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1.
马铃薯遗传资源多样性的SRAP分析 总被引：4，自引：0，他引：4
采用SRAP分子标记，对44份马铃薯品种的遗传多样性进行了分析。结果显示, 随机抽取27对SRAP引物，对基因组DNA进行特异扩增，其中23对引物扩增出多态性条带，共获得104个多态性条带, 多态性引物比率达85.2%, 平均每对引物产生4.5个多态性条带，表明SRAP标记具有较高的多态性比率。44份种质资源的SRAP标记遗传距离为0.147-0.741。当遗传距离D=0.67时，将44份种质资源分为四大类群，包括一个复合类群和三个独立类群。其中复合类群可进一步分为7个亚群。从而在DNA水平上证明了所研究马铃薯种质资源具有丰富的遗传多样性。 相似文献
2.
为了解斑鳠(Mystus guttatus)不同地理种群之间的遗传分化程度,基于RAPD技术,分析了珠江水系西江段野生斑鳠的遗传多样性。利用20个随机引物对30个斑鳠个体的基因组DNA进行了PCR扩增,共扩增出3210条DNA片段,平均每个个体扩增出107条带。在检测到的107个位点中,多态位点数为48个,占44.9%,仅有一个引物S30没有扩增出多态带。个体间最大的遗传距离0.2804,最小的遗传距离0.0467,平均遗传距离0.1526±0.037,种群内个体间平均的相似率为84.7±3.7%。 相似文献
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运用ISSR标记对来自深圳、北海和防城港的三个细基江蓠繁枝变种群体进行遗传多样性检测,筛选出的16条ISSR引物共扩增出111条带,引物平均多态位点比例为54.95%。三个群体的多态位点比例深圳群体最高为23.42%,北海群体最低为4.50%;群体平均多态位点比例为11.12%,平均基因多样性（Hs）为0.051 3,表明细基江蓠繁枝变种群体遗传多样性较低。群体遗传分化指数为0.756 5,说明遗传变异主要存在于群体间且群体间的遗传分化水平较高。Mantel检验发现遗传距离与地理距离无关。适应生态环境选择无性繁殖模式可能是细基江蓠繁枝变种群体遗传多样性较低、群体间遗传分化大的重要因素。 相似文献
4.
RAPD分析野生和养殖太湖秀丽白虾的遗传多样性 总被引：4，自引：0，他引：4
摘要：用60个随机引物对野生和养殖的太湖秀丽白虾进行随机扩增多态DNA(RAPD)分析,筛选的23个随机引物共检测到105个位点（200～2000bp）。用PopGen1.32分析结果表明：野生种群多态位点比例为50.47%,养殖种群多态位点比例为43.33%;野生种群和养殖种群的种群内遗传相似系数分别为0.8635和0.8795;野生种群和养殖种群之间的遗传距离为0.0361;野生种群平均Shannon多样性指数h0为0.2830,略高于养殖种群的0.272。 相似文献
5.
基于RAPD标记的福建省稻曲病菌遗传多样性分析 总被引：3，自引：0，他引：3
为了解福建省稻曲病菌群体的遗传多样性和遗传组成,应用随机扩增多态性RAPD (random amplified polymorphic DNA)技术分析了来自福建省不同水稻种植区的102个稻曲病菌(Ustilaginoidea virens)的遗传多样性.从100条随机引物中筛选出10条扩增带清晰、重复性好的引物进行稻曲病菌多态性扩增,共扩增出157条带,多态性条带比率为82.17％,遗传距离变化范围为0.02～0.67.遗传多样性分析表明,福建省稻曲病菌具有丰富的遗传多样性,相对于其它地区而言,福建闽西地区分离的菌株遗传多样性水平最高PPB=76.43,H=0.2212,I=0.3383),晚稻分离的菌株群体遗传多样性(PPB=91.08,H=0.2402,I=0.3655)高于早稻群体(PPB=63.06,H=0.1892,I=0.2870).聚类分析显示,在遗传距离0.349水平上,供试的所有菌株可被划分成7个遗传聚类组(R1～R7),聚类组R1为优势聚类组,包含有80个菌株,其内又存有一些亚组.这些菌株的聚类与菌株的地理来源及水稻品种无明显相关性.但是在遗传距离0.330水平上,来自宁化的10个菌株可被明显划分成早稻群体和晚稻群体.初步分析认为菌株的地理来源、水稻品种及其生长季节是影响福建省稻曲病菌遗传多样性的主要因素,在稻曲病菌的遗传变异以及该病的发生和流行中可能起重要的作用. 相似文献
6.
