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为探讨细菌全基因组测序（whole genome sequencing，WGS）技术在基层沙门氏菌防控中的优势与可行性，对前期分离的9株沙门氏菌进行细菌全基因组测序，并进行血清型预测、多位点序列分型（multilocus sequence typing，MLST）和耐药基因分析，将全基因组测序结果与传统血清分型和耐药性分析结果进行对比。结果显示：基于全基因组测序数据的血清分型结果与传统血清分型结果符合率为100%，两种方法对9株沙门氏菌血清分型结果完全一致；两种方法分析出的β-内酰胺类、氯霉素类、喹诺酮类和氨基糖苷类药物的耐药基因与耐药表型符合率为100%，即耐药菌株中均含有4大类抗菌药物的耐药基因；用全基因组测序检测到利福平、磺胺类和四环素3大类抗菌药物的7个耐药基因，表明9株沙门氏菌可能对这3大类抗菌药物耐药。结果表明：全基因组测序结果与传统实验室诊断结果完全一致，且具有快速、低成本、操作简单等优势，并且随着测序技术的发展，其检测成本和周期将进一步缩减，因此基于细菌全基因组测序开发沙门氏菌快速分型和耐药性分析方法有一定的应用价值和可行性。 相似文献
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【目的】研究内蒙古地区部分奶牛养殖场乳房炎生鲜乳样本及环境样本致病菌种类和耐药性,为乳房炎的防控提供临床用药指导和参考。【方法】采用平板划线法对内蒙古地区4个规模化养殖场468份(乳房炎生鲜乳样本199份,乳房炎奶牛饲养环境样本269份)样本进行细菌分离培养,采用形态学观察、革兰氏染色镜检以及16S rDNA测序对分离出的细菌进行鉴定,且对引发乳房炎的主要致病菌进行药敏性试验。【结果】高盐甘露醇培养基上呈现出小、白且偏黄色的菌落,经16S rDNA测序比对,与金黄色葡萄球菌高度相似的菌株共56株,分离率为11.97%;在伊红-美蓝培养基上呈现出黑紫色泛有金属光泽的菌落,经16S rDNA测序比对,与大肠杆菌高度相似的菌株共44株,分离率为9.40%。在199份生鲜乳样本中,金黄色葡萄球菌和大肠杆菌的分离率最高,分别为21.11%和17.09%;在269份环境样本中,金黄色葡萄球菌和大肠杆菌的分离率分别为5.20%和3.72%。药敏试验结果显示,金黄色葡萄球菌对青霉素、磺胺异噁唑、氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸的耐药性相对较高,耐药率分别为90.63%、78.13%、75.00%、68.75%;对庆大霉素、环丙沙星、复方新诺明的敏感性较高。大肠杆菌对氨苄西林、头孢噻吩、磺胺异噁唑存在明显耐药性,耐药率分别为100%、94.29%、45.71%;对链霉素、卡那霉素、庆大霉素、多粘菌素E、美罗培南、阿莫西林/克拉维酸以及利福昔明表现出较高敏感性。【结论】内蒙古地区引发奶牛乳房炎的主要致病菌为金黄色葡萄球菌、大肠杆菌;金黄色葡萄球菌对青霉素、磺胺异噁唑、氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸的耐药性相对较高;大肠杆菌对氨苄西林、头孢噻吩、磺胺异噁唑存在明显的耐药性。 相似文献
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本研究将2012—2017年分离自山东等6省份的194株鸡源和89株猪源沙门氏菌进行了血清型鉴定和9大类13种药物的药敏试验。血清型鉴定结果显示:鸡源沙门氏菌血清型以肠炎(59.69%)、婴儿(13.61%)和鸡白痢(8.90%)为主,猪源沙门氏菌血清型以鼠伤寒(58.43%)、肠炎(12.36%)、印第安纳(11.24%)和德尔卑(7.87%)为主,两者优势血清型差异极显著(P0.01)。最小抑菌浓度(MIC)分布结果显示:沙门氏菌对氨苄西林、头孢噻呋、庆大霉素、大观霉素、四环素、多西环素、氟苯尼考、磺胺甲基异噁唑、复方新诺明、恩诺沙星和氧氟沙星耐药的问题较为突出,对黏菌素E的耐药率相对较低;猪源菌株比鸡源菌株耐药严重,对11种药物的耐药率均高于鸡源菌株。2种来源的分离菌株对阿莫西林/克拉维酸钾、头孢噻呋、庆大霉素、大观霉素、四环素、多西环素、氟苯尼考、恩诺沙星、氧氟沙星的耐药率差异均极显著(P0.01),对黏菌素E的耐药率差异显著(P0.05);猪源分离菌株的耐药问题较欧盟国家突出,与鸡源菌株5耐以上的菌株比例差异极显著(P0.01)。肠炎和鼠伤寒沙门氏菌对阿莫西林/克拉维酸、庆大霉素、大观霉素、四环素、氟苯尼考、磺胺异噁唑和黏菌素E的耐药率差异极显著(P0.01),对氨苄西林耐药率差异显著(P0.05)。不同年份间沙门氏菌分离株对氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、头孢噻呋、庆大霉素、大观霉素、四环素、氟苯尼考、复方新诺明、恩诺沙星和黏菌素E的耐药率差异极显著(P0.01),对多西环素和氧氟沙星耐药率差异显著(P0.05)。结果表明:肠炎、鼠伤寒分别是我国部分地区鸡、猪源沙门氏菌的优势血清型;沙门氏菌耐药性与动物来源、血清型和分离年份相关,且鸡、猪源沙门氏菌耐药情况比欧盟国家严重。 相似文献
