚类群与寄主植物不具相关性,同种植物上的不同拟茎点霉,即使是分自相同寄生部位也不能聚在一类;支持形态学上将生于柑桔枝和黄皮茎、沙梨叶和果、杨梅叶和枝以及同是生于龙眼叶的共8个拟茎点霉分别鉴定为不同的种,而不支持将P. cytosporella Penz.et Sacc.与P. mangiferae合并为一个种的观点;RAPD技术可作为拟茎点霉属真菌种间的亲缘关系分析的重要手段。  相似文献   

RAPD标记鉴定果树芽变的可行性分析   总被引：23，自引：4，他引：19  

房经贵  章镇  陈崇顺  王三红  周兰华 《果树学报》2001,18(3):182-185

在综合分析果树芽变的遗传特点以及RAPD标记技术的原理与存在问题的基础上，结合已有的研究报道，对RAPD标记应用于果树芽变鉴定中的可行性进行了探讨。对于不同的果树芽变类型，RAPD标记技术表现出不同的鉴定可行性。同时，对某些有关的问题提出了相应的建议。  相似文献   

Genetic diversity of herbicide-resistant and -susceptible Avena fatua populations in North Dakota and Minnesota     

L W MENGISTU  C G MESSERSMITH  & M J CHRISTOFFERS 《Weed Research》2005,45(6):413-423

Genetic diversity within and among 20 herbicide-resistant (HR) and 16 herbicide-susceptible (HS) Avena fatua multi-field populations was determined using 82 polymorphic loci resulting from two intersimple sequence repeat (ISSR) primers and one long-primer random amplified polymorphic DNA (LP-RAPD) primer. Collections from the Red River Valley of North Dakota and Minnesota, sampled in 1964 and 2000, represented A. fatua populations before and after intensive exposure to herbicides. A 1995 collection from south-west North Dakota represented A. fatua exposed to low herbicide selection. Despite differences in years of herbicide exposure among collections, both HR and HS populations from every collection maintained nearly similar levels of ISSR and RAPD diversity. Genetic differentiation among populations (G_ST) varied from 11% to 13% among HR populations and from 9% to 16% among HS populations, indicating that 84–91% of total variation remained within HS or within HR populations. Minimal difference in gene diversity between HR and HS is consistent with multiple origins of resistance, where HR A. fatua most likely evolved from diverse founding individuals.  相似文献   

导入热带基因后温带玉米自交系的RAPD分析     

王国琴  张旭  王鹏文 《天津农业科学》2001,7(3):32-34

利用 RAPD分析，可以确定热带、亚热带基因导入温带材料所形成的创新材料的亲缘关系，并对基因导入结果进行检测。  相似文献   

分子标记用于赤眼蜂分子监测的研究   总被引：5，自引：0，他引：5  

李正西  沈佐锐 《农业生物技术学报》2001,9(1):65-68

通过对松毛虫赤眼蜂（Trichogramma dedrolimi Matsumura）以及玉米螟赤眼蜂（Trichogramma ostriniae Pang et Chen）rDNA-ITS2基因的克隆测序，并联机检索GenBank核酸序列库中其它赤眼蜂的相关序列，利用核酸分析软件找到松毛虫赤眼蜂和玉米螟赤眼蜂ITS2序列中一段有鉴别意义的标志，并据此设计出蜂种的特异PCR引物，实现了松毛虫赤眼蜂和玉米螟赤眼蜂rDNA特异区带的PCR扩增。研究表明该特异区带具有种的特异性。我们认为该分子标记技术可用于目前我国生防中常用的松毛虫赤眼蜂和玉米螟蒌眼蜂的分子监测，如田间种群动态监控和寄生效果评估。  相似文献   

几种绢丝昆虫遗传多样性的RAPD研究   总被引：10，自引：4，他引：6  

程道军  鲁成  周泽扬  向仲怀 《蚕业科学》2002,28(4):277-282

选用重复性较好的 10个引物对 6种绢丝昆虫 2 3个个体进行扩增 ,共得到 2 45个RAPD标记。RAPD分析结果表明 :家蚕及野桑蚕种内各品种材料的遗传距离较大 ,天蚕、蓖麻蚕及柞蚕较小 ;家蚕与野桑蚕两者之间遗传距离小 ,反映出家蚕和野桑蚕亲缘关系较近 ;而天蚕、蓖麻蚕和柞蚕三者之间以及分别与家蚕和野桑蚕之间的遗传距离较大 ,亲缘关系远。聚类分析的结果与之相同。并且对家蚕的起源及绢丝昆虫遗传多样性的保护利用做了探讨。  相似文献   

RAPD技术对地方鸡种群体遗传结构的分析   总被引：16，自引：1，他引：15  

周怀军  陈宽维 《中国家禽》1997,(5):7-10

利用ＲＡＰＤ技术对４个地方鸡种和１个引进鸡种的群体遗传结构进行分析，通过筛选的５个随机引物ＯＰＨ－０２、ＯＰＨ－０５、ＯＰＨ－１３、ＯＰＨ－１６、ＯＰＧ－０７对５个鸡种的池ＤＮＡ进行多态性研究，结果表明：５个引物共产生条带６１个，扩增产物片段的长度一般从１５０ｂｐ－４ｋｂ。  相似文献   

绵羊、山羊、岩羊和非洲羚羊RAPD的研究   总被引：2，自引：0，他引：2  

李祥龙  巩元芳  刘铮铸  李金泉 《中国畜牧兽医》2003,30(5):21-23

作者用39个10碱基随机引物对绵羊、山羊、岩羊和非洲羚羊4个物种的池DNA进行了RAPD分析，共检出347条清晰条带，309条表现多态性，多态频率为89．05％。种属间的遗传距离指数和分子聚类关系表明，山羊和绵羊遗传亲缘关系最近，非洲羚羊表现出与山羊特别与绵羊较近的遗传亲缘关系，而岩羊则表现出与绵羊特别与山羊较远的遗传亲缘关系。  相似文献   

藏系绵羊随机扩增多态性DNA最佳反应体系的研究   总被引：2，自引：1，他引：1  

杨晓军  赵有璋 《中国草食动物》2003,23(2):3-6

以高原型藏羊的基因组DNA为模板，通过对RAPD反应体系中的各种参数进行优化试验，建立了适宜于藏系绵羊RAPD分析的最佳反应体系：在PE2400型DNA扩增仪的25μL反应体系中，模板DNA的量为60－120ng，引物量为4－8pmol，Mg^2 浓度为2.0mM，Taq DNA聚合酶为1－2.5U,dNTP浓度为150－200μM;94℃预变性3分钟后35次循环的参数设定为：94℃1分钟，36℃1分钟，72℃2.5分钟，最后72℃延伸10分钟，利用这些条件对藏系绵羊的基因组DNA进行RAPD分析，其结果的重复性和可靠性大为提高。  相似文献