本研究的目的在于筛选合适的RAPD随机引物,应用RAPD技术对药用植物绞股蓝进行遗传多样性分析,并构建DNA指纹图谱。研究结果表明,我们利用生物信息学方法挑选出的20条引物中有19条引物的扩增条带清晰且多态性好;在清晰稳定出现的354条带中,294条具有多态性;其中有3条引物的扩增条带可清楚区分绞股蓝与混淆品种乌蔹莓,可建立其DNA指纹图谱。按UPGMA法进行聚类分析,计算其遗传相似系数,结果显示,8份绞股蓝供试材料聚为两类,聚类结果与其地理区域远近和生长环境一致。本研究中筛选出的19条引物适用于绞股蓝遗传多样性分析,且获得的DNA指纹图谱可用于鉴别绞股蓝。 相似文献
7.
为了解竹黄地理居群间的遗传分化,本研究采用随机引物扩增多态性DNA分子标记技术对江苏、安徽和浙江3省的8个居群共32个竹黄样本进行了遗传多样性分析。从50个RAPD引物中筛选得到了5个随机引物,对供试材料的DNA进行扩增,共检测出77个位点,其中多态性位点52个,多态性位点比率为67.53%。UPGMA聚类分析结果表明,这8个居群分为三类：安吉居群、临安居群、宜兴居群、广德居群和泾县居群聚为一类;宁国居群和休宁居群聚为一类;淳安居群单独为一类。遗传多样性分析表明8个竹黄居群中,淳安居群的遗传多样性水平最高,安吉居群的遗传多样性水平最低。Nei＇s基因多样性指数和Shannon信息指数均表明竹黄物种水平的遗传多样性高于居群水平。 相似文献
8.
为了利用分子标记方法评价青钱柳种质资源的遗传多样性,本文对青钱柳DNA的提取、SRAP扩增体系重要参数进行了优化,运用优化体系筛选多态性引物,并用1对引物对青钱柳9个种源进行了遗传多样性初步分析。研究结果建立了适于青钱柳SRAP的扩增体系;从110对SRAP引物中筛选出了13对多态性引物,运用1对引物组合Me7＋Em2扩增获得21个多态性位点,多态率达100%。遗传多样性分析表明有效等位基因数（Ne）为1.3429,平均Shannon＇s信息指数（I）为0.3687,Nei＇s基因多样性指数（H）为0.2267,种源的遗传分化指数Gst为0.1983;聚类分析结果表明9个种源在遗传距离0.100处聚为3类,聚类结果和地理距离之间呈现较高的相关性。本文的研究结果表明所建立的青钱柳种质资源库具有广泛的遗传多样性,为进一步的开发利用提供了条件。 相似文献
9.
三个野生种群马氏珠母贝遗传多样性的RAPD分析 总被引：15，自引：0，他引：15
摘要：为了解野生种群马氏珠母贝（Pimctada martensii (Dunker.)）的遗传结构背景和开展遗传改良育种,运用RAPD技术分析了海南三亚（SW）、广东大亚湾（DW）和广西北海（BW）3个野生种群的遗传多样性。采用了18个10碱基的随机引物对3个野生种群进行分析,其中6个引物能扩增出清晰的多态带谱,扩增的DNA片段大小在含0.2~3.0 kb之间。SW、DW和BW 3个种群内的遗传相似性指数分别为0.642、0.672和0.688,Shannon多样性值分别为0.266、0.211和0.174。马氏珠母贝3个野生种群的遗传相似性依次为SW< DW < BW,而遗传多样性依次是SW > DW> BW。DW和SW相对遗传距离为0.104;DW和BW相对遗传距离为0.094;SW和BW相对遗传距离为0.212。讨论了马氏珠母贝野生种群遗传多样性差异的可能原因、种群间杂交子代的杂交优势预测及人工养殖对野生种群遗传结构的可能影响。 相似文献
10.