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四川省动物性食品源沙门氏菌的耐药性监测与分析 总被引：3，自引：3，他引：0
近年食源致病菌耐药性较严重,为了解四川省动物性食品源沙门氏菌（Salmonella spp.）耐药情况,本试验采用肉汤微量稀释法,对源自四川省动物性食品的76株沙门氏菌进行了25种抗生素(组合)的敏感性试验。结果表明76株沙门氏菌对利福平（96.05%）、黏菌素（78.95%）、磺胺异噁唑（64.47%）、先锋唑啉（60.53%）、氨苄西林（60.53%）、阿莫西林—克拉维酸（56.58%）、甲氧苄啶（53.95%）及强力霉素（52.63%）耐药率较高。76株沙门氏菌对25种抗生素（组合）共产生了66种耐药谱,多重耐药率达97.37%（74/76）,主要对青霉素类、先锋唑啉、链霉素、四环素类、磺胺类药物及黏菌素表现出多重耐药。结果表明,四川地区食源沙门氏菌耐药性已较为严重,应加强连续监测。 相似文献
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为了解吉林地区宠物源肠球菌的耐药情况和噁唑烷酮类耐药基因optrA在宠物源肠球菌中的流行分布特征，本研究对来自长春市和吉林市4家宠物医院的200份宠物肛门拭子样品，利用肠球菌琼脂培养基进行细菌的分离，利用16S r RNA基因的PCR扩增及测序进行菌种的鉴定，采用琼脂稀释法对11类13种抗菌药物进行药敏试验，利用PCR检测酰胺醇类耐药基因fexA、fexB和噁唑烷酮类耐药基因cfr、optrA，并对携带optrA基因的菌株进行全基因组测序。结果显示，本研究分离到96株肠球菌；药敏试验结果显示，宠物源肠球菌对克林霉素、四环素、沃尼妙林、庆大霉素和红霉素耐药严重，耐药菌株分别占87.5%、76.0%、72.9%、65.6%和55.2%，其次对环丙沙星、青霉素、氨苄西林和利福平耐药的菌株分别占33.3%、24.0%、20.8%和12.5%，对氟苯尼考耐药的菌株相对较少，占5.2%，检测到1株对万古霉素耐药的屎肠球菌，未检测到对利奈唑胺和替加环素耐药的菌株。PCR检测到3株同时携带optrA及fexA耐药基因的粪肠球菌，且其均呈多重耐药性。对携带optrA基因肠球菌的全基因组测序结果显示，3株... 相似文献
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2014-2016年从广州市屠宰场分离沙门氏菌151株,鉴定出12种血清型,前3位优势血清型分别为德尔卑沙门氏菌、罗森氏沙门氏菌、鼠伤寒沙门氏菌。采用微量肉汤稀释法测定分离菌株对13种抗菌药物的敏感性。结果显示,沙门氏菌对四环素、多西环素、磺胺异恶唑、氨苄西林、大观霉素的耐药率都在60%以上,对奥格门丁、恩诺沙星、氧氟沙星、头孢噻呋、多粘菌素E敏感（耐药率≤16%）。多重耐药率为79.20%。研究表明,沙门氏菌对部分药物耐药性较严重,亟需加强养殖业抗菌药物的合理应用以控制耐药性的发展。 相似文献
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为了解我国禽源沙门氏菌的流行和耐药情况及其血清型、ST型和耐药性之间的关系，对2008—2017年，在我国部分地区分离的90株禽源沙门氏菌，用血清凝集方法鉴定其血清型，用微量肉汤稀释法对部分菌株进行药物敏感性试验；经PCR扩增、测序和比对查询，得到90株菌的ST型，并用BioNumerics 7.6分析MLST分型及其亲缘关系；利用统计学方法，对分离株的血清型、ST型和耐药性进行差异显著性和相关性分析。血清型鉴定结果显示：90株禽源沙门氏菌可分为16种血清型，其中S. Enteritidis为优势血清型。71株菌株的药物敏感性试验结果显示：多重耐药菌株占比90.14%（64/71），对氨苄西林（78.87 %）和磺胺异噁唑（77.46 %）的耐药率较高，仅S. Indiana菌株的ST17型对头孢他啶耐药。其他相关分析结果显示：分离菌株对氨苄西林等7种药物的耐药率显著上升（P＜0.05），而对黏菌素耐药率下降极显著（P＜0.01）；鉴定出14种ST型，其中ST11为优势型；最小生成树显示，仅有一个ST complex，菌株来自7个省市；S. Indiana的耐药率显著高于S. Enteritidis（P＜0.05），且其ST17所耐药物种类多于其他ST型。结果表明：我国禽源沙门氏菌的优势血清型是S. Enteritidis，优势ST型为ST11，其血清型和ST型有一定的相关性，且不同地区分离株之间有一定的亲缘关系；分离株对不同药物的耐药性存在差异，且耐药谱和耐药率与血清型相关，S. Indiana菌株与S. Enteritidis相比更易形成耐药菌株。 相似文献