以尼里—拉菲奶水牛基因池为模板,从22条10 bp的随机引物中筛选出17条具有清晰多态条带的引物,从中选取5条,对尼里—拉菲奶水牛基因组DNA进行RAPD扩增,结果得到53条带,其中12条表现多态,多态频率23.85%;根据N e i氏公式计算品种内的遗传相似指数F的平均值为0.9500,遗传距离指数D的平均值为0.0500。 相似文献
11.
为了探讨野鸭的遗传多样性和与家鸭的亲缘关系,本研究利用短串联重复序列(short tandem repeat,STR)分型技术对绿头野鸭(Anas platyrhynchos)、西湖野鸭(A.platyrhynchos)、奉化野鸭(A.platyrhynchos)、斑嘴野鸭(A.poecilorhyncha)、针尾野鸭(A.acuta)和赤嘴潜鸭(Netta rufina)6个野鸭群体(共计269只),以及家鸭品种绍兴麻鸭(A.platyrhynchos domestic)60个个体在11个位点上的遗传多样性进行了检测.结果表明,在7个群体中共检测到了141个有效等位基因(effective number of alIeles,Ne),平均有效等位基因为12.821,期望杂合度(expected heterozygosity,He)为0.856,多态信息含量(polymorplism information content,PIC)为0.845.11个位点均为中高度多态位点,适用于鸭的遗传多样性分析.7个群体的遗传多样性丰富,PIC在0.310～0.960之间.F-统计量分析显示,所有位点的Fst在0.047～0.469之间,平均为0.171,表明群体间的遗传变异较大.Nei氏遗传距离分析及系统发育树显示,绿头野鸭、西湖野鸭、奉化野鸭和绍兴麻鸭遗传距离较近,与赤嘴潜鸭、斑嘴野鸭和针尾野鸭的遗传距离较远,同时这3个群体间的遗传距离也较远,并且赤嘴潜鸭单独聚为一类.此外,绍兴麻鸭与绿头野鸭遗传距离远小于其与斑嘴野鸭的遗传距离,提示绍兴麻鸭起源于绿头野鸭的可能性更大.本研究通过对6个野鸭品种的遗传多样性及与绍兴麻鸭的亲缘关系分析,进一步完善了野鸭与家鸭的遗传结构. 相似文献
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The present work was carried out to study genetic diversity among 17 populations of wild emmer wheat sampled from South-eastern Turkey, considered to be an important region for domestication of wheat. Eleven RFLP clones and 4 restriction enzymes combinations were used to probe the genomic DNA. A total of 151 polymorphic loci were obtained from the enzyme-probe combinations. The Genetic Distance (GD) values were from 0.019 (Gaziantep-3 and Sanliurfa-4) to 0.200 (Gaziantep-1 and K. Maras). Cluster analysis results showed that populations formed 2 clades within the dendrogram. Population Gaziantep-1 was unique and genetically most diverse from the remaining 16 populations. The results of average genetic distance (GD) among populations suggested that narrow genetic variability exist among 17 populations in the present study. 相似文献
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福鼎大白茶和云南大叶茶是茶树育种中的骨干亲本,利用这两个亲本选育了许多优良的品种（系）。本研究利用ISSR标记技术分析了40个福云（半）同胞系茶树品种（系）的遗传变异水平和亲缘关系。14个ISSR引物在供试品种（系）间共扩增出251条谱带,多态性条带的比率为96.4％。引物的PIC值平均为0.94,Rp值平均为29.35,表明引物扩增位点的高多态性和对品种的强辨别能力。40份供试品种（系）的基因多样性指数（H）为0.35,Shannon信息指数（I）为0.52。按母本来源和育种机构对供试品种（系）进行分组分析,结果表明不同品种（系）组间的遗传多样性水平比较接近,遗传变异主要存在于组内品种（系）的个体之间,不同组间基因交流明显。供试品种（系）间的相似系数介于0.52-0.75,根据相似系数矩阵按UPGMA法对40个供试品种（系）进行聚类分析,构建了不同品种（系）间的亲缘关系树状图。福鼎大白茶在树状图中形成单独的分支,在树状图的根基处,其它品种（系）根据遗传距离聚类成不同的类群。来源于同一育种单位的部分茶树品种（系）聚类在同一类群中,但未发现按母本来源区分的独立类群。总之,通过ISSR标记分析,可在基因组水平上进一步了解福云（半）同胞系茶树品种（系）间的遗传变异水平,并进一步明确其亲缘关系,为今后福云（半）同胞系在茶树育种上的有效利用提供依据。 相似文献
14.