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为了解上海市农贸市场肉鸽群体中沙门氏菌流行血清型和耐药情况,本试验于2011-2014年间从上海市各区农贸市场采集肉鸽新鲜粪便样本92份,用XLD平板和沙门氏菌属显色培养基分离疑似沙门氏菌,革兰氏染色镜检并进行生化试验,共获得沙门氏菌24株,分离率为26.1%。采用Kauffmann-White法和K-B纸片法对24株沙门氏菌进行血清型鉴定和16种抗生素的药敏试验。血清型鉴定显示,24株沙门氏菌可分为鼠伤寒（66.7%）、阿贡纳（25.0%）和科瓦利斯（8.3%）3种血清型。药敏试验结果显示,有75.0%（18株）的分离株表现出不同程度耐药,其中分离株对四环素和磺胺异唑耐药率最高,均达到62.5%,其次为链霉素（58.3%）、萘啶酸（50.0%）、氨苄西林（20.8%）。多重耐药菌株15株（62.5%）,耐4种抗菌药物的菌株最多,占16.7%（7株）。另外,分离菌株对头孢吡肟、头孢噻肟、头孢噻甲羧肟、亚胺培南、氧氟沙星等5种药物的敏感率为100.0%,对奥格门丁和环丙沙星有12.5%的中介敏感率。本研究结果表明,上海市肉鸽中沙门氏菌的携带率较高,且菌株多重耐药现象较严重,这为食品中沙门氏菌的防控工作带来较大的挑战和风险,肉鸽沙门氏菌的流行和耐药情况应值得密切关注。 相似文献
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LIANG De-mei XU Xue-bin WANG Wei-fang ZHAN Ze-qiang REN Xing-xing LIN Jia-te LIAO Ming ZHANG Jian-min 《中国畜牧兽医》2016,43(12):3322-3328
The purpose of this study was to investigate the molecular types and antimicrobial resistance of Salmonella isolated from pigeon in Shanghai from 2011 to 2014. A total of 92 fecal samples were collected from markets. XLD plate and Salmonella chromogenic medium were used to isolate suspected Salmonella colonies, and then determined the number of Salmonella through gram staining and biochemical tests. Among them, 24(26.1%) were positive for Salmonella. Kauffmann-White method and the K-B method were used respectively for serotype identification and susceptibility testing. In result, serological identification showed that 24 isolates from pigeon could be divided into 3 serotypes including S.typhimurium (66.7%), S.agona (25.0%) and S.corvallis (8.3%). Drug susceptibility test showed that 75.0% of the isolates were resistant to one antibiotic at least. The highest level resistance were found for tetracycline as well as sulfisoxazole (62.5%), followed by streptomycin (58.3%), nalidixic acid (50.0%) and ampicillin (20.8%). Multi-drug resistant strains accounted for 62.5% (15), in which the largest number of strains (7, 16.7%) were resistant to four drugs. In addition, isolates were 100.0% susceptible to cefepime, cefotaxime, ceftazidime, imipenem and ofloxacin, but 12.5% were moderately sensitive to the amoxicillin/clavulanic acid and ciprofloxacin. The study showed that Salmonella had a high separation rate of pigeon in Shanghai farmers market and performed serious multidrug resistance, which would bring great challenges and risks to the prevention and control of Salmonella in food, so that the prevalence and drug resistance of Salmonella in pigeon deserved close attention. 相似文献
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为了解广东省禽场和猪场沙门菌的血清型和耐药性情况,本研究2015年从广东省多个养殖场共采集样品126份,分离出沙门菌24株,分离率为19.04%。采用Kauffmann-White法、Kirby-Bauer法和PCR方法对分离株进行了血清型鉴定、药敏试验和Ⅰ类整合子检测。血清型鉴定结果显示,24株沙门菌共鉴定出4种血清型,分别是鼠伤寒沙门菌(14株)、印第安纳沙门菌(8株)、科瓦利斯沙门菌(1株)和阿尔巴尼沙门菌(1株)。药敏试验结果显示,分离株对四环素(83.33%)、氨苄西林(70.83%)、磺胺异恶唑(70.83%)、萘啶酸(66.67%)、复方新诺明(58.33%)、卡那霉素(54.17%)、阿米卡星(54.17%)、庆大霉素(50.00%)的耐药率较高,有54.17%(13/24)的菌株对8种及8种以上抗菌药物耐药。Ⅰ类整合子检测结果显示,Ⅰ类整合酶阳性率为29.17%(7/24),整合酶阳性菌株中仅有1株扩增到携带耐药基因aadA2的基因盒。上述结果表明,广东省禽场和猪场沙门菌分离率较高,耐药情况严重,菌株的耐药性与其血清型和Ⅰ类整合子的携带有一定的相关性。 相似文献
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为掌握上海市沙门氏菌在农贸市场和超市禽肉制品和活禽中的污染状况、流行血清型和耐药情况,本试验从320份2012年采集的禽肉样本(240份)和活禽泄殖腔棉试子(80份)中共分离鉴定出沙门氏菌70株,阳性率为21.9%。血清型鉴定结果表明,共鉴定出11种不同的血清型,其中肠炎沙门氏菌占47.1%、印第安纳沙门氏菌占17.1%、鼠伤寒沙门氏菌和德尔卑沙门氏菌均占8.6%。通过纸片法对这70株沙门氏菌进行了16种常用抗菌药物的药敏试验,结果表明,沙门氏菌对奈啶酸耐药率最高,达75.7%,对磺胺异唑、链霉素和氨苄西林耐药率较高,分别为60.0%、60.0%和51.4%。除亚胺培南外,其他药物均有不同程度的耐药菌株。有40株(57.1%)沙门氏菌呈多重耐药表型,耐药性最强的菌株可以对14种抗菌药产生耐药性。本研究对沙门氏菌病的防控及指导临床合理用药具有重要的现实意义。 相似文献
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为了解广东省广州市屠宰环节环境中沙门氏菌血清型分布及其耐药性,对广州市大型生猪、家禽屠宰企业环境进行监控,对比分析猪禽屠宰场污染的沙门氏菌主要血清型和耐药谱。采集屠宰场的空气、土壤、污泥样品,以及运输车辆、待宰圈/舍、屠宰车间等环境拭子样品,利用沙门氏菌特异性引物进行PCR扩增和测序鉴定;通过玻片凝集法,对PCR鉴定阳性菌落进行沙门氏菌血清分型;同时,对鉴定出的沙门氏菌进行12种抗生素耐药性分析。结果显示:55个样品池中,沙门氏菌阳性检出率为18.18%;猪禽屠宰场之间沙门氏菌污染率无显著差异(P>0.05),而不同类型样品之间差异显著(P<0.05),其中排污池污泥(75.00%)、土壤(33.33%)和屠宰车间(23.53%)污染率较高;猪屠宰场沙门氏菌优势血清型为鼠伤寒沙门氏菌(S.typhimurium),而禽屠宰场为肠炎沙门氏菌(S.enteritis);所有分离菌株对阿莫西林、氨苄西林2种抗生素完全抗药,对亚胺培南完全敏感,对头孢曲松、头孢他啶、头孢噻吩、氨曲南4种抗生素高度敏感。结果表明:猪禽屠宰场环境中,沙门氏菌污染较为严重,污泥、土壤和屠宰车间是沙门氏菌污染扩散的主要环节;猪禽屠宰场污染的沙门氏菌优势血清型并不同,且环境中污染的沙门氏菌都对部分常用抗生素产生了完全抗药。结果提示:应加强猪禽屠宰环节的沙门氏菌污染控制,将污泥、土壤、屠宰车间作为日常消毒的重点;基层应针对猪禽各自的优势血清型菌株,选用高度敏感抗生素进行沙门氏菌病防治。 相似文献
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为了探明华中地区种鸡场沙门菌(Salmonella)的优势血清型和耐药情况,本研究从湖北、河南、湖南等省市22个规模化鸡场采集病鸡、死胚及弱雏组织样品3 724份,通过分离培养、生化试验、PCR鉴定及血清型试验确定分离菌种属及其血清型,并采用Kirby-Bauer法对分离菌株进行了耐药性分析。结果显示,本试验从3 724份病料中共分离鉴定出124株沙门菌,其中79株为D群肠炎沙门菌(63.71%,79/124),34株为D群鸡白痢沙门菌(27.42%,34/124),8株为B群鼠伤寒沙门菌(6.45%,8/124),有3株沙门菌未能确定血清型。