Yong-Bi Fu Sarah Guerin Gregory W. Peterson John E. Carlson K.W. Richards 《Genetic Resources and Crop Evolution》2003,50(7):743-746
Effectiveness of several bulking strategies was empirically assessed in detecting RAPD variations and determining genetic relationships of five flax (Linum usitatissimum L.) landrace accessions. Bulking ten individuals before and after DNA isolations generated consistent RAPD variations. About 30% of the polymorphic RAPD loci observed in the plant-by-plant (PBP) sample were difficult to score and/or undetected in the bulked samples of the same accession. Heterogeneity among the six bulked samples of the same accession was observed at 5.6% of the loci scored. The frequency of a specific RAPD band present in those individuals used to form a bulk was at least 1/11 for its detection in the bulked sample. In spite of these limitations, bulking still generated compatible genetic relationships of the five accessions from its PBP sampling. 相似文献
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采用CTAB法对硬叶兜兰叶片总DNA进行提取,通过正交实验设计,用SRAP正向引物me1（5＇-TGAGTCCAAACCGGATA-3＇）和反向引物em2（5＇-ACACACACACACACACT-3＇）对反应体系进行优化;并应用其进行种群遗传差异分析。结果表明：优化的20μL的PCR反应体系中DNA模板为90 ng,Taq DNA聚合酶1.6 U,dNTPs 0.30 mmol/L,MgCl22.0 mmol/L和引物各0.50μmol/L,经重复电泳验证适合进行硬叶兜兰的SRAP分析;利用该体系对7个不同种源的167份硬叶兜兰进行SRAP-PCR扩增,对筛选的10个引物扩增,共得到288条条带,其中多样性条带234条,多态位点百分率（PPB）为81.25%;种群的遗传距离值在0.065 9～0.191 6,UPGMA聚类结果显示供试种群在遗传相似度为0.863时,可以分为2支,即第一分支由马固、斗咀和杨柳井居群组成,第二支由古林箐、夹寒箐、小坝子和田坝居群组成。SRAP标记可较好地适用于硬叶兜兰种群遗传差异的鉴定。 相似文献
17.