O抗原鉴定79株肠炎沙门菌和34株鸡白痢沙门菌为O9,8株鼠伤寒沙门菌为O4。H抗原鉴定79株肠炎沙门菌为Hg,m,8株鼠伤寒沙门菌为Hi。药敏试验结果显示,124株分离菌株对萘啶酸、氨苄青霉素、四环素和多西环素耐药率分别为95.97%(119/124)、91.94%(114/124)、57.26%(71/124)和70.16%(87/124);对复方新诺明和红霉素耐药率分别为25.81%(32/124)和12.10%(15/124);对氯霉素、庆大霉素、头孢噻肟和卡那霉素耐药率分别为6.45%(8/124)、1.61%(2/124)、1.61%(2/124)和0.81%(1/124);对左氧氟沙星、阿米卡星和多黏菌素B完全敏感。99.19%(123/124)的分离株至少对一种药物耐药,87.10%(108/124)的分离株表现多重耐药。本研究为华中地区养鸡场沙门菌的诊断及防控提供了数据支撑。 相似文献
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为了解北京市宠物源细菌的抗菌药物耐药情况,2022年,笔者对北京市四个城区的四家宠物医院的犬、猫共计50份样本的肛拭子进行了研究。试验对样品中的大肠杆菌和肠球菌首先进行了分离培养和质谱鉴定,然后采用微量肉汤稀释法分析分离菌株的耐药表型。结果共分离出大肠杆菌25株、肠球菌25株（屎肠球菌14株、粪肠球菌11株）。大肠杆菌耐药率最高的2种抗菌药为四环素和氨苄西林,多重耐药菌占44%;肠球菌耐药情况较严重,粪肠球菌耐药率最高的抗菌药物为磺胺异噁唑,屎肠球菌耐药率最高的抗菌药物为磺胺异噁唑、头孢西丁和红霉素,二者多重耐药菌占分离株总数的100%。综上,北京地区宠物源大肠杆菌、肠球菌的耐药情况较为严峻,且多重耐药现象突出,需要加强对宠物抗菌药使用的监督与管理。 相似文献
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河南省部分地区猪群大肠杆菌分离菌的耐药性比较分析 总被引：1，自引：0，他引：1
为掌握河南省猪源大肠杆菌的耐药情况,于2013年至2018年对河南省郑州、开封、焦作、许昌四个地区部分规模化养猪场分离出的856株大肠杆菌,采用CLSI推荐的微量肉汤稀释法,调查其对8类13种代表性抗菌药物的耐药性。结果表明,856株大肠杆菌对氧氟沙星、黏菌素、庆大霉素、头孢噻呋和阿莫西林/棒酸等5种药物的耐药率在35.0%以下,分别为32.2%、31.1%、25.5%、15.5%和30.0%;对恩诺沙星、四环素、多西环素、大观霉素、氟苯尼考、磺胺异恶唑、复方新诺明和氨苄西林等8种药物的耐药率范围为45.0%～95.0%,其中对四环素、多西环素和磺胺异恶唑等3种药物的耐药率高达90.0%以上;多重耐药集中于耐5、6和7类抗生素,耐3类及以上药物的菌株占90.0%。本研究结果表明河南省部分养殖场猪源大肠杆菌耐药形势严峻,应加强对其监测和控制。 相似文献
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LI Chen ZHANG Shuang-xiang ZHOU Bi-jun CHENG Zhen-tao WEN Ming MA Guang-qiang WANG Wei HU Xing-yi ZHANG Hai DING Zun-e WANG Kai-gong 《中国畜牧兽医》2017,44(12):3625-3633
In order to find out the serotype, resistant phenotype and genotype of Escherichia coli (E. coli) and Salmonella in piglets, this study collected 128 samples of diarrhea piglets from seven large-scale pig farms in five cities in Guizhou province, and the E. coli and Salmonella were isolated and identified. The pathogenicity of the strain was identified by animal test. The drug resistance of the main pathogen was tested by drug susceptibility paper. The resistance gene of each pathogen was detected by PCR. The drug resistance and genotype correlation of the bacterial were analyzed. The results showed that 78 strains of pathogenic E. coli and 21 strains of Salmonella were isolated and identified in this study. The serotypes of pathogenic E. coli were predominantly O138 and O87. Salmonella Typhimurium and Salmonella Enteritidis were predominant serotypes. The susceptibility test showed that the resistant strains of 78 strains of E. coli were more than 80% resistant to β-lactams and more than 40% for other antibacterials. The resistance rate of 21 strains of Salmonella to aminoglycosides was more than 50% and more than 20% to other types of antibacterials; 12 and 10 kinds of drug resistance-related genes of E. coli and Salmonella were detected, respectively; The coincidence rate of resistant genotype and phenotype of two kinds of bacteria were above 60%, and both were multiple drug resistance. This study provided a theoretical basis for comprehensive prevention and control of piglets diarrhea. 相似文献
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SHEN Xue-huai ZHANG Dan-jun PAN Xiao-cheng ZHAO Rui-hong DAI Yin HU Xiao-miao 《中国畜牧兽医》2017,44(12):3663-3669
In order to investigate the situation of predominant strain and antibiotic resistance of avian Salmonella in Anhui province, 42 strains Salmonella were isolated and identified from 116 suspected samples by culture characteristics, microscopic examination, biochemical test, PCR and serological identification,then drug resistance was analyzed by Kindy-Bauer method. There were 5 groups of 11 serotypes in 42 strains Salmonella, of which 30 strains belonged to B serogroup, 2 strains to A serogroup, 7 strains to D serogroup, 2 strains to C1 serogroup, 1 strain to C2 serogroup, and Salmonella Typhimurium of B serogroup were the predominant serotypes. All Salmonella isolates resistant rates to amikacin, levofloxacin and ciprofloxacin were less than 20%, and the resistance rates to ampicillin, streptomycin, furazolidone, spectinomycin, cotrimoxazole and doxycycline were more than 50%, while resistance rate to ampicillin was 97.62%, and 41 isolates had multiple drug resistance. The results showed that Salmonella Typhimurium was the predominant serotypes of avian Salmonella in Anhui, and isolates showed multiple drug resistance. This study would provide the data basis for the comprehensive prevention and treatment of clinical medicine of avian Salmonella. 相似文献