为进一步明确菊属野生种与栽培品种的遗传关系和多样性,本研究利用ISSR分子标记技术对菊属11个野生种和12个栽培品种之间的遗传关系进行比较分析。从75个ISSR引物中筛选出了14个引物,对供试材料的DNA进行扩增,共获得142条清晰可辨的谱带,多态位点比率为95.1%;菊属野生种的平均有效等位基因数（effective number of alleles,Ne）、平均Nei＇s基因多样性指数（Nei’s gene diversity,H）及Shannon信息指数（shannon’s information index,I）均高于栽培菊花,说明各野生种间基因差异比较显著,多态性强于栽培品种。UPGMA聚类结果表明：菊属野生种呈现由低倍向高倍进化的趋势;栽培菊花之间遗传关系复杂,大体可以推断出平瓣是菊花的基本瓣形;菊花脑与栽培菊花亲缘关系最近,小红菊、龙脑菊、若狭滨菊与栽培菊花关系亦较近,神农香菊与其它材料关系最远。本研究的结果表明菊属野生种与栽培品种之间遗传关系比较复杂,而ISSR分子标记技术可以较好地从分子水平上揭示出菊属植物间的遗传关系。 相似文献
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Randomly amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis was employed to assess genetic divergence among 29 neem accessions collected from two agro-ecological regions of India (11 agro-climatic sub-zones), which cover three states, Punjab, Haryana and Rajasthan. Out of 24, 10-mer random primers used for studying genetic divergence, 14 were polymorphic, generating a total of 73 amplification products with an average of 5.21 products per polymorphic primer and estimated gene diversity of 0.49. Genetic relationships among accessions were evaluated by generating a similarity matrix based on Jaccard’s coefficient, ranging from 0.70 to 0.96. The phenetic dendrogram generated by UPGMA analysis grouped accessions into five clusters. RAPD performed within accessions (individual seedlings collected from the same mother plant) showed no variation indicating homogeneous population within accessions. Primers OPA-18, OPC-08 and OPI-03 were found most informative based on their resolving power. The degree of genetic variation detected among the 29 accessions with RAPD analysis suggests that RAPD can be used for studying genetic diversity in neem. The study also demonstrated that neem germplasm collected from northwestern plains of India shows no eco-geographical isolation based on sub-zones because accessions collected from different sub-regions are grouping together in the genetic tree. 相似文献
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Genetic diversity within a range of cultivars and landraces of flax (Linum usitatissimum L.) as revealed by RAPDs 总被引：1，自引：0，他引：1
Yong-Bi Fu Axel Diederichsen K.W. Richards Gregory Peterson 《Genetic Resources and Crop Evolution》2002,49(2):167-174
Analysis of the extent and distribution of genetic diversity incrop plants is essential for optimizing sampling and breedingstrategies. We used random amplified polymorphic DNA (RAPD)markers to assess genetic diversity and relationships in 22 Canadiancultivars, 29 selected world cultivars and 10 landraces of flax(Linum usitatissimum L.). RAPDvariation was generally low and more variation was detected among,than within, the investigated flax accessions. Based on 53 variableRAPD loci observed for the 61 accessions, the landraces had a lowerproportion of fixed recessive RAPD loci (0.427) (i.e.,more genetic variation) than all of the flax cultivars examined(0.492). The linseed cultivars had a lower proportion ofrecessive loci (0.469) than the fiber flax cultivars(0.529). Canadian linseed cultivars had a lower proportionof recessive loci (0.465) than the selected world flaxcultivars (0.512). A trend was also observed that the rateof loss in genetic variation in Canadian flax breeding programs overthe last fifty years was approximately two variable loci per 100 lociper 10 years. Clustering analyses based on similarity estimatesshowed that the fiber cultivars were more related (or similar toeach other) and were classified as a homogeneous group. All ofthe linseed cultivars were clustered in diverse groups with the ninelandrace accessions. Implications of these findings for flax breedingand germplasm management are discussed. 相似文献
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红掌是极具观赏性和商业开发价值的盆栽植物和切花花卉,品种改良是推动其产业持续发展的根本。周期较长、生殖障碍、遗传基础不明晰等限制了红掌常规育种的发展,而基因工程具有高效、定向、打破种属隔离的优势,在红掌育种中有着广阔的应用前景。二十年来,红掌基因工程研究取得了巨大进展,本文回顾了该领域技术体系的发展历程,综述了转基因在红掌抗病害、虫害、低温等胁迫及花色、花期等多个性状改良中的应用研究现状,并对存在的问题和发展前景予以评析,为加快具有我国自主产权的红掌新品种选育提供参考。 相